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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_030018
当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 105829685-105830029 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

345 bp · LXL04_030018|LXL04_030018|OH1004|cDNA

TTAGCATATTCGATGGAGGTGAATGAGAAATGTGATGTCTATAGTTTTGGGATTGTGACGCTTGAGGTGATAATGGGAGAGCATCCAAGAGATTTGACTATGTCCAAGTTAAGTGTTGAAGAGTTACGGACACACGTTGTTCTTGACCAACGACTCAACGTGCCTATGGGTCAAGTTGCGGAAGTAGTGAACCAAATTGTAGAGCTTGCTTTTGCATGTTTAAACATCAACCCTCGCTCTCGGCCATTGATGCTACATGT...

CDS

下载 CDS FASTA

333 bp · LXL04_030018|LXL04_030018|OH1004|CDS

ATGGAGGTGAATGAGAAATGTGATGTCTATAGTTTTGGGATTGTGACGCTTGAGGTGATAATGGGAGAGCATCCAAGAGATTTGACTATGTCCAAGTTAAGTGTTGAAGAGTTACGGACACACGTTGTTCTTGACCAACGACTCAACGTGCCTATGGGTCAAGTTGCGGAAGTAGTGAACCAAATTGTAGAGCTTGCTTTTGCATGTTTAAACATCAACCCTCGCTCTCGGCCATTGATGCTACATGTTTCAAAAAAATT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

110 aa · LXL04_030018|LXL04_030018|OH1004|PROTEIN

MEVNEKCDVYSFGIVTLEVIMGEHPRDLTMSKLSVEELRTHVVLDQRLNVPMGQVAEVVNQIVELAFACLNINPRSRPLMLHVSKKLSTIIPSVTRQLKKQESTSSCQKQ

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_030018
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_030018
位置Chr06:105829685-105830029 (-)
描述暂无功能描述
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g35710 可能的富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At1g35710。 暂无已核实直接文献
At4g08850 作为十字花科植物SCOOP肽的受体，调节包括植物生长、发育和应激反应在内的多种过程。
A receptor heteromer mediates the male perception of female attractants in plants.2016 · DOI: 10.1038/nature16975
Perception of a divergent family of phytocytokines by the Arabidopsis receptor kinase MIK2.2021 · DOI: 10.1038/s41467-021-20932-y
The Arabidopsis MIK2 receptor elicits immunity by sensing a conserved signature from phytocytokines and microbes.2021 · DOI: 10.1038/s41467-021-25580-w
The MIK2/SCOOP Signaling System Contributes to Arabidopsis Resistance Against Herbivory by Modulating Jasmonate and Indole Glucosinolate Biosynthesis.2022 · DOI: 10.3389/fpls.2022.852808
At5g48940 与RGI1、RGI3、RGI4和RGI5一起，作为RGF肽（例如 RGF1、GLV5/CLEL1/RGF2、GLV7/CLEL3/RGF3、GLV3/RGF4、GLV10/CLEL7/RGF5 和 RGF10/CLELN）的受体，这些肽激素通过调控转录因子PLETHORA（PLT，例如PLT1和PLT2）的表达水平和模式，维持胚后根干细胞利基。
RGF1 INSENSITIVE 1 to 5, a group of LRR receptor-like kinases, are essential for the perception of root meristem growth factor 1 in Arabidopsis thaliana.2016 · DOI: 10.1038/cr.2016.63
At1g78530 类受体丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g78530。 暂无已核实直接文献
At5g62230 受体激酶，与 ER 和 ERL2 一起调节花序结构和器官形状以及气孔图案，包括密度和聚类。
Synergistic interaction of three ERECTA-family receptor-like kinases controls Arabidopsis organ growth and flower development by promoting cell proliferation.2004 · DOI: 10.1242/dev.01028
Haploinsufficiency after successive loss of signaling reveals a role for ERECTA-family genes in Arabidopsis ovule development.2007 · DOI: 10.1242/dev.004788
Direct interaction of ligand-receptor pairs specifying stomatal patterning.2012 · DOI: 10.1101/gad.179895.111
Regulation of plant vascular stem cells by endodermis-derived EPFL-family peptide hormones and phloem-expressed ERECTA-family receptor kinases.2013 · DOI: 10.1093/jxb/ert196
A receptor-like protein acts as a specificity switch for the regulation of stomatal development.2017 · DOI: 10.1101/gad.297580.117

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030018 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002213 defense response to insect 生物过程
GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009553 embryo sac development 生物过程
GO:0009695 jasmonic acid biosynthetic process 生物过程
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009759 indole glucosinolate biosynthetic process 生物过程
GO:0010074 maintenance of meristem identity 生物过程
GO:0010078 maintenance of root meristem identity 生物过程
GO:0010082 regulation of root meristem growth 生物过程
GO:0010103 stomatal complex morphogenesis 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G35710
ath:AT1G78530
ath:AT4G08850
ath:AT5G48940
ath:AT5G62230
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.562
排名 1 · LXL04_030018 · OH-1004
细胞质0.335
排名 2 · LXL04_030018 · OH-1004
细胞核0.221
排名 3 · LXL04_030018 · OH-1004
内质网0.054
排名 4 · LXL04_030018 · OH-1004
高尔基体0.045
排名 5 · LXL04_030018 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr2-87 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_030018PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr2871.5e-0731.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LP24拟南芥Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g3571046.667%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q8VZG8拟南芥MDIS1-interacting receptor like kinase 246.739%Swiss-Prot中等数据库同源证据
C0LGV1拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RGI234.783%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9SYM9拟南芥Receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g7853037.895%Swiss-Prot中等数据库同源证据
C0LGW6拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase ERL131.897%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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