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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG083920
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 23867405-23868568 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1098 bp · TkAUNG083920|TK1151|cDNA

ATGCCAGACAAAAATAATGTTTTTCATGTTGTTTCATTGTCATTTGGTGCGTTATCAGATGACACTGCTTTTCCTACCTGTGATCCGACCCGATCCTACATTTCACCTTCCATCACGAAACTTCCACATATCCGAACCTTGTTTTTTTATCGGTGTTTCACTGATAAGCCGCAACCCATTCCGTCTTTTTTGGGCCTATTGGGCCCTACTTTACAAACTCTTGTCTTAAGGGAAAATGGACATGTGGGCCCAATTCCTAC...

CDS

下载 CDS FASTA

1098 bp · TkAUNG083920|TK1151|CDS

ATGCCAGACAAAAATAATGTTTTTCATGTTGTTTCATTGTCATTTGGTGCGTTATCAGATGACACTGCTTTTCCTACCTGTGATCCGACCCGATCCTACATTTCACCTTCCATCACGAAACTTCCACATATCCGAACCTTGTTTTTTTATCGGTGTTTCACTGATAAGCCGCAACCCATTCCGTCTTTTTTGGGCCTATTGGGCCCTACTTTACAAACTCTTGTCTTAAGGGAAAATGGACATGTGGGCCCAATTCCTAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

365 aa · TkAUNG083920|TK1151|PROTEIN

MPDKNNVFHVVSLSFGALSDDTAFPTCDPTRSYISPSITKLPHIRTLFFYRCFTDKPQPIPSFLGLLGPTLQTLVLRENGHVGPIPTQLGNLTGLRVLDLHKNNLNGSIPASFSRFTELTILDLNQNHLTGSIPTAIGNCDSLMKIDLSRNRLSGQIPDSISGLTSLILMDLSYNSLSGPIPTSLQNLDSLQALILNGNPISSIIPSTAFDKFKSLMILILSDTDSYGPIPESIARLPNLRILHLDRNRLNGSIPTSFRD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG083920
TK1151 IDTkAUNG083920
OH-1004 IDLXL04_032064
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)88.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 81.818
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG083920
位置ChrUn:23867405-23868568 (+)
描述Similar to TMM: Protein TOO MANY MOUTHS
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g80080 促进气孔发育中的细胞命运进程。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032064 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0008356 asymmetric cell division 生物过程
GO:0009610 response to symbiotic fungus 生物过程
GO:0009620 response to fungus 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010090 trichome morphogenesis 生物过程
GO:0010375 stomatal complex patterning 生物过程
GO:0010376 stomatal complex formation 生物过程
GO:0044403 biological process involved in symbiotic interaction 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G13230
ath:AT1G35710
ath:AT1G80080
ath:AT2G42800
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.759
排名 1 · TkAUNG083920 · TK1151
内质网0.100
排名 2 · TkAUNG083920 · TK1151
细胞质0.071
排名 3 · TkAUNG083920 · TK1151
细胞外0.059
排名 4 · TkAUNG083920 · TK1151
细胞核0.050
排名 5 · TkAUNG083920 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13516LRR_65-20 aa
PF12799LRR_434-51 aa
PF23598LRR_1436-167 aa
PF13855LRR_869-129 aa
PF12799LRR_469-110 aa
PF25013LRR_Zer-169-104 aa
PF13516LRR_669-83 aa
PF00560LRR_171-92 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG083920PF13516LRR_65202.59.1
TkAUNG083920PF12799LRR_434519.2e-1658.2
TkAUNG083920PF23598LRR_14361672.3e-1660.3
TkAUNG083920PF13855LRR_8691296.5e-2793.8
TkAUNG083920PF12799LRR_4691109.2e-1658.2
TkAUNG083920PF25013LRR_Zer-1691040.0008320.2
TkAUNG083920PF13516LRR_669832.59.1
TkAUNG083920PF00560LRR_171922e-2687.0
TkAUNG083920PF24758LRR_At5g56370831430.009816.3
TkAUNG083920PF29252LRR_NLRC4881061.29.0
TkAUNG083920PF24141LRR_ComC911850.0001222.6
TkAUNG083920PF00560LRR_1951152e-2687.0
TkAUNG083920PF13516LRR_6951072.59.1
TkAUNG083920PF29252LRR_NLRC41121501.29.0
TkAUNG083920PF25013LRR_Zer-11131750.0008320.2
TkAUNG083920PF12799LRR_41171579.2e-1658.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SSD1拟南芥sp|Q9SSD1|TMM_ARATH Protein TOO MANY MOUTHS72.200%Swiss-Prot低置信

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