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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G227440
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 59239292-59241082 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1791 bp · TkA08G227440|TK1151|cDNA

ATGATGTTTATATGGTTGCTTATTTTCATCAACTCGATCAACTCAAGCCATGAACAAGCATTCTATGACGCAACATCTTGTCGAGATGATGGCAATGCTCCAGGGACAAGGTACACTTGCACTAACACCACGTTGACCAAGATGTCATGCCAGACTTTCTTGATTTTCCGAACAAACCATCAGTTTCCGACCATCTCCACCATCGCCACCTTGTTTGGACTGCCACCCGACACCTTACTTGAGTTAAACGTCCACATAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1791 bp · TkA08G227440|TK1151|CDS

ATGATGTTTATATGGTTGCTTATTTTCATCAACTCGATCAACTCAAGCCATGAACAAGCATTCTATGACGCAACATCTTGTCGAGATGATGGCAATGCTCCAGGGACAAGGTACACTTGCACTAACACCACGTTGACCAAGATGTCATGCCAGACTTTCTTGATTTTCCGAACAAACCATCAGTTTCCGACCATCTCCACCATCGCCACCTTGTTTGGACTGCCACCCGACACCTTACTTGAGTTAAACGTCCACATAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

596 aa · TkA08G227440|TK1151|PROTEIN

MMFIWLLIFINSINSSHEQAFYDATSCRDDGNAPGTRYTCTNTTLTKMSCQTFLIFRTNHQFPTISTIATLFGLPPDTLLELNVHIDSSSETLLTDKEVLVPVTCSCSDNFFQAKVNYTVTGNTTLSDTACGVFEGLVKTVTLLEENQNQEVFEVGFVLNVPLKCACPNNGYKYLVTYPLVSGDSVMPVSAKFGISIDDILAVNNLNLDTTVYPETTILVPLRSKPMLNFDVPIFRPPTPGFLPTKQTEGNIKSTKLKKV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G227440
TK1151 IDTkA08G227440
OH-1004 IDLXL04_033048
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G227440
位置Chr08:59239292-59241082 (-)
描述Similar to LYK4: LysM domain receptor-like kinase 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g23770 赖氨酸基序 受体激酶，在几丁质激发子信号传导中充当细胞表面受体，导致先天免疫。
LYK4, a lysin motif receptor-like kinase, is important for chitin signaling and plant innate immunity in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1104/pp.112.201699
At1g61610 推测G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g61610。 暂无已核实直接文献
At1g24030 可能参与植物防御信号传导。 暂无已核实直接文献
At5g65600 促进过氧化氢H(2)O(2)的生成和细胞死亡。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_033048 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程
GO:0002752 cell surface pattern recognition receptor signaling pathway 生物过程
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009101 glycoprotein biosynthetic process 生物过程
GO:0009877 nodulation 生物过程
GO:0010200 response to chitin 生物过程
GO:0032491 detection of molecule of fungal origin 生物过程
GO:0032499 detection of peptidoglycan 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G23770
ath:AT2G33580
ath:AT3G01840
ath:AT3G21630
mtr:11410973
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.739
排名 1 · TkA08G227440 · TK1151
内质网0.118
排名 2 · TkA08G227440 · TK1151
细胞质0.084
排名 3 · TkA08G227440 · TK1151
溶酶体／液泡0.073
排名 4 · TkA08G227440 · TK1151
细胞核0.057
排名 5 · TkA08G227440 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23472LysM2_CERK1_LYK3_4_537-53 aa
PF23446LysM1_NFP_LYK49-107 aa
PF23473LysM3_LYK4_564-83 aa
PF01476LysM64-101 aa
PF23577LysM_RLK64-91 aa
PF23462LysM3_NFP92-103 aa
PF23472LysM2_CERK1_LYK3_4_5111-164 aa
PF23446LysM1_NFP_LYK148-167 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G227440PF23472LysM2_CERK1_LYK3_4_537533.7e-1349.9
TkA08G227440PF23446LysM1_NFP_LYK491071.8e-2177.5
TkA08G227440PF23473LysM3_LYK4_564834.1e-1246.7
TkA08G227440PF01476LysM641011.6e-1041.5
TkA08G227440PF23577LysM_RLK64910.04914.4
TkA08G227440PF23462LysM3_NFP921038e-0627.0
TkA08G227440PF23472LysM2_CERK1_LYK3_4_51111643.7e-1349.9
TkA08G227440PF23446LysM1_NFP_LYK1481671.8e-2177.5
TkA08G227440PF23473LysM3_LYK4_51742224.1e-1246.7
TkA08G227440PF23462LysM3_NFP1742218e-0627.0
TkA08G227440PF23577LysM_RLK1762010.04914.4
TkA08G227440PF01476LysM1822211.6e-1041.5
TkA08G227440PF23446LysM1_NFP_LYK1852221.8e-2177.5
TkA08G227440PF23472LysM2_CERK1_LYK3_4_52002233.7e-1349.9
TkA08G227440PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3834574.6e-1040.0
TkA08G227440PF00069Pkinase3834571.4e-0731.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O64825拟南芥sp|O64825|LYK4_ARATH LysM domain receptor-like kinase 430.100%Swiss-Prot中等置信
Q9SY89拟南芥sp|Q9SY89|Y1661_ARATH Putative G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g6161025.900%Swiss-Prot低置信
Q84M95拟南芥sp|Q84M95|PBL28_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL2825.500%Swiss-Prot低置信
Q9LSL5拟南芥sp|Q9LSL5|LRK92_ARATH L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.227.500%Swiss-Prot低置信

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