基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA08G260280
当前版本: TK1151
染色体: Chr08
坐标: 67856215-67861939
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1313 bp · TkA08G260280|TK1151|cDNA
GTTTCCATTCTCTCAAACACGCAAACGGTCAGGCTTATGAGAAGAGAAAGAAAAGGAGATTGGAAACAGGTCGATGGCCGCTTGCAACAATATTTGGTTCTTCTTCTTGCTATTGTTTTAGGGTTTCTGATCATGGATCCTTTCGATATGAGTCCCGTTGGTGGACATAATTTCCCGACCTGTGAAAAATGATATTGCCCCGTATGACCAAGTGATGGAGAGTTGGCCCTTGACAATCTTAGCCGGTTAGGGCTTGGAAC...
CDS
下载 CDS FASTA552 bp · TkA08G260280|TK1151|CDS
ATGTTGGAAGGGGAGGCAACTGGAAGGCTGCTCAGATATGACCCTCCAACAAAGTCAACTCATGTTGTATTAAATGGCTTGGCTTTCCCAAATGGGGTTCAGTTGTCCAAGGACGAATCTTTTCTTTTGTTCACCGAGACTACAAACTGCAGGCTTATGAAATTATGGATAAAGGGTGAACAAAGCGGCAAAGTTGAACTTGTGGCAAACTTACCTGGTTTCCCAGACAACATAAGAATAAACGACCAAGGCCAGTTTTG...
183 aa · TkA08G260280|TK1151|PROTEIN
MLEGEATGRLLRYDPPTKSTHVVLNGLAFPNGVQLSKDESFLLFTETTNCRLMKLWIKGEQSGKVELVANLPGFPDNIRINDQGQFWVAIDCCRTKAQEILTNNPWMRSVYFRLPFQMRYLARIMGMKMYSVITLFDEQGKILDVLEDREGVVMKLVSEVREANGMLWIGTVAHNHIATLPYP
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA08G260280 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA08G260280 |
| OH-1004 ID | LXL04_033433 |
| 关系 / 置信度 | 序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核 |
| 蛋白一致性 (%) | 100.000 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 100.000 / OH-1004 44.963覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA08G260280 |
|---|---|
| 位置 | Chr08:67856215-67861939 (+) |
| 描述 | Similar to SSL13: Protein STRICTOSIDINE SYNTHASE-LIKE 13 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0009555 pollen development 生物过程 GO:0010584 pollen exine formation 生物过程 GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分 GO:0005739 mitochondrion 细胞组分 GO:0005773 vacuole 细胞组分 GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分 GO:0009506 plasmodesma 细胞组分 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 GO:0016787 hydrolase activity 分子功能 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G08470 ath:AT3G57010 ath:AT3G57020 ath:AT3G57030 ath:AT3G59530 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
内质网0.627
细胞质0.179
细胞膜0.096
溶酶体／液泡0.096
高尔基体0.072
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF03088Str_synth1-60 aaPF08450SGL5-90 aaPF01731Arylesterase18-104 aaPF03088Str_synth74-98 aaPF07494Reg_prop81-89 aaPF16846Cep3107-162 aaPF03088Str_synth139-159 aaPF07494Reg_prop141-152 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA08G260280 | PF03088 | Str_synth | 1 | 60 | 5e-21 | 75.3 |
| TkA08G260280 | PF08450 | SGL | 5 | 90 | 2.2e-10 | 41.3 |
| TkA08G260280 | PF01731 | Arylesterase | 18 | 104 | 0.00079 | 18.9 |
| TkA08G260280 | PF03088 | Str_synth | 74 | 98 | 5e-21 | 75.3 |
| TkA08G260280 | PF07494 | Reg_prop | 81 | 89 | 0.064 | 14.2 |
| TkA08G260280 | PF16846 | Cep3 | 107 | 162 | 0.15 | 11.3 |
| TkA08G260280 | PF03088 | Str_synth | 139 | 159 | 5e-21 | 75.3 |
| TkA08G260280 | PF07494 | Reg_prop | 141 | 152 | 0.064 | 14.2 |
| TkA08G260280 | PF08450 | SGL | 162 | 175 | 2.2e-10 | 41.3 |
| TkA08G260280 | PF07494 | Reg_prop | 163 | 171 | 0.064 | 14.2 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9M1B4 | 拟南芥 | sp|Q9M1B4|SSL13_ARATH Protein STRICTOSIDINE SYNTHASE-LIKE 13 | 72.700% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q8VWF6 | 拟南芥 | sp|Q8VWF6|SSL3_ARATH Protein STRICTOSIDINE SYNTHASE-LIKE 3 | 43.800% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q4V3D9 | 拟南芥 | sp|Q4V3D9|SSL10_ARATH Protein STRICTOSIDINE SYNTHASE-LIKE 10 | 43.700% | Swiss-Prot | 中等置信 |
F4IJZ6 | 拟南芥 | sp|F4IJZ6|SSL1_ARATH Protein STRICTOSIDINE SYNTHASE-LIKE 1 | 39.200% | Swiss-Prot | 中等置信 |