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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG022910
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 6137140-6139818 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1963 bp · TkAUNG022910|TK1151|cDNA

GAATCACAACTTGTAAGTGGCATACACCAATCATCCATAAAGGAACTCTCATCATCCATAACACAAGAACACGCCGAATCAGATCTAATGCTCCATTTCCTCGCATCCCTAAAAGACCAAAAACAAAAACACGGCTCAAAACTAATCGAAGAAATCAAATGTGTAGAATCCGACATTTCAGAAATCAAATCAAGACAACCCAAACACCACCTCCCAAATCCAAAACCCACCCATCCCCCATCACGCCTTATAACCAACAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1359 bp · TkAUNG022910|TK1151|CDS

ATGCTCCATTTCCTCGCATCCCTAAAAGACCAAAAACAAAAACACGGCTCAAAACTAATCGAAGAAATCAAATGTGTAGAATCCGACATTTCAGAAATCAAATCAAGACAACCCAAACACCACCTCCCAAATCCAAAACCCACCCATCCCCCATCACGCCTTATAACCAACATGAACCATCTAGAACACGCCTACTTCTCCATCAGGTCCACCGTAACAACCCCGGACCACGACAACACAGAAGAACACGAAGTCTTAAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

452 aa · TkAUNG022910|TK1151|PROTEIN

MLHFLASLKDQKQKHGSKLIEEIKCVESDISEIKSRQPKHHLPNPKPTHPPSRLITNMNHLEHAYFSIRSTVTTPDHDNTEEHEVLTSRENNNNNIVRKVANKCEDRLGMFFNGLCKYARYSKFEVKGVLRNGDFSSMGNVICSLGFDRDEDYFATAGVSKKIKVYDFEALLSDSVDIHYPAVEMANKSKISCICWNNYIRNYLASTDYDGVVKIWDAGTGEVVSQHMEHEKRAWSVDFSKVDPMKLASGSDDCSVKLWS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG022910
TK1151 IDTkAUNG022910
OH-1004 IDLXL04_037649
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)52.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 92.478 / OH-1004 48.565
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG022910
位置ChrUn:6137140-6139818 (+)
描述Similar to SPA3: Protein SPA1-RELATED 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g11110 参与抑制黑暗生长的幼苗的光形态建成。
The SPA quartet: a family of WD-repeat proteins with a central role in suppression of photomorphogenesis in arabidopsis.2004 · DOI: 10.1105/tpc.104.024216
Functional and expression analysis of Arabidopsis SPA genes during seedling photomorphogenesis and adult growth.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02812.x
UniProt: Q9SYX2 控制正常光周期开花并调节昼夜节律。 暂无已核实直接文献
At1g53090 光形态发生的阻遏物。
The SPA1-like proteins SPA3 and SPA4 repress photomorphogenesis in the light.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01813.x
Functional and expression analysis of Arabidopsis SPA genes during seedling photomorphogenesis and adult growth.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02812.x
Arabidopsis SPA proteins regulate photoperiodic flowering and interact with the floral inducer CONSTANS to regulate its stability.2006 · DOI: 10.1242/dev.02481
At3g15354 光形态发生的阻遏物。
The SPA1-like proteins SPA3 and SPA4 repress photomorphogenesis in the light.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01813.x
Functional and expression analysis of Arabidopsis SPA genes during seedling photomorphogenesis and adult growth.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02812.x
Arabidopsis SPA proteins regulate photoperiodic flowering and interact with the floral inducer CONSTANS to regulate its stability.2006 · DOI: 10.1242/dev.02481

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037649 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006281 DNA repair 生物过程
GO:0009585 red, far-red light phototransduction 生物过程
GO:0009637 response to blue light 生物过程
GO:0009640 photomorphogenesis 生物过程
GO:0009641 shade avoidance 生物过程
GO:0009647 skotomorphogenesis 生物过程
GO:0009649 entrainment of circadian clock 生物过程
GO:0009658 chloroplast organization 生物过程
GO:0009963 positive regulation of flavonoid biosynthetic process 生物过程
GO:0010017 red or far-red light signaling pathway 生物过程
GO:0010100 negative regulation of photomorphogenesis 生物过程
GO:0010114 response to red light 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G53090
ath:AT2G32950
ath:AT2G46340
ath:AT3G15354
ath:AT4G11110
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.640
排名 1 · TkAUNG022910 · TK1151
细胞质0.346
排名 2 · TkAUNG022910 · TK1151
溶酶体／液泡0.047
排名 3 · TkAUNG022910 · TK1151
细胞膜0.045
排名 4 · TkAUNG022910 · TK1151
高尔基体0.027
排名 5 · TkAUNG022910 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23419WD40_RFWD372-105 aa
PF24805EIF3I122-171 aa
PF23381Beta-prop_IFT122_1st133-169 aa
PF24807WD40_CDC20-Fz134-206 aa
PF25168Beta-prop_WDR36-Utp21_2nd134-170 aa
PF24782WD40_MABP1-WDR62_2nd136-169 aa
PF25047Beta-prop_TEP1_2nd139-233 aa
PF12894ANAPC4_WD40139-169 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG022910PF23419WD40_RFWD3721053.2e-0524.1
TkAUNG022910PF24805EIF3I1221712.1e-1454.1
TkAUNG022910PF23381Beta-prop_IFT122_1st1331694.3e-2795.9
TkAUNG022910PF24807WD40_CDC20-Fz1342063.3e-38132.4
TkAUNG022910PF25168Beta-prop_WDR36-Utp21_2nd1341701.1e-1351.9
TkAUNG022910PF24782WD40_MABP1-WDR62_2nd1361692e-1040.9
TkAUNG022910PF25047Beta-prop_TEP1_2nd1392333.3e-1763.2
TkAUNG022910PF12894ANAPC4_WD401391692.4e-0938.0
TkAUNG022910PF25173Beta-prop_WDR3_1st1402416e-36124.6
TkAUNG022910PF25175Beta-prop_WDR51403939e-34117.8
TkAUNG022910PF24817WD40_WDHD1_1st1402111.1e-2074.8
TkAUNG022910PF23414Beta-prop_EML_21402362.3e-1764.0
TkAUNG022910PF25172Beta-prop_WDR3_2nd1401766.7e-1555.8
TkAUNG022910PF23389Beta-prop_WDR19_1st1402591.3e-1041.6
TkAUNG022910PF23381Beta-prop_IFT122_1st1412084.3e-2795.9
TkAUNG022910PF23393Beta-prop_WDR90_POC16_2nd1411782.6e-0627.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9T014拟南芥sp|Q9T014|SPA2_ARATH Protein SPA1-RELATED 262.300%Swiss-Prot高置信
Q9SYX2拟南芥sp|Q9SYX2|SPA1_ARATH Protein SUPPRESSOR OF PHYA-105 158.200%Swiss-Prot高置信
Q94BM7拟南芥sp|Q94BM7|SPA4_ARATH Protein SPA1-RELATED 450.000%Swiss-Prot高置信
Q9LJR3拟南芥sp|Q9LJR3|SPA3_ARATH Protein SPA1-RELATED 348.100%Swiss-Prot中等置信

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