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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G141970
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 37022506-37023762 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1227 bp · TkA08G141970|TK1151|cDNA

ATGGGTAAGTTGCTGGGACAAGGAACGTTTGCAAAGGTATACCACGCCAGGGACTCCGTCACGGCGGAGAGTGTCGCCGTTAAAGTGATTAAAACAGAGCAGGTAAGAAAGCAAGGTTTCATGGAGCAGATCACCCGTGAAATCGCCATCATGCGGCTCGTCCGCCACCCTAACGTCGTTCAACTGAAAGAAGTCATGGCTACCAAAACCAAGATCTTTCTGGTAATGGAGTACGTCAAAGGCGGGGAATTATTTGCTAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1227 bp · TkA08G141970|TK1151|CDS

ATGGGTAAGTTGCTGGGACAAGGAACGTTTGCAAAGGTATACCACGCCAGGGACTCCGTCACGGCGGAGAGTGTCGCCGTTAAAGTGATTAAAACAGAGCAGGTAAGAAAGCAAGGTTTCATGGAGCAGATCACCCGTGAAATCGCCATCATGCGGCTCGTCCGCCACCCTAACGTCGTTCAACTGAAAGAAGTCATGGCTACCAAAACCAAGATCTTTCTGGTAATGGAGTACGTCAAAGGCGGGGAATTATTTGCTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

408 aa · TkA08G141970|TK1151|PROTEIN

MGKLLGQGTFAKVYHARDSVTAESVAVKVIKTEQVRKQGFMEQITREIAIMRLVRHPNVVQLKEVMATKTKIFLVMEYVKGGELFAKIAKGRLKEDSARKYFQQLISAIDYCHSRGVSHRDLKPENLLLDENENLKISDFGLSALPEQLRNDGMLHTQCGTPAYVAPEVLRRKGYDGARADIWSCGVILYVLLAGCLPFQEVNIMHMYKKIFKAEYEFPPWFSADSRRLISKLLVVDPSQRITVPEIMRAPWLSKVFKTP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G141970
TK1151 IDTkA08G141970
OH-1004 IDLXL04_032018
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)97.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 96.313
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G141970
位置Chr08:37022506-37023762 (-)
描述Similar to CIPK5: CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 5
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g25110 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献
At5g10930 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献
At2g25090 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os09g0418000 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献
Os07g0678600 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032018 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0001666 response to hypoxia 生物过程
GO:0006814 sodium ion transport 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0030007 intracellular potassium ion homeostasis 生物过程
GO:0042538 hyperosmotic salinity response 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0051592 response to calcium ion 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G25090
ath:AT5G10930
ath:AT5G25110
dosa:Os07g0678600
dosa:Os09g0418000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.493
排名 1 · TkA08G141970 · TK1151
细胞核0.374
排名 2 · TkA08G141970 · TK1151
细胞膜0.256
排名 3 · TkA08G141970 · TK1151
内质网0.054
排名 4 · TkA08G141970 · TK1151
高尔基体0.051
排名 5 · TkA08G141970 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr2-249 aa
PF14531Kinase-like2-55 aa
PF00069Pkinase3-253 aa
PF19250DUF58985-126 aa
PF03109ABC18-33 aa
PF01163RIO126-141 aa
PF01636APH39-108 aa
PF03109ABC165-144 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G141970PF07714PK_Tyr_Ser-Thr22492.7e-40139.0
TkA08G141970PF14531Kinase-like2551.2e-0628.8
TkA08G141970PF00069Pkinase32539.5e-78261.9
TkA08G141970PF19250DUF589851260.1812.5
TkA08G141970PF03109ABC18332.1e-0731.1
TkA08G141970PF01163RIO1261410.0002621.4
TkA08G141970PF01636APH391080.002918.1
TkA08G141970PF03109ABC1651442.1e-0731.1
TkA08G141970PF06293Kdo651360.001518.7
TkA08G141970PF12330Haspin_kinase691460.02114.6
TkA08G141970PF14531Kinase-like952031.2e-0628.8
TkA08G141970PF01636APH1151340.002918.1
TkA08G141970PF02992Transposase_211952390.02314.6
TkA08G141970PF03822NAF2773322.6e-1866.6
TkA08G141970PF12330Haspin_kinase3043750.02114.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8W1D5拟南芥sp|Q8W1D5|CIPKP_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 2564.600%Swiss-Prot高置信
Q9LEU7拟南芥sp|Q9LEU7|CIPK5_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 562.400%Swiss-Prot高置信
Q9SEZ7拟南芥sp|Q9SEZ7|CIPKG_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 1658.900%Swiss-Prot高置信
Q6ERS4水稻sp|Q6ERS4|CIPKG_ORYSJ CBL-interacting protein kinase 1658.600%Swiss-Prot高置信
Q7X996水稻sp|Q7X996|CIPK2_ORYSJ CBL-interacting protein kinase 259.000%Swiss-Prot高置信

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