RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G265480
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 69175598-69179970 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2346 bp · TkA08G265480|TK1151|cDNA

ATCGATGATCCGATCCAGTCTATTCCATTTCTACCAACTAAAATCACTTTCTTCTTCTTTCAGCGATACAAAATTAGGCTTTTAGCAGTTTTTACTGCTCAAGCAACTTTGACATTCGGGTATTCAAAGAAAAAAGGAAGACTATTTCCTTCTTTCATACTATAGAATGGCAATTTCTTCCCAATAAAACCTTCCGGAGCAGAAAGTTCTCATCTTGGAATAGTTCTCCGGTACATAATGTTCAGAAAGATCATTTCTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1911 bp · TkA08G265480|TK1151|CDS

ATGTTCAGAAAGATCATTTCTTCCCATTCTAAGTCAAAGACAAGAAAATTTGTATCGATATCACATCATTCCACCAACTATTGCTACTACGATCACTCAGCACCACCTTCTTCCCCATCAAAACACATTTCCTCCAGACAAAAATGGCTTGATATCACACCAACTTCATTAAAGGGTTTCAATCGATCTTTTTCAGCTGGGTACCGGTTAAATTCGACGCAGTATAGTGGGTCTAATTTGAATAAAAGAAATAGGTTTTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

636 aa · TkA08G265480|TK1151|PROTEIN

MFRKIISSHSKSKTRKFVSISHHSTNYCYYDHSAPPSSPSKHISSRQKWLDITPTSLKGFNRSFSAGYRLNSTQYSGSNLNKRNRFSVRRGFSSETVRECINYDVVIVGGGPAGLSAAIRLKQLCRESDVDLSVCVVEKGAEVGAHILSGNVFEPRALNELIPQWREEEAPISVSVSSDKFMLLTEKHAIPLPNPFDNKGNYVISLSQFVRWLGQKAEELGVEVYPGFAAKEVLFDENENVIGIATNDMGIGKDGSKKDN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G265480
TK1151 IDTkA08G265480
OH-1004 IDLXL04_033432
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.742 / OH-1004 89.714
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G265480
位置Chr08:69175598-69179970 (-)
描述Similar to ETFQO: Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g43400 通过将电子从电子转移黄素蛋白 转移到泛醌，将脂肪酸 β-氧化和氨基酸分解代谢与呼吸链联系起来。
The critical role of Arabidopsis electron-transfer flavoprotein:ubiquinone oxidoreductase during dark-induced starvation.2005 · DOI: 10.1105/tpc.105.035162
Identification of the 2-hydroxyglutarate and isovaleryl-CoA dehydrogenases as alternative electron donors linking lysine catabolism to the electron transport chain of Arabidopsis mitochondria.2010 · DOI: 10.1105/tpc.110.075630

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os10g0516300 通过将电子从电子转移黄素蛋白 (ETF) 转移到泛醌，将脂肪酸 β-氧化和氨基酸分解代谢与呼吸链联系起来。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_033432 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006552 L-leucine catabolic process 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009646 response to absence of light 生物过程
GO:0010230 alternative respiration 生物过程
GO:0022900 electron transport chain 生物过程
GO:0033539 fatty acid beta-oxidation using acyl-CoA dehydrogenase 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0031966 mitochondrial membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G43400
ddi:DDB_G0278849
dosa:Os10g0516300
rno:295143
ssc:100515785
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.953
排名 1 · TkA08G265480 · TK1151
细胞质0.048
排名 2 · TkA08G265480 · TK1151
细胞核0.041
排名 3 · TkA08G265480 · TK1151
细胞膜0.024
排名 4 · TkA08G265480 · TK1151
质体0.013
排名 5 · TkA08G265480 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF21162ETFQO_UQ-bd63-80 aa
PF01946Thi495-153 aa
PF07992Pyr_redox_2103-143 aa
PF01494FAD_binding_3103-225 aa
PF01266DAO104-146 aa
PF00890FAD_binding_2104-147 aa
PF05834Lycopene_cycl104-143 aa
PF03486HI0933_like104-228 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G265480PF21162ETFQO_UQ-bd63802.7e-42143.9
TkA08G265480PF01946Thi4951531.8e-0628.1
TkA08G265480PF07992Pyr_redox_21031431.8e-0525.0
TkA08G265480PF01494FAD_binding_31032250.0009419.2
TkA08G265480PF01266DAO1041462.1e-0731.6
TkA08G265480PF00890FAD_binding_21041473e-0524.1
TkA08G265480PF05834Lycopene_cycl1041430.0001521.7
TkA08G265480PF03486HI0933_like1042280.0002121.6
TkA08G265480PF12831FAD_oxidored1041440.003917.2
TkA08G265480PF04820Trp_halogenase1041380.00416.8
TkA08G265480PF01134GIDA1041240.1711.6
TkA08G265480PF00070Pyr_redox1051250.03515.3
TkA08G265480PF13738Pyr_redox_31061460.0008119.4
TkA08G265480PF13454NAD_binding_91061450.001619.2
TkA08G265480PF13450NAD_binding_81071524.2e-0730.9
TkA08G265480PF04820Trp_halogenase2022870.00416.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O22854拟南芥sp|O22854|ETFD_ARATH Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial77.100%Swiss-Prot高置信
Q337B8水稻sp|Q337B8|ETFD_ORYSJ Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial77.000%Swiss-Prot高置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看