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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G193230
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 50493563-50495374 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1434 bp · TkA08G193230|TK1151|cDNA

ATGGCGGCTGTTTGGATGGGCACACAAGCCGATGAATCATTTCCCGACGCCTGGCATTTAGATGCTCAATCATTTAACAACGGTGATAGTGCTACAAATATTCGGTCAAAAGTGTATCTATCCCCTAGACTGTGGTACCTGCGGGTTCATATAATAGAAGCTCAAGAATTGCAGACCATCAATAACAACAAACCGCCGGAAATTGTCGTGAAAGGGAACGAAGATTTGATGTTCGTAGTAGCTGAACCATTCGACGAACA...

CDS

下载 CDS FASTA

1434 bp · TkA08G193230|TK1151|CDS

ATGGCGGCTGTTTGGATGGGCACACAAGCCGATGAATCATTTCCCGACGCCTGGCATTTAGATGCTCAATCATTTAACAACGGTGATAGTGCTACAAATATTCGGTCAAAAGTGTATCTATCCCCTAGACTGTGGTACCTGCGGGTTCATATAATAGAAGCTCAAGAATTGCAGACCATCAATAACAACAAACCGCCGGAAATTGTCGTGAAAGGGAACGAAGATTTGATGTTCGTAGTAGCTGAACCATTCGACGAACA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

477 aa · TkA08G193230|TK1151|PROTEIN

MAAVWMGTQADESFPDAWHLDAQSFNNGDSATNIRSKVYLSPRLWYLRVHIIEAQELQTINNNKPPEIVVKGNEDLMFVVAEPFDEQLVLSVEEMVAKYGQKWIRTRTVIDSLNPKWNEQYTWEVFDPCTVITIVVFDNCMNATATGTGSKDSRIGKVRIRLSTLETDRVYTHSYPLIVLHPSGVKKTGEIQLAVRFTCVSVLNLMQIYSQPLLPTMHYVQPLSIFQQDSLRHQAAQIVTMRLNRAEPPLKREVVEYMLD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G193230
TK1151 IDTkA08G193230
OH-1004 IDLXL04_032648
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)78.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 75.093
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G193230
位置Chr08:50493563-50495374 (-)
描述Similar to FTIP3: FT-interacting protein 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g57880 在顶端分生组织 (SAM) 中的芽干细胞增殖和分化中必需，从而通过控制 STM 在芽顶的亚细胞定位和细胞间运输，决定芽干细胞的维持与其分化为其他地上植物部分之间的适当平衡。
FTIP-Dependent STM Trafficking Regulates Shoot Meristem Development in Arabidopsis.2018 · DOI: 10.1016/j.celrep.2018.04.033
At1g51570 在顶端分生组织 (SAM) 中的芽干细胞增殖和分化中必需，从而通过控制 STM 在芽顶的亚细胞定位和细胞间运输，决定芽干细胞的维持与其分化为其他地上植物部分之间的适当平衡。
FTIP-Dependent STM Trafficking Regulates Shoot Meristem Development in Arabidopsis.2018 · DOI: 10.1016/j.celrep.2018.04.033
At5g12970 可能通过调节其他调控因子的运输发挥信号分子的功能。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0370600 促进转录因子 OSH1 的核转位，在花药发育后期直接抑制生长素生物合成基因 YUCCA4。
OsFTIP7 determines auxin-mediated anther dehiscence in rice.2018 · DOI: 10.1038/s41477-018-0175-0
Os06g0614000 参与长日照特异性促花信号RFT1 从韧皮部伴细胞到筛元件的输出。
OsFTIP1-Mediated Regulation of Florigen Transport in Rice Is Negatively Regulated by the Ubiquitin-Like Domain Kinase OsUbDKγ4.2017 · DOI: 10.1105/tpc.16.00728
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032648 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009663 plasmodesma organization 生物过程
GO:0009901 anther dehiscence 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0009911 positive regulation of flower development 生物过程
GO:0010228 vegetative to reproductive phase transition of meristem 生物过程
GO:0010930 negative regulation of auxin mediated signaling pathway 生物过程
GO:0048574 long-day photoperiodism, flowering 生物过程
GO:0048578 positive regulation of long-day photoperiodism, flowering 生物过程
GO:1902182 shoot apical meristem development 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G51570
ath:AT3G57880
ath:AT5G06850
ath:AT5G12970
dosa:Os05g0370600
osa:4338582
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.492
排名 1 · TkA08G193230 · TK1151
细胞膜0.230
排名 2 · TkA08G193230 · TK1151
细胞质0.153
排名 3 · TkA08G193230 · TK1151
高尔基体0.136
排名 4 · TkA08G193230 · TK1151
细胞核0.077
排名 5 · TkA08G193230 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00168C245-177 aa
PF06398Pex24p264-460 aa
PF11696DUF3292271-336 aa
PF04842DUF639285-332 aa
PF08372PRT_C292-314 aa
PF02453Reticulon297-333 aa
PF08372PRT_C323-477 aa
PF11696DUF3292383-444 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G193230PF00168C2451773.4e-1763.3
TkA08G193230PF06398Pex24p2644608.2e-0832.4
TkA08G193230PF11696DUF32922713360.01114.8
TkA08G193230PF04842DUF6392853320.01915.1
TkA08G193230PF08372PRT_C2923141.1e-71240.4
TkA08G193230PF02453Reticulon2973337.37.2
TkA08G193230PF08372PRT_C3234771.1e-71240.4
TkA08G193230PF11696DUF32923834440.01114.8
TkA08G193230PF04842DUF6394054510.01915.1
TkA08G193230PF02453Reticulon4064427.37.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M2R0拟南芥sp|Q9M2R0|FTIP3_ARATH FT-interacting protein 351.500%Swiss-Prot高置信
Q9C8H3拟南芥sp|Q9C8H3|FTIP4_ARATH FT-interacting protein 450.500%Swiss-Prot高置信
Q9LXU2拟南芥sp|Q9LXU2|MCTP5_ARATH Multiple C2 domain and transmembrane region protein 551.300%Swiss-Prot高置信
Q60EW9水稻sp|Q60EW9|FTIP7_ORYSJ FT-interacting protein 751.600%Swiss-Prot高置信
Q69T22水稻sp|Q69T22|FTIP1_ORYSJ FT-interacting protein 146.600%Swiss-Prot中等置信

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