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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG094510
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 26705502-26711599 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4793 bp · TkAUNG094510|TK1151|cDNA

CTCGTTCAACGAGCTAACGACGCCGTATTCAACGAGTTCTGACTTAGCGGGTGACTATCGTTTACGCACACTGCAAAACGTTAAAACAAAATTCGACCGTCTTCCACGCCAGATCAACAACGAGAAACCCCCCCAAATTTCCATCCTTTTCGAGATCATATGCTTCAAATCCAATTCAACTACAGTCGCATTCCTTTCTAATTCAAAGAAATGGAAGAGGATAATTATTTGGAGCAGGTGACGGGGAGTCCAACAGCTGG...

CDS

下载 CDS FASTA

3837 bp · TkAUNG094510|TK1151|CDS

ATGGAAGAGGATAATTATTTGGAGCAGGTGACGGGGAGTCCAACAGCTGGGGAGAATGGATTTGTTCATATTGAGTCAGTTGATTCTGCTCAAATGGAAGGTGGTTCAATTGATCAGGTTGAGCGTCTGGAGCAGGATGATGGGGTAGTGGTAACAGGAGTGGATGCTGTACAGGATGAGCAGCTTTCTGTAAGAACAGCTGATGATGTGGCACCTGATGAGTTTGTAGATTGCCCAGATGACTTGCTTTCTAATGAAGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1278 aa · TkAUNG094510|TK1151|PROTEIN

MEEDNYLEQVTGSPTAGENGFVHIESVDSAQMEGGSIDQVERLEQDDGVVVTGVDAVQDEQLSVRTADDVAPDEFVDCPDDLLSNEGRSPGIPNRPHQLPFGRATEDTQHTEPQIEREILPQEIQEEKGDLIKEVSNLHHLLKSLSKQQTLTDVVDGGEKSLEEMVNECSNFIEISLNEQSHAEATISELNATLHMKDKEIEDLMVRVNVNDQSLSQDIALKSNELASVEAIVDRILYSLTPAFGDSGLSDSSVSEKLSH...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG094510
TK1151 IDTkAUNG094510
OH-1004 IDLXL04_020715
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)93.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 9.155 / OH-1004 39.933
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG094510
位置ChrUn:26705502-26711599 (-)
描述Protein of unknown function
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g24460 束缚因子参与反式高尔基体网络 的囊泡融合，因此是有效地将蛋白质运输到液泡所必需的。
TNO1 is involved in salt tolerance and vacuolar trafficking in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1104/pp.110.168963
TNO1, a TGN-localized SNARE-interacting protein, modulates root skewing in Arabidopsis thaliana.2017 · DOI: 10.1186/s12870-017-1024-4

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_020715 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006623 protein targeting to vacuole 生物过程
GO:0006886 intracellular protein transport 生物过程
GO:0006906 vesicle fusion 生物过程
GO:0007034 vacuolar transport 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0010015 root morphogenesis 生物过程
GO:0010031 circumnutation 生物过程
GO:0010053 root epidermal cell differentiation 生物过程
GO:0010226 response to lithium ion 生物过程
GO:0010555 response to mannitol 生物过程
GO:0022604 regulation of cell morphogenesis 生物过程
GO:0035864 response to potassium ion 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G24460
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.594
排名 1 · TkAUNG094510 · TK1151
高尔基体0.250
排名 2 · TkAUNG094510 · TK1151
细胞核0.204
排名 3 · TkAUNG094510 · TK1151
内质网0.106
排名 4 · TkAUNG094510 · TK1151
细胞膜0.055
排名 5 · TkAUNG094510 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF30378CEP135_TSGA10_CC118-216 aa
PF24161CCDC39122-202 aa
PF06818Fez1125-208 aa
PF23649FKBP15126-144 aa
PF00261Tropomyosin133-224 aa
PF19220Rod_CreS149-219 aa
PF06818Fez1255-370 aa
PF19220Rod_CreS300-425 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG094510PF30378CEP135_TSGA10_CC1182160.001917.3
TkAUNG094510PF24161CCDC391222020.001617.1
TkAUNG094510PF06818Fez11252080.3512.0
TkAUNG094510PF23649FKBP151261440.0002221.7
TkAUNG094510PF00261Tropomyosin1332240.008216.3
TkAUNG094510PF19220Rod_CreS1492190.005716.6
TkAUNG094510PF06818Fez12553700.3512.0
TkAUNG094510PF19220Rod_CreS3004250.005716.6
TkAUNG094510PF23649FKBP153044150.0002221.7
TkAUNG094510PF00261Tropomyosin3054260.008216.3
TkAUNG094510PF24161CCDC393074270.001617.1
TkAUNG094510PF30378CEP135_TSGA10_CC3074280.001917.3
TkAUNG094510PF06818Fez13855470.3512.0
TkAUNG094510PF19220Rod_CreS5095890.005716.6
TkAUNG094510PF00261Tropomyosin5406070.008216.3
TkAUNG094510PF28882DUF84735545770.03114.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4I9A2拟南芥sp|F4I9A2|TNO1_ARATH Trans-Golgi network-localized SYP41-interacting protein 132.900%Swiss-Prot中等置信

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