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基因概览

TkAUNG091890

当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 26020971-26021853 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

533 bp · TkAUNG091890|TK1151|cDNA

GAGCCTTTCTTTTATGGGCATGACAACCAGGACCAGCTTGTCAAAATTGCTAGGGTGCTTGGGACTGATGAATTAAATGCATATTTGAACAAGTATCAGCTAGAACTTGAACCTCAACTTGAAGCTCTTGTTGGAAGGCATAGCAGGAAACCATGGTCAAAATTCATGAATGCAGATAATCAGCATTTAGTATCTCCAGAGGCCATTGACTTTCTGGATAAACTTCTTCGCTATGACCATCAGGATAGGCTCACAGCAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

330 bp · TkAUNG091890|TK1151|CDS

GAGCCTTTCTTTTATGGGCATGACAACCAGGACCAGCTTGTCAAAATTGCTAGGGTGCTTGGGACTGATGAATTAAATGCATATTTGAACAAGTATCAGCTAGAACTTGAACCTCAACTTGAAGCTCTTGTTGGAAGGCATAGCAGGAAACCATGGTCAAAATTCATGAATGCAGATAATCAGCATTTAGTATCTCCAGAGGCCATTGACTTTCTGGATAAACTTCTTCGCTATGACCATCAGGATAGGCTCACAGCAAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

109 aa · TkAUNG091890|TK1151|PROTEIN

EPFFYGHDNQDQLVKIARVLGTDELNAYLNKYQLELEPQLEALVGRHSRKPWSKFMNADNQHLVSPEAIDFLDKLLRYDHQDRLTAKEAMGHPYFMQVRAAENSRMRTQ

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkAUNG091890`
TK1151 ID	TkAUNG091890
OH-1004 ID	LXL04_013611
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	77.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 98.165 / OH-1004 24.099 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkAUNG091890

位置 ChrUn:26020971-26021853 (-)

描述 Similar to CKA4: Casein kinase II subunit alpha-4, chloroplastic

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g67380`	酪蛋白激酶在操作上通过其优先利用酸性蛋白（例如酪蛋白）作为底物来定义。	Cloning and characterization of two cDNAs encoding casein kinase II catalytic subunits in Arabidopsis thaliana.1993 · DOI: 10.1007/bf00019944 Reconstitution of Arabidopsis casein kinase II from recombinant subunits and phosphorylation of transcription factor GBF1.1995 · DOI: 10.1105/tpc.7.1.105
`At3g50000`	酪蛋白激酶通过优先利用酸性蛋白如酪蛋白作为底物来操作定义（通过相似性）。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`UniProt: Q9AR27`	酪蛋白激酶在操作上通过其优先利用酸性蛋白（例如酪蛋白）作为底物来定义。	暂无已核实直接文献
`UniProt: B6F107`	酪蛋白激酶在操作上通过其优先利用酸性蛋白（例如酪蛋白）作为底物来定义。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013611 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006281 DNA repair 生物过程

GO:0006325 chromatin organization 生物过程

GO:0006974 DNA damage response 生物过程

GO:0007623 circadian rhythm 生物过程

GO:0009648 photoperiodism 生物过程

GO:0009908 flower development 生物过程

GO:0010019 chloroplast-nucleus signaling pathway 生物过程

GO:0010187 negative regulation of seed germination 生物过程

GO:0010225 response to UV-C 生物过程

GO:0010229 inflorescence development 生物过程

GO:0010332 response to gamma radiation 生物过程

GO:0040008 regulation of growth 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G23070

ath:AT5G67380

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.574

排名 1 · TkAUNG091890 · TK1151

细胞核0.538

排名 2 · TkAUNG091890 · TK1151

细胞膜0.067

排名 3 · TkAUNG091890 · TK1151

线粒体0.056

排名 4 · TkAUNG091890 · TK1151

内质网0.044

排名 5 · TkAUNG091890 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase42-95 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkAUNG091890	`PF00069`	Pkinase	42	95	3.3e-07	30.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q08467`	拟南芥	sp\|Q08467\|CSK21_ARATH Casein kinase II subunit alpha-1	92.700%	Swiss-Prot	高置信
`Q08466`	拟南芥	sp\|Q08466\|CSK22_ARATH Casein kinase II subunit alpha-2	91.700%	Swiss-Prot	高置信
`Q9AR27`	水稻	sp\|Q9AR27\|HD6_ORYSI Casein kinase II subunit alpha-2	87.200%	Swiss-Prot	高置信
`B6F107`	水稻	sp\|B6F107\|HD6_ORYSJ Casein kinase II subunit alpha-2	87.200%	Swiss-Prot	高置信

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