RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG008980
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 2263563-2265944 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2313 bp · TkAUNG008980|TK1151|cDNA

ATGGCGGTACCACATCTTATAACACTGATCGTATTAATATTTCTATCTGAAACACCATTGATATCTTCCTCCTCCGCTTCTTTTTCTTCACCGCCATTTGGGTTAAAACTAGGTTCATCTCTCTCAGTTGCCGACTTCCTGATCTCACCAAATGCCATTTACACCGCCGGATTTTACAGCGTTGGGGAGAATGCTTATTGCTTTTCGATATGGTTCACAAAACCTCTCGCCGACGGGAGTCTCACTATTTTATGGATGGC...

CDS

下载 CDS FASTA

2313 bp · TkAUNG008980|TK1151|CDS

ATGGCGGTACCACATCTTATAACACTGATCGTATTAATATTTCTATCTGAAACACCATTGATATCTTCCTCCTCCGCTTCTTTTTCTTCACCGCCATTTGGGTTAAAACTAGGTTCATCTCTCTCAGTTGCCGACTTCCTGATCTCACCAAATGCCATTTACACCGCCGGATTTTACAGCGTTGGGGAGAATGCTTATTGCTTTTCGATATGGTTCACAAAACCTCTCGCCGACGGGAGTCTCACTATTTTATGGATGGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

770 aa · TkAUNG008980|TK1151|PROTEIN

MAVPHLITLIVLIFLSETPLISSSSASFSSPPFGLKLGSSLSVADFLISPNAIYTAGFYSVGENAYCFSIWFTKPLADGSLTILWMANRDLPVNGRFSKLSLLKTGNLVLKDAYQRLPIWTTNTRDSKASAYLKLNNSGNLCLRNKDGEILWQSFDTPTDTLLPNQPLTKDAPLVSSRSVSNYSSGFYKLFFDNDNVVRLVYSDSKLTGIFWPNPELRAWESGRNTYGSRRIGIMDSSGRLTMDVDGNFRAYSLDETRGI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG008980
TK1151 IDTkAUNG008980
OH-1004 IDLXL04_014569
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)96.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 98.265
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG008980
位置ChrUn:2263563-2265944 (+)
描述Similar to PK1: Putative receptor protein kinase ZmPK1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g19130 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At2g19130。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0202500 参与对食草性昆虫褐飞虱（Nilaparvata lugens, BPH）的抗性。 暂无已核实直接文献
UniProt: Q25AG3 参与对食草性昆虫褐飞虱（Nilaparvata lugens, BPH）的抗性。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2XQD3 参与对食草性昆虫褐飞虱（Nilaparvata lugens, BPH）的抗性。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014569 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0048544 recognition of pollen 生物过程
GO:0051707 response to other organism 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005516 calmodulin binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0030246 carbohydrate binding 分子功能
GO:0031625 ubiquitin protein ligase binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G19130
dosa:Os04g0202350
dosa:Os04g0202500
osa:9266608
zma:542378
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.838
排名 1 · TkAUNG008980 · TK1151
内质网0.086
排名 2 · TkAUNG008980 · TK1151
细胞质0.068
排名 3 · TkAUNG008980 · TK1151
细胞核0.037
排名 4 · TkAUNG008980 · TK1151
细胞外0.032
排名 5 · TkAUNG008980 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01453B_lectin82-171 aa
PF00954S_locus_glycop124-152 aa
PF01453B_lectin233-263 aa
PF00954S_locus_glycop238-298 aa
PF01683EB266-304 aa
PF08276PAN_2276-285 aa
PF14295PAN_4277-285 aa
PF08276PAN_2321-368 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG008980PF01453B_lectin821714.3e-2382.5
TkAUNG008980PF00954S_locus_glycop1241523.2e-0628.4
TkAUNG008980PF01453B_lectin2332634.3e-2382.5
TkAUNG008980PF00954S_locus_glycop2382983.2e-0628.4
TkAUNG008980PF01683EB2663046.07.7
TkAUNG008980PF08276PAN_22762850.0001222.8
TkAUNG008980PF14295PAN_42772850.810.5
TkAUNG008980PF08276PAN_23213680.0001222.8
TkAUNG008980PF00024PAN_13273720.001219.4
TkAUNG008980PF14295PAN_43353790.810.5
TkAUNG008980PF00954S_locus_glycop3513673.2e-0628.4
TkAUNG008980PF01683EB3513636.07.7
TkAUNG008980PF07714PK_Tyr_Ser-Thr4987663.4e-40138.7
TkAUNG008980PF00069Pkinase5007641.3e-49169.7
TkAUNG008980PF03109ABC15085310.002217.9
TkAUNG008980PF03109ABC15646460.002217.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O64477拟南芥sp|O64477|Y2913_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g1913032.500%Swiss-Prot中等置信
Q0JEU6水稻sp|Q0JEU6|LERK3_ORYSJ G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK332.600%Swiss-Prot中等置信
Q25AG3水稻sp|Q25AG3|LERK3_ORYSI G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK332.600%Swiss-Prot中等置信
A2XQD3水稻sp|A2XQD3|LERK2_ORYSI G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK232.800%Swiss-Prot中等置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看