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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

LXL04_036762
当前版本: OH-1004 染色体: Chr08 坐标: 48026971-48032444 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1773 bp · LXL04_036762|LXL04_036762|OH1004|cDNA

ATGGTCGAAGTGATCggagagaaccatccagacaaCACGTCGGAAGGGATTGAAGTTGGATTAAAAGCCATTGCCACGGCGGTGGACAAATCGCCTGACAATGGAGATGCAATTACCACCGTAACTGGCTCAAGTGGATCATTACAAGTCGGTGACCACGGTGGATCGTCGGAAAACAGCAGTCGCTCCGACAAAAACGAAGATTCAGGATCAGGATCAGGATTGTCTAGCGACGACGATGGCATTTCAGATATTTTGAA...

1773 bp · LXL04_036762|LXL04_036762|OH1004|CDS

ATGGTCGAAGTGATCGGAGAGAACCATCCAGACAACACGTCGGAAGGGATTGAAGTTGGATTAAAAGCCATTGCCACGGCGGTGGACAAATCGCCTGACAATGGAGATGCAATTACCACCGTAACTGGCTCAAGTGGATCATTACAAGTCGGTGACCACGGTGGATCGTCGGAAAACAGCAGTCGCTCCGACAAAAACGAAGATTCAGGATCAGGATCAGGATTGTCTAGCGACGACGATGGCATTTCAGATATTTTGAA...

590 aa · LXL04_036762|LXL04_036762|OH1004|PROTEIN

MVEVIGENHPDNTSEGIEVGLKAIATAVDKSPDNGDAITTVTGSSGSLQVGDHGGSSENSSRSDKNEDSGSGSGLSSDDDGISDILKFDGNTYKKDEPTTSHVDAGESSGASGKVVEEEIVELEFEKVKPKLATHSMHCPNCKAEVTKVVLRRKVITFRPAEPAVVPVEAPPRDPEDLVGCLSCLSLFTCSGNGCFNPFDIFRKKPERSNVLPPQATVDGMTPVVTENESCLSMFLVFKKKQKMTEPIDPPQVHNDRDFV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_036762
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_036762
位置Chr08:48026971-48032444 (-)
描述Similar to MEBL: Membrane protein of ER body-like protein
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g27870 对包括PYK10在内的ER体成分的积累不是必需的。 暂无已核实直接文献
At4g27860 可能将过量的细胞质铁和锰隔离到内质网中,以降低金属离子毒性。
At5g24290 可能将过量的细胞质铁和锰隔离到内质网中,以降低金属离子毒性。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_036762 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0010039 response to iron ion 生物过程
GO:0030026 intracellular manganese ion homeostasis 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009705 plant-type vacuole membrane 细胞组分
GO:0010168 ER body 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G27860
ath:AT4G27870
ath:AT5G24290
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞膜0.783
排名 1 · LXL04_036762 · OH-1004
内质网0.132
排名 2 · LXL04_036762 · OH-1004
细胞质0.086
排名 3 · LXL04_036762 · OH-1004
细胞核0.065
排名 4 · LXL04_036762 · OH-1004
溶酶体/液泡0.051
排名 5 · LXL04_036762 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8LPT3拟南芥Membrane protein of ER body-like protein43.612%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q8W4P8拟南芥Membrane protein of ER body 142.289%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
F4KFS7拟南芥Membrane protein of ER body 240.306%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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