基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_001581
当前版本: OH-1004
染色体: Chr01
坐标: 29386886-29388025
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1140 bp · LXL04_001581|LXL04_001581|OH1004|cDNA
ATGACCACCATCTTTCTATTCCTCTACCTCCTCCTCATatccaccgccaccgccactgccaccACCCTCTATTCCGATGTCTCCGCCCTCAAAGCCATAAAGGCCGCCATCGATCCCACCACCATCCCTTCTTACTCTTGCTTAGCCTCCTGGAATTTCACCTCCGATCCTTGCTCCAACCATCACGTCACTCACTTCCTCTGTGGCCTCTCCTGCTCCGGCAACCGAGTCACCCAACTCACCTTCGATCGCGCAGGTTA...
CDS
下载 CDS FASTA1140 bp · LXL04_001581|LXL04_001581|OH1004|CDS
ATGACCACCATCTTTCTATTCCTCTACCTCCTCCTCATATCCACCGCCACCGCCACTGCCACCACCCTCTATTCCGATGTCTCCGCCCTCAAAGCCATAAAGGCCGCCATCGATCCCACCACCATCCCTTCTTACTCTTGCTTAGCCTCCTGGAATTTCACCTCCGATCCTTGCTCCAACCATCACGTCACTCACTTCCTCTGTGGCCTCTCCTGCTCCGGCAACCGAGTCACCCAACTCACCTTCGATCGCGCAGGTTA...
379 aa · LXL04_001581|LXL04_001581|OH1004|PROTEIN
MTTIFLFLYLLLISTATATATTLYSDVSALKAIKAAIDPTTIPSYSCLASWNFTSDPCSNHHVTHFLCGLSCSGNRVTQLTFDRAGYVGTLSPLVSKLTQLITIDISDNKLSGPIPASLFSLPNLQTLNLRSNSFSGTIPPAISNLKSIQAIEISHNSLSGSLPDTLSLLTLTRLDLSFNKFTGPIPKLPKTLIELAVKSNSLSGYLPKTSFNGLTQLEVVELSDNSLTGTIPGWFLLQQSLQQVNLANNGFTGIEISKP...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_001581 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_001581 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr01:29386886-29388025 (-) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to GSO1: LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO1 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0009611 response to wounding 生物过程 GO:0042659 regulation of cell fate specification 生物过程 GO:0045184 establishment of protein localization 生物过程 GO:0051302 regulation of cell division 生物过程 GO:0055075 potassium ion homeostasis 生物过程 GO:0090708 specification of plant organ axis polarity 生物过程 GO:0160073 Casparian strip assembly 生物过程 GO:2000067 regulation of root morphogenesis 生物过程 GO:2000280 regulation of root development 生物过程 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0048226 Casparian strip 细胞组分 GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT4G20140 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞外0.368
细胞膜0.328
内质网0.129
细胞质0.074
细胞核0.035
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF13855.13LRR_897-134 aaPF00560.40LRR_1124-146 aaPF13855.13LRR_8193-251 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_001581 | PF13855.13 | LRR_8 | 97 | 134 | 1.3e-22 | 80.0 |
| LXL04_001581 | PF00560.40 | LRR_1 | 124 | 146 | 2e-26 | 87.0 |
| LXL04_001581 | PF13855.13 | LRR_8 | 193 | 251 | 1.3e-22 | 80.0 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
C0LGQ5 | 拟南芥 | LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO1 | 35.357% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9SCT4 | 拟南芥 | Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase IMK2 | 32.278% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
G9LZD7 | 水稻 | Probable inactive leucine-rich repeat receptor kinase XIAO | 34.106% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q8RZV7 | 水稻 | Leucine-rich repeat receptor protein kinase MSP1 | 28.821% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q8GT95 | 水稻 | Polygalacturonase inhibitor 1 | 33.101% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |