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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkAUNG070510
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 20434490-20442441 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1399 bp · TkAUNG070510|TK1151|cDNA

TTTGGTGCGACTGTACTACCGACAAAACAAAATAAGCGATCTTATACATGCTAATATAAAAGATGAAATGAATCTCAAGTCACTGAACACGTTTATTACAATAGCTTATCGTTGTCTGGAGAGAGATTTGGAAGACCGTCCGTTGATGTCTGATGTCGTGCACATACTTGAAAGTGCGCTCGAATATCAAATGCTAATATCTCGGTTTATTTTTCTGAACTTTCAAACTTAGCATGGTGCTGGTTCAGGATTGATCATCA...

1185 bp · TkAUNG070510|TK1151|CDS

ATGAATCTCAAGTCACTGAACACGTTTATTACAATAGCTTATCGTTGTCTGGAGAGAGATTTGGAAGACCGTCCGTTGATGTCTGATGTCGTGCACATACTTGAAAGTGCGCTCGAATATCAACATGGTGCTGGTTCAGGATTGATCATCAGTAAGCAACCTGATAGCCATTCAACCAGTTCTGATAATGACAATTGGTTTAAACGAATATGGGCAAAGTTTGGGCTTGATTCAGCTGATTCAATACCAAAGGGGAAGCA...

394 aa · TkAUNG070510|TK1151|PROTEIN

MNLKSLNTFITIAYRCLERDLEDRPLMSDVVHILESALEYQHGAGSGLIISKQPDSHSTSSDNDNWFKRIWAKFGLDSADSIPKGKQAVPLEPILVPPIQVDELKKITNNFGSTSLIGEGTYGRTYFGVLRNGQTVAIKMLNSKKQSNQDFLAQVSKASIHRHVNLVELLGYCVDGDLRVLAYEFASVGSLHDILHGRERVRGVQSGPILSWPQRVKIVVGAAKGLEYLHDMARHRIIHHNIKSKNVLVFEDYVAKFADF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG070510
TK1151 IDTkAUNG070510
OH-1004 IDLXL04_017665
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)56.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 59.756
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG070510
位置ChrUn:20434490-20442441 (+)
描述Similar to PTI1: Pto-interacting protein 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g62220 可能通过磷酸化脱落酸受体,参与脱水条件下的脱落酸信号转导。
At3g17410 可能通过磷酸化脱落酸受体,参与脱水条件下的脱落酸信号转导。
At2g47060 类受体胞质激酶(RLCK),通过磷酸化和激活ABA受体响应脱水触发脱落酸(ABA)信号,以支持其单体化并增强其ABA结合亲和力;它们反过来抑制作为ABA反应负调控因子的PP2C蛋白磷酸酶(可能)。
At1g48210 类受体胞质激酶(RLCK),通过磷酸化并激活ABA受体(例如PYR1/RCAR11、PYL1/RCAR12、PYL3/RCAR13和PYL2/RCAR14)以触发脱水响应的脱落酸(ABA)信号传导,支持其单体化并增强ABA结合亲和力;它们反过来抑制作为ABA响应负调控因子的PP2C蛋白磷酸酶。 暂无已核实直接文献
At1g63970 用于类异戊二烯生物合成的质体非甲羟戊酸途径的酶,将 4-二磷酸胞苷基-2C-甲基-D-赤藓醇 2-磷酸转化为 2C-甲基-D-赤藓醇 2,4-环二磷酸和 CMP。

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0680600 胞质体非甲羟戊酸途径异戊二烯生物合成的酶,将4-二磷胞苷基-2C-甲基-D-赤藓糖醇-2-磷酸转化为2C-甲基-D-赤藓糖醇-2,4-环二磷酸和CMP(可能)。
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_017665 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009789 positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:1902584 positive regulation of response to water deprivation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0000287 magnesium ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G48210
ath:AT3G17410
sly:544006
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞膜0.660
排名 1 · TkAUNG070510 · TK1151
细胞质0.257
排名 2 · TkAUNG070510 · TK1151
细胞核0.208
排名 3 · TkAUNG070510 · TK1151
内质网0.046
排名 4 · TkAUNG070510 · TK1151
高尔基体0.034
排名 5 · TkAUNG070510 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase9-31 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr10-33 aa
PF00069Pkinase114-384 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr116-387 aa
PF24476DUF7580209-357 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG070510PF00069Pkinase9313.1e-34119.3
TkAUNG070510PF07714PK_Tyr_Ser-Thr10331e-44153.5
TkAUNG070510PF00069Pkinase1143843.1e-34119.3
TkAUNG070510PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1163871e-44153.5
TkAUNG070510PF24476DUF75802093570.1312.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M1Q2拟南芥sp|Q9M1Q2|CARK2_ARATH Protein CYTOSOLIC ABA RECEPTOR KINASE 265.300%Swiss-Prot高置信
Q9LUT0拟南芥sp|Q9LUT0|CARK1_ARATH Protein CYTOSOLIC ABA RECEPTOR KINASE 166.100%Swiss-Prot高置信
O80719拟南芥sp|O80719|CARK3_ARATH Protein CYTOSOLIC ABA RECEPTOR KINASE 365.500%Swiss-Prot高置信
F4HWU0拟南芥sp|F4HWU0|CAK11_ARATH Protein CYTOSOLIC ABA RECEPTOR KINASE 1163.900%Swiss-Prot高置信
Q9CAK8拟南芥sp|Q9CAK8|ISPF_ARATH 2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase, chloroplastic87.800%Swiss-Prot高置信
Q6EPN6水稻sp|Q6EPN6|ISPF_ORYSJ 2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase, chloroplastic82.900%Swiss-Prot高置信

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