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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G153030
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 39903273-39908253 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3207 bp · TkA08G153030|TK1151|cDNA

AATCAAAAAGATTGATACACTAGATGGATACAGACATGAAATGAGGTAACAACAAATCCAAACAGTCTATCTTTTTAGTTTACCCCACTCACTTTCCTCTTTTCAGACTAGGGTTTTCTTAAAAACTCCTGAAAATTCCTTTTCAAAGAATCTCTTTCCCCAAAGATCCTCCATTTACTCCTCTACCTTCATCATATTTGGCCGTAGAAAATGAAATCTCTATGTGCTCCTATGGTATACAAGTAAACGATTCAAGAAAT...

CDS

下载 CDS FASTA

2589 bp · TkA08G153030|TK1151|CDS

ATGATGTCGACCTCCTGCAAGGATGGTGTCGACGGAAAATATGTCCGATACACACCGGAGCAGGTCGAAGCACTTGAAAGACTCTACCATGACTGTCCAAAACCCAGTTCTCTCCGCCGTCAGCAGCTCATTCGCGAATGCCCAATTCTCTCCAACATCGAGCCCAAACAAATCAAAGTCTGGTTTCAGAATCGAAGGTACCCGTTACACATCCACAATCAACAAAATCACACATCTTTCGTTTCATACCACCATTTTAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

862 aa · TkA08G153030|TK1151|PROTEIN

MMSTSCKDGVDGKYVRYTPEQVEALERLYHDCPKPSSLRRQQLIRECPILSNIEPKQIKVWFQNRRYPLHIHNQQNHTSFVSYHHFTVMISGFFRCREKQRKEASRLQTVNRKLSAMNKLLMEENDRLQKQVSHLVYENGCFRQHTPNNALATKDTSCESVVTNAQHRLTTKHPPRDASPAGLLSIAEETLTEFLSKATGTAIEWVQMPGMKPGPDSIGIVAISHGCTGVAARACGLVALEPSRVAEILKDRTSWYRDCR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G153030
TK1151 IDTkA08G153030
OH-1004 IDLXL04_032148
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)96.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G153030
位置Chr08:39903273-39908253 (+)
描述Similar to ATHB-15: Homeobox-leucine zipper protein ATHB-15
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g52150 可能参与分生组织发育调节以促进侧生器官形成的转录因子。
Mutations in the microRNA complementarity site of the INCURVATA4 gene perturb meristem function and adaxialize lateral organs in arabidopsis.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.077149
At4g32880 可能参与调控维管组织发育的转录因子。
The arabidopsis ATHB-8 HD-zip protein acts as a differentiation-promoting transcription factor of the vascular meristems.2001 · DOI: 10.1104/pp.126.2.643

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0640800 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2XK30 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2ZMN9 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032148 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0008284 positive regulation of cell population proliferation 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009855 determination of bilateral symmetry 生物过程
GO:0009965 leaf morphogenesis 生物过程
GO:0010014 meristem initiation 生物过程
GO:0010067 procambium histogenesis 生物过程
GO:0010072 primary shoot apical meristem specification 生物过程
GO:0010073 meristem maintenance 生物过程
GO:0010075 regulation of meristem growth 生物过程
GO:0010087 phloem or xylem histogenesis 生物过程
GO:0010089 xylem development 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G52150
ath:AT4G32880
dosa:Os03g0640800
dosa:Os12g0612700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.564
排名 1 · TkA08G153030 · TK1151
细胞质0.325
排名 2 · TkA08G153030 · TK1151
细胞膜0.110
排名 3 · TkA08G153030 · TK1151
内质网0.063
排名 4 · TkA08G153030 · TK1151
质体0.047
排名 5 · TkA08G153030 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00046Homeodomain13-66 aa
PF05920Homeobox_KN32-66 aa
PF30681ZPR90-139 aa
PF00170bZIP_195-135 aa
PF24237INO80E127-144 aa
PF01852START186-394 aa
PF25797PDF2_C334-346 aa
PF25797PDF2_C413-505 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G153030PF00046Homeodomain13664.3e-1452.8
TkA08G153030PF05920Homeobox_KN32660.212.2
TkA08G153030PF30681ZPR901390.01116.7
TkA08G153030PF00170bZIP_1951350.009116.8
TkA08G153030PF24237INO80E1271440.2312.5
TkA08G153030PF01852START1863943e-50171.2
TkA08G153030PF25797PDF2_C3343460.000122.2
TkA08G153030PF25797PDF2_C4135050.000122.2
TkA08G153030PF25797PDF2_C6526980.000122.2
TkA08G153030PF08670MEKHLA7208618.2e-45152.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZU11拟南芥sp|Q9ZU11|ATB15_ARATH Homeobox-leucine zipper protein ATHB-1578.900%Swiss-Prot高置信
Q39123拟南芥sp|Q39123|ATHB8_ARATH Homeobox-leucine zipper protein ATHB-874.700%Swiss-Prot高置信
Q6AST1水稻sp|Q6AST1|HOX32_ORYSJ Homeobox-leucine zipper protein HOX3268.600%Swiss-Prot高置信
A2XK30水稻sp|A2XK30|HOX32_ORYSI Homeobox-leucine zipper protein HOX3268.600%Swiss-Prot高置信
A2ZMN9水稻sp|A2ZMN9|HOX33_ORYSI Homeobox-leucine zipper protein HOX3366.300%Swiss-Prot高置信

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