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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G257350
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 67103496-67106949 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2164 bp · TkA08G257350|TK1151|cDNA

CTCAAATATTCGAATAGAACCAAAAAGAAAAAAAAAATACAAAGTTTTATGGACCGAGTCATGACTCGGCTGAAACGATCGTCTGACGCGCTCGCCGATGTTGACTTCCACCACCGTGATTCTTTTCCTCCTCCTCCTCCGCTTCCTACATGTGTGGGGGGAACGACTCCCAGACACTATTCTATCTCCTCCTCCTCCACGATTCCACGCGTCTTCATTCTCAGTGGATCCCACCTACCAATTCCCGAAGACCCAACAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

1830 bp · TkA08G257350|TK1151|CDS

ATGTTGACTTCCACCACCGTGATTCTTTTCCTCCTCCTCCTCCGCTTCCTACATGTGTGGGGGGAACGACTCCCAGACACTATTCTATCTCCTCCTCCTCCACGATTCCACGCGTCTTCATTCTCAGTGGATCCCACCTACCAATTCCCGAAGACCCAACAACCAGTTTCCCGAAATCCTTCCCACCCACCTATAAATTCCCAAATTCTCTCTCGCAAATCTCTCTCAGTTCATCGCACGGTCATGGTGCTGGAGAATTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

609 aa · TkA08G257350|TK1151|PROTEIN

MLTSTTVILFLLLLRFLHVWGERLPDTILSPPPPRFHASSFSVDPTYQFPKTQQPVSRNPSHPPINSQILSRKSLSVHRTVMVLENFNSNGNASNLSSDNGCLDSLSLINSEKAVMEVIEQPLVQGIEDHLVEFSEAMRTVSKALRRAAEGKASAQAEASEWKRKYELERERNMQLENKDLKINPTENKVEKSAQNLKRMLERDEQSQIRSGKNGIYSHEVLRDNEHNSYSNIHSKLIRKASFKLHWCCTGEKNDQHKHD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G257350
TK1151 IDTkA08G257350
OH-1004 IDLXL04_033449
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.686 / OH-1004 99.835
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G257350
位置Chr08:67103496-67106949 (-)
描述Similar to NADK1: NAD(H) kinase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g21070 能磷酸化 NAD(+) 和 NADH，对 NADH 有两倍的偏好。 暂无已核实直接文献
At1g21640 参与叶绿素合成和叶绿体免受氧化损伤的保护。
NADK2, an Arabidopsis chloroplastic NAD kinase, plays a vital role in both chlorophyll synthesis and chloroplast protection.2005 · DOI: 10.1007/s11103-005-6802-y

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0957000 可能的 NAD 激酶 1。 暂无已核实直接文献
Os05g0388400 推测的NAD激酶3。 暂无已核实直接文献
Os11g0191400 参与叶绿素合成并保护叶绿体免受氧化损伤。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_033449 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006741 NADP+ biosynthetic process 生物过程
GO:0019674 NAD+ metabolic process 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0003951 NAD+ kinase activity 分子功能
GO:0005516 calmodulin binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0042736 NADH kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G21640
ath:AT3G21070
dosa:Os01g0957000
dosa:Os11g0191400
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.300
排名 1 · TkA08G257350 · TK1151
细胞核0.215
排名 2 · TkA08G257350 · TK1151
细胞膜0.157
排名 3 · TkA08G257350 · TK1151
线粒体0.146
排名 4 · TkA08G257350 · TK1151
高尔基体0.135
排名 5 · TkA08G257350 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF27150Rv2240c107-151 aa
PF01513NAD_kinase172-204 aa
PF05826Phospholip_A2_2246-258 aa
PF01513NAD_kinase290-410 aa
PF00781DAGK_cat336-388 aa
PF20143NAD_kinase_C442-561 aa
PF05826Phospholip_A2_2453-488 aa
PF00781DAGK_cat465-476 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G257350PF27150Rv2240c1071510.1313.5
TkA08G257350PF01513NAD_kinase1722046.7e-2278.9
TkA08G257350PF05826Phospholip_A2_22462580.2112.5
TkA08G257350PF01513NAD_kinase2904106.7e-2278.9
TkA08G257350PF00781DAGK_cat3363880.0003121.0
TkA08G257350PF20143NAD_kinase_C4425611.1e-30106.7
TkA08G257350PF05826Phospholip_A2_24534880.2112.5
TkA08G257350PF00781DAGK_cat4654760.0003121.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q56YN3拟南芥sp|Q56YN3|NADK1_ARATH NAD(H) kinase 169.500%Swiss-Prot高置信
Q9C5W3拟南芥sp|Q9C5W3|NADK2_ARATH NAD kinase 2, chloroplastic44.000%Swiss-Prot中等置信
Q5JK52水稻sp|Q5JK52|NADK1_ORYSJ Probable NAD kinase 167.600%Swiss-Prot高置信
Q60E60水稻sp|Q60E60|NADK3_ORYSJ Putative NAD kinase 367.000%Swiss-Prot高置信
Q53NI2水稻sp|Q53NI2|NADK2_ORYSJ Probable NAD kinase 2, chloroplastic43.500%Swiss-Prot中等置信

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