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基因概览

TkAUNG084080

当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 23930793-23931188 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

396 bp · TkAUNG084080|TK1151|cDNA

ATGGTTTTACCTCCATCTTCAACGAAGAGGAATAGAATGATAATGGGTTCACAGGGTTACATCGATCCACAGTATCTGAAAACGGGATTAGTTTCGAAGAAGAACGATATATACAGCTACGGAATTGTTCTTCTGGAACTTGTTACAGGAAGGGAAGCGTTTTGTGTGGAGAGGAGGGAGATGTTGTCGGAGATTATTGGTCCGGTGGTGAGAGGGGTGGTGAGAGTGGCGGAGGTGATGGATCCACGGTTGCGAGGGTT...

CDS

下载 CDS FASTA

396 bp · TkAUNG084080|TK1151|CDS

ATGGTTTTACCTCCATCTTCAACGAAGAGGAATAGAATGATAATGGGTTCACAGGGTTACATCGATCCACAGTATCTGAAAACGGGATTAGTTTCGAAGAAGAACGATATATACAGCTACGGAATTGTTCTTCTGGAACTTGTTACAGGAAGGGAAGCGTTTTGTGTGGAGAGGAGGGAGATGTTGTCGGAGATTATTGGTCCGGTGGTGAGAGGGGTGGTGAGAGTGGCGGAGGTGATGGATCCACGGTTGCGAGGGTT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

131 aa · TkAUNG084080|TK1151|PROTEIN

MVLPPSSTKRNRMIMGSQGYIDPQYLKTGLVSKKNDIYSYGIVLLELVTGREAFCVERREMLSEIIGPVVRGVVRVAEVMDPRLRGLADMKEVEAMVSMAVMCIGSSPMDRPCSNEIIASMRVSFESISHL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkAUNG084080`
TK1151 ID	TkAUNG084080
OH-1004 ID	LXL04_026078
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	37.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 88.550 / OH-1004 28.401 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkAUNG084080

位置 ChrUn:23930793-23931188 (+)

描述 Similar to PBL15: Probable serine/threonine-protein kinase PBL15

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g10390`	可能的受体样蛋白激酶At4g10390。	暂无已核实直接文献
`At1g33260`	可能的类似受体的蛋白激酶 At1g33260。	暂无已核实直接文献
`At1g61590`	可能参与植物防御信号传导。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os04g0457800`	LRR 受体激酶参与体细胞胚胎发生的正向调节和对稻瘟病菌病原体 Magnaporthe oryzae 的防御反应。	Rice SERK1 gene positively regulates somatic embryogenesis of cultured cell and host defense response against fungal infection.2005 · DOI: 10.1007/s00425-005-1534-4 An XA21-associated kinase (OsSERK2) regulates immunity mediated by the XA21 and XA3 immune receptors.2014 · DOI: 10.1093/mp/ssu003

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026078 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0002238 response to molecule of fungal origin 生物过程

GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0012501 programmed cell death 生物过程

GO:0032491 detection of molecule of fungal origin 生物过程

GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程

GO:0050832 defense response to fungus 生物过程

GO:0062207 regulation of pattern recognition receptor signaling pathway 生物过程

GO:1901141 regulation of lignin biosynthetic process 生物过程

GO:1903428 positive regulation of reactive oxygen species biosynthetic process 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G61590

ath:AT2G05940

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.416

排名 1 · TkAUNG084080 · TK1151

细胞膜0.406

排名 2 · TkAUNG084080 · TK1151

细胞核0.301

排名 3 · TkAUNG084080 · TK1151

内质网0.053

排名 4 · TkAUNG084080 · TK1151

高尔基体0.043

排名 5 · TkAUNG084080 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase10-118 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr20-117 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkAUNG084080	`PF00069`	Pkinase	10	118	1.9e-07	31.5
TkAUNG084080	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	20	117	0.0003	20.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SV83`	拟南芥	sp\|Q9SV83\|Y4103_ARATH Probable receptor-like protein kinase At4g10390	40.600%	Swiss-Prot	中等置信
`P0DKI6`	拟南芥	sp\|P0DKI6\|Y1332_ARATH Probable receptor-like protein kinase At1g33260	36.500%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9SY91`	拟南芥	sp\|Q9SY91\|PBL15_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL15	37.500%	Swiss-Prot	中等置信
`Q7XV05`	水稻	sp\|Q7XV05\|SERK2_ORYSJ LRR receptor kinase SERK2	37.600%	Swiss-Prot	中等置信

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