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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_014306
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 45803286-45807141 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3774 bp · LXL04_014306|LXL04_014306|OH1004|cDNA

ATGGCGAAACAGGTGTTGCGATTTCTTACTCTGTTTTTTGTTGGTTTTTTTCTGTTTGGGTATGTGGAGTCTGGGAATACAGATACTGCTACGACTTTTAAAATTCTTCTTGAGGTTAAGCGATCGATCACTGAAGACCCACAAAATGTTCTGAAAAGTTGGTCGGAGAAAAACCAGAGTTTCTGTGACTGGTATGGTGTTACTTGTGCCGGAAACTTTTCTCAGGTGGTGGGTCTCAACCTCTCCAGTTCTTCGTTGGG...

CDS

下载 CDS FASTA

3774 bp · LXL04_014306|LXL04_014306|OH1004|CDS

ATGGCGAAACAGGTGTTGCGATTTCTTACTCTGTTTTTTGTTGGTTTTTTTCTGTTTGGGTATGTGGAGTCTGGGAATACAGATACTGCTACGACTTTTAAAATTCTTCTTGAGGTTAAGCGATCGATCACTGAAGACCCACAAAATGTTCTGAAAAGTTGGTCGGAGAAAAACCAGAGTTTCTGTGACTGGTATGGTGTTACTTGTGCCGGAAACTTTTCTCAGGTGGTGGGTCTCAACCTCTCCAGTTCTTCGTTGGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1257 aa · LXL04_014306|LXL04_014306|OH1004|PROTEIN

MAKQVLRFLTLFFVGFFLFGYVESGNTDTATTFKILLEVKRSITEDPQNVLKSWSEKNQSFCDWYGVTCAGNFSQVVGLNLSSSSLGGGISPSISLLQNLLHLDLSSNQLTGPIPPNISALTSLSSLLLFSNQLTGHIPAELGSLSSLVMLRIGDNGLTGPIPSSLGGLQNLRVLGLASCYLSGQIPPELGKLKSLENLVIQENELEGPIPPEVGNCSSLLAFTAAVNHLNGSIPDELCDLKKLQTLNLANNSLSGEIPR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_014306
TK1151 IDTkA02G440390
OH-1004 IDLXL04_014306
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)86.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 68.276 / OH-1004 7.717
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_014306
位置Chr03:45803286-45807141 (+)
描述Similar to GSO1: LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g20140 与GSO2共同参与胚胎和子叶表皮表面发育所需的受体样丝氨酸／苏氨酸激酶。
GASSHO1 and GASSHO2 encoding a putative leucine-rich repeat transmembrane-type receptor kinase are essential for the normal development of the epidermal surface in Arabidopsis embryos.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03395.x
The receptor-like kinases GSO1 and GSO2 together regulate root growth in Arabidopsis through control of cell division and cell fate specification.2014 · DOI: 10.1002/dvdy.24066
A peptide hormone required for Casparian strip diffusion barrier formation in Arabidopsis roots.2017 · DOI: 10.1126/science.aai9057
At5g44700 与 GSO1 一起，是在胚胎和子叶表皮表面发育过程中所需的受体样丝氨酸/苏氨酸激酶。
GASSHO1 and GASSHO2 encoding a putative leucine-rich repeat transmembrane-type receptor kinase are essential for the normal development of the epidermal surface in Arabidopsis embryos.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03395.x
The receptor-like kinases GSO1 and GSO2 together regulate root growth in Arabidopsis through control of cell division and cell fate specification.2014 · DOI: 10.1002/dvdy.24066
A peptide hormone required for Casparian strip diffusion barrier formation in Arabidopsis roots.2017 · DOI: 10.1126/science.aai9057
At5g63930 可能是富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At5g63930。 暂无已核实直接文献
At1g17230 富含亮氨酸重复序列的受体样丝/苏氨酸蛋白激酶 At1g17230。 暂无已核实直接文献
At2g33170 推测的富含亮氨酸重复序列的受体样蛋白激酶At2g33170。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014306 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009553 embryo sac development 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0042659 regulation of cell fate specification 生物过程
GO:0045184 establishment of protein localization 生物过程
GO:0051302 regulation of cell division 生物过程
GO:0055075 potassium ion homeostasis 生物过程
GO:0090708 specification of plant organ axis polarity 生物过程
GO:0160073 Casparian strip assembly 生物过程
GO:2000067 regulation of root morphogenesis 生物过程
GO:2000280 regulation of root development 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G20140
ath:AT5G44700
ath:AT5G63930
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.875
排名 1 · LXL04_014306 · OH-1004
内质网0.083
排名 2 · LXL04_014306 · OH-1004
细胞质0.057
排名 3 · LXL04_014306 · OH-1004
细胞核0.037
排名 4 · LXL04_014306 · OH-1004
溶酶体／液泡0.025
排名 5 · LXL04_014306 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263.18LRRNT_235-69 aa
PF23598.2LRR_1489-177 aa
PF23598.2LRR_14165-251 aa
PF23598.2LRR_14235-322 aa
PF13855.13LRR_8240-278 aa
PF24141.2LRR_ComC240-336 aa
PF12799.14LRR_4242-280 aa
PF13855.13LRR_8267-326 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_014306PF08263.18LRRNT_235691.4e-0835.6
LXL04_014306PF23598.2LRR_14891772.2e-47162.3
LXL04_014306PF23598.2LRR_141652512.2e-47162.3
LXL04_014306PF23598.2LRR_142353222.2e-47162.3
LXL04_014306PF13855.13LRR_82402781.3e-56188.9
LXL04_014306PF24141.2LRR_ComC2403361.6e-1558.3
LXL04_014306PF12799.14LRR_42422801.3e-47159.5
LXL04_014306PF13855.13LRR_82673261.3e-56188.9
LXL04_014306PF23598.2LRR_143454412.2e-47162.3
LXL04_014306PF13855.13LRR_83804241.3e-56188.9
LXL04_014306PF12799.14LRR_43894231.3e-47159.5
LXL04_014306PF23598.2LRR_144565662.2e-47162.3
LXL04_014306PF13855.13LRR_85105681.3e-56188.9
LXL04_014306PF23598.2LRR_146167072.2e-47162.3
LXL04_014306PF12799.14LRR_46296641.3e-47159.5
LXL04_014306PF13855.13LRR_86486871.3e-56188.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGQ5拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO161.664%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9FIZ3拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO257.257%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9LVP0拟南芥Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g6393039.197%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9SHI2拟南芥Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g1723037.066%Swiss-Prot中等数据库同源证据
O49318拟南芥Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At2g3317038.275%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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