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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G228890
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 59604130-59607563 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1399 bp · TkA08G228890|TK1151|cDNA

ATGTTCATTCAGGGACAATCGGCTGCAAGTGTGGCAGAAATGGGCTGCTGTGGTTGTTTTGGATTTTCATTTGCAAAAAAGCACAAGAACTTGAGGCCAACTGTACAGGGGGGAAACCATGTTTTACAACAAGGGCTCTTAAATGAAGAGTTTGAAGAAGAAGAAAATGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATAACAACTCATATAGTGAAACAGATACAGAAAAAGGAGATGATGAAGAGTTGAGAACCACCCCTGCTAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1248 bp · TkA08G228890|TK1151|CDS

ATGTTCATTCAGGGACAATCGGCTGCAAGTGTGGCAGAAATGGGCTGCTGTGGTTGTTTTGGATTTTCATTTGCAAAAAAGCACAAGAACTTGAGGCCAACTGTACAGGGGGGAAACCATGTTTTACAACAAGGGCTCTTAAATGAAGAGTTTGAAGAAGAAGAAAATGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATAACAACTCATATAGTGAAACAGATACAGAAAAAGGAGATGATGAAGAGTTGAGAACCACCCCTGCTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

415 aa · TkA08G228890|TK1151|PROTEIN

MFIQGQSAASVAEMGCCGCFGFSFAKKHKNLRPTVQGGNHVLQQGLLNEEFEEEENEEEEEEEDNNSYSETDTEKGDDEELRTTPAKTSQEILIYRTENDLICREFPVKQTHKVVRSEDENGNKMVNEYVRECKIGAGSYGKVVLYRSQVDGKHYAIKAFHKSHLLKLRVAPSETAMTDVFREVLIMKMLSHPNIVNLFEVIDDPNMDHFYMVLEYVEGKWVFEGAGVPGGLGENVARRYLRDIVSGLMYLHAHNVVHGD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G228890
TK1151 IDTkA08G228890
OH-1004 IDLXL04_033074
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G228890
位置Chr08:59604130-59607563 (-)
描述Similar to GRIK2: Serine/threonine-protein kinase GRIK2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g60550 分别通过磷酸化激活环“Thr-198”和“Thr-176”来激活 SnRK1.1/KIN10 和 SnRK1.2/KIN11。
Geminivirus infection up-regulates the expression of two Arabidopsis protein kinases related to yeast SNF1- and mammalian AMPK-activating kinases.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.088476
DNA sequences from Arabidopsis, which encode protein kinases and function as upstream regulators of Snf1 in yeast.2007 · DOI: 10.1074/jbc.m611244200
Arabidopsis protein kinases GRIK1 and GRIK2 specifically activate SnRK1 by phosphorylating its activation loop.2009 · DOI: 10.1104/pp.108.132787
Cross-phosphorylation between Arabidopsis thaliana sucrose nonfermenting 1-related protein kinase 1 (AtSnRK1) and its activating kinase (AtSnAK) determines their catalytic activities.2010 · DOI: 10.1074/jbc.m109.079194
At3g45240 分别通过磷酸化激活环“Thr-198”和“Thr-176”来激活 SnRK1.1/KIN10 和 SnRK1.2/KIN11。
Geminivirus infection up-regulates the expression of two Arabidopsis protein kinases related to yeast SNF1- and mammalian AMPK-activating kinases.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.088476
DNA sequences from Arabidopsis, which encode protein kinases and function as upstream regulators of Snf1 in yeast.2007 · DOI: 10.1074/jbc.m611244200
Arabidopsis protein kinases GRIK1 and GRIK2 specifically activate SnRK1 by phosphorylating its activation loop.2009 · DOI: 10.1104/pp.108.132787
Cross-phosphorylation between Arabidopsis thaliana sucrose nonfermenting 1-related protein kinase 1 (AtSnRK1) and its activating kinase (AtSnAK) determines their catalytic activities.2010 · DOI: 10.1074/jbc.m109.079194

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_033074 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0009615 response to virus 生物过程
GO:0032147 activation of protein kinase activity 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0045860 positive regulation of protein kinase activity 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0061762 CAMKK-AMPK signaling cascade 生物过程
GO:1903599 positive regulation of autophagy of mitochondrion 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G45240
ath:AT5G60550
ddi:DDB_G0279405
mmu:55984
rno:83506
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.549
排名 1 · TkA08G228890 · TK1151
细胞核0.376
排名 2 · TkA08G228890 · TK1151
细胞膜0.245
排名 3 · TkA08G228890 · TK1151
高尔基体0.060
排名 4 · TkA08G228890 · TK1151
线粒体0.055
排名 5 · TkA08G228890 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04931DNA_pol_phi49-80 aa
PF03109ABC1103-162 aa
PF00069Pkinase129-390 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr133-386 aa
PF13095FTA2144-169 aa
PF01636APH168-254 aa
PF01163RIO1179-217 aa
PF06176WaaY208-284 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G228890PF04931DNA_pol_phi49807.45.3
TkA08G228890PF03109ABC11031620.008815.9
TkA08G228890PF00069Pkinase1293904e-58197.6
TkA08G228890PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1333863e-29102.9
TkA08G228890PF13095FTA21441690.0613.7
TkA08G228890PF01636APH1682540.000919.8
TkA08G228890PF01163RIO11792170.1612.3
TkA08G228890PF06176WaaY2082840.0613.7
TkA08G228890PF03109ABC12112880.008815.9
TkA08G228890PF13095FTA22342670.0613.7
TkA08G228890PF14531Kinase-like2363677.1e-0729.5
TkA08G228890PF01163RIO12362810.1612.3
TkA08G228890PF17667Pkinase_fungal2413130.08912.2
TkA08G228890PF07387Seadorna_VP72462780.04813.4
TkA08G228890PF01636APH2562710.000919.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q5HZ38拟南芥sp|Q5HZ38|GRIK2_ARATH Serine/threonine-protein kinase GRIK274.700%Swiss-Prot高置信
Q93V58拟南芥sp|Q93V58|GRIK1_ARATH Serine/threonine-protein kinase GRIK168.800%Swiss-Prot高置信

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