TkAUNG045190 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkAUNG045190

当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 12546306-12547662 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

489 bp · TkAUNG045190|TK1151|cDNA

ATGTTCTACCAGTACTACCTGTCCCTTCAGCCGGGCCGAAGCCTCTGTGGGCATTTAATGTTTTCCAGGCCGAAGGTCTTCCTGGGACGCGCTTCGGCTCAGATTTCATCCCAGGGTCCGGCTTCGGACCCTCGGTATTTCTATAGTTGGAAGGTTCTTCAATCGGAAGCTGCTCGAAACGGCATCGTCTTGCTGAAGGTGTCGCTCGGAAATTGCTCGGAAATTACGAAGGTGTCGCTCACTGTTCTTCAAGCATTCCA...

CDS

下载 CDS FASTA

489 bp · TkAUNG045190|TK1151|CDS

ATGTTCTACCAGTACTACCTGTCCCTTCAGCCGGGCCGAAGCCTCTGTGGGCATTTAATGTTTTCCAGGCCGAAGGTCTTCCTGGGACGCGCTTCGGCTCAGATTTCATCCCAGGGTCCGGCTTCGGACCCTCGGTATTTCTATAGTTGGAAGGTTCTTCAATCGGAAGCTGCTCGAAACGGCATCGTCTTGCTGAAGGTGTCGCTCGGAAATTGCTCGGAAATTACGAAGGTGTCGCTCACTGTTCTTCAAGCATTCCA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

162 aa · TkAUNG045190|TK1151|PROTEIN

MFYQYYLSLQPGRSLCGHLMFSRPKVFLGRASAQISSQGPASDPRYFYSWKVLQSEAARNGIVLLKVSLGNCSEITKVSLTVLQAFQNYVKTTHYHPGCVDSVNCTSVAIDEAVSIAKSVDYMIMVMGLDQTQEREKLDRLDLVLPRKQSALVSAVARSAGF

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkAUNG045190`
TK1151 ID	TkAUNG045190
OH-1004 ID	LXL04_035808
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	65.200
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 66.667 / OH-1004 16.875 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkAUNG045190

位置 ChrUn:12546306-12547662 (-)

描述 Similar to BXL7: Probable beta-D-xylosidase 7

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g78060`	可能的 β-D-木糖苷酶 7。	暂无已核实直接文献
`At5g10560`	可能的β-D-木糖苷酶 6。	暂无已核实直接文献
`At5g09730`	参与阿拉伯聚糖的水解。	Purification, functional characterization, cloning, and identification of mutants of a seed-specific arabinan hydrolase in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1093/jxb/erj205

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035808 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009627 systemic acquired resistance 生物过程

GO:0031222 arabinan catabolic process 生物过程

GO:0045493 xylan catabolic process 生物过程

GO:0050832 defense response to fungus 生物过程

GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005773 vacuole 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分

GO:0009506 plasmodesma 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G78060

ath:AT3G19620

ath:AT5G09730

ath:AT5G10560

ath:AT5G64570

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.372

排名 1 · TkAUNG045190 · TK1151

细胞质0.249

排名 2 · TkAUNG045190 · TK1151

细胞核0.182

排名 3 · TkAUNG045190 · TK1151

质体0.177

排名 4 · TkAUNG045190 · TK1151

过氧化物酶体0.082

排名 5 · TkAUNG045190 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01915Glyco_hydro_3_C67-158 aa

PF03747ADP_ribosyl_GH82-141 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkAUNG045190	`PF01915`	Glyco_hydro_3_C	67	158	2.6e-10	41.3
TkAUNG045190	`PF03747`	ADP_ribosyl_GH	82	141	0.2	12.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SGZ5`	拟南芥	sp\|Q9SGZ5\|BXL7_ARATH Probable beta-D-xylosidase 7	42.300%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9LXA8`	拟南芥	sp\|Q9LXA8\|BXL6_ARATH Probable beta-D-xylosidase 6	50.000%	Swiss-Prot	低置信
`Q9LXD6`	拟南芥	sp\|Q9LXD6\|BXL3_ARATH Beta-D-xylosidase 3	35.600%	Swiss-Prot	中等置信

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