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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G231040
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 60179325-60180061 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

636 bp · TkA08G231040|TK1151|cDNA

ATGGGTACCTTAACCTTCCGGTGGTGGATTACAGCTGTTTTGGTGATCGCCGTCGGTGTGACGGTGGATGCTTGCCCGGCGTCGGATAGGGCATCGTTGCTCGCCTTCAAAGCTGCTTTACATGAACCTCATTTAGGCATCTTTAATTCGTGGACGGGCACCGACTGTTGTAACAAATGGTACGGTATTACTTGCGACCCGACTACTAAACGGGTTGCGGATATAGCGCTCCGTGGAGAGTCCGAGGATCCAATTTTTCA...

CDS

下载 CDS FASTA

636 bp · TkA08G231040|TK1151|CDS

ATGGGTACCTTAACCTTCCGGTGGTGGATTACAGCTGTTTTGGTGATCGCCGTCGGTGTGACGGTGGATGCTTGCCCGGCGTCGGATAGGGCATCGTTGCTCGCCTTCAAAGCTGCTTTACATGAACCTCATTTAGGCATCTTTAATTCGTGGACGGGCACCGACTGTTGTAACAAATGGTACGGTATTACTTGCGACCCGACTACTAAACGGGTTGCGGATATAGCGCTCCGTGGAGAGTCCGAGGATCCAATTTTTCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

211 aa · TkA08G231040|TK1151|PROTEIN

MGTLTFRWWITAVLVIAVGVTVDACPASDRASLLAFKAALHEPHLGIFNSWTGTDCCNKWYGITCDPTTKRVADIALRGESEDPIFQKAKRTGYMTGSISPAICNLERLSNVIISDWKGISGTVPSCITSLPFLRHLDLVGNQISGEIPSDIGKLHLLTVLNLADNKITGRIPRSIANLTSLMHLDLRNNMISLSSLRPRSLVKPDLRTDS

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G231040
TK1151 IDTkA08G231040
OH-1004 IDLXL04_033107
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)98.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 68.246 / OH-1004 39.237
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G231040
位置Chr08:60179325-60180061 (-)
描述Similar to DRT100: DNA damage-repair/toleration protein DRT100
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g12610 该蛋白能够补偿细菌 recA 突变，但其在植物中的本体功能尚不清楚。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_033107 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006281 DNA repair 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0010228 vegetative to reproductive phase transition of meristem 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0048510 regulation of timing of transition from vegetative to reproductive phase 生物过程
GO:0048574 long-day photoperiodism, flowering 生物过程
GO:0051302 regulation of cell division 生物过程
GO:0090511 periclinal cell division 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G12145
ath:AT3G12610
ath:AT3G56370
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.563
排名 1 · TkA08G231040 · TK1151
细胞外0.196
排名 2 · TkA08G231040 · TK1151
内质网0.118
排名 3 · TkA08G231040 · TK1151
细胞质0.080
排名 4 · TkA08G231040 · TK1151
细胞核0.043
排名 5 · TkA08G231040 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_227-66 aa
PF00560LRR_196-106 aa
PF25013LRR_Zer-1107-140 aa
PF08263LRRNT_2115-121 aa
PF00560LRR_1120-131 aa
PF12799LRR_4124-144 aa
PF13855LRR_8125-144 aa
PF23598LRR_14126-191 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G231040PF08263LRRNT_227668.3e-1245.9
TkA08G231040PF00560LRR_1961067.7e-1243.6
TkA08G231040PF25013LRR_Zer-11071400.008716.9
TkA08G231040PF08263LRRNT_21151218.3e-1245.9
TkA08G231040PF00560LRR_11201317.7e-1243.6
TkA08G231040PF12799LRR_41241442.9e-1143.9
TkA08G231040PF13855LRR_81251442.5e-1247.1
TkA08G231040PF23598LRR_141261918.3e-1141.9
TkA08G231040PF25013LRR_Zer-11281900.008716.9
TkA08G231040PF13516LRR_61321474.9e-0730.0
TkA08G231040PF13855LRR_81341922.5e-1247.1
TkA08G231040PF00560LRR_11341557.7e-1243.6
TkA08G231040PF12799LRR_41341692.9e-1143.9
TkA08G231040PF13516LRR_61561704.9e-0730.0
TkA08G231040PF13855LRR_81582012.5e-1247.1
TkA08G231040PF00560LRR_11581797.7e-1243.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q00874拟南芥sp|Q00874|DR100_ARATH DNA damage-repair/toleration protein DRT10058.100%Swiss-Prot中等置信

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