TkA08G139600 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA08G139600

当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 36298152-36300839 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2111 bp · TkA08G139600|TK1151|cDNA

GGAACATTGGTCAAACCATGGGGGCTCACGCTGAACCCCATCTGGCCATTTCTATACTCCTCCACGTCCAGATGTCTGTTAATTTCAATATCAGCCTCTTCCCTTTTACCATTACCATAAAAGCTTTTCAATTTCCACCCACAAAAGATCCAAACCCTTATAATAAAACGGGTCAAATTAAAGGATCTCTTTCAAAGACCCTTCAATCATTACCATATGCGTTTCAGAAATATCTTCACAAATTACACAAAAACTCGTGC...

CDS

下载 CDS FASTA

855 bp · TkA08G139600|TK1151|CDS

ATGACGTCGCCGGCGATCGAGCATTCGAAGGACCACCACCGGCCGGCTGGATTCGGTACTCCGGTGAAGAAACCGGGAGCGGTGTCCATGGACCATGTTTTATCAGCATTGGGGGAAACCAAAGAGGAACGAGAATCGCGAATTCGGAGTTTGTTTAATTTCTTCGATTCATCAAATGCAGGGTATTTGGATTCCGCTCATATCGAGGTAGGGTTATCAGCGTTGCAAATTCCAGCGGATTACAAGTACGCGAAGGAATT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

284 aa · TkA08G139600|TK1151|PROTEIN

MTSPAIEHSKDHHRPAGFGTPVKKPGAVSMDHVLSALGETKEERESRIRSLFNFFDSSNAGYLDSAHIEVGLSALQIPADYKYAKELIRVCDANKDGTVDYQEFKRYMDDKELELYRIFQAIDVEHSGCILPEELYDALAKAGIELDDEELASFVERVDKDNNGIITFEEWRDFLLLYPHEATIENIYQYWERVSLVDIGEQAVIPTGISKHVHASKYLIAGGVAGAASRTATAPSTASKSSSKSKPPKPPSPQQSNPSG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA08G139600`
TK1151 ID	TkA08G139600
OH-1004 ID	LXL04_031978
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	97.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 72.887 / OH-1004 34.966 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA08G139600

位置 Chr08:36298152-36300839 (+)

描述 Similar to APC2: Calcium-dependent mitochondrial ATP-magnesium/phosphate carrier protein 2

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g51050`	钙依赖性线粒体转运蛋白，催化ATP与二价金属阳离子共同转运进入线粒体内膜，同时交换磷酸盐（Pi）。	暂无已核实直接文献
`At5g07320`	钙依赖性线粒体转运蛋白，催化ATP与二价金属阳离子共同转运进入线粒体内膜，同时交换磷酸盐（Pi）。	暂无已核实直接文献
`At5g61810`	钙依赖性线粒体转运蛋白，催化ATP与二价金属阳离子共同转运进入线粒体内膜，同时交换磷酸盐（Pi）。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031978 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006839 mitochondrial transport 生物过程

GO:0015866 ADP transport 生物过程

GO:0015867 ATP transport 生物过程

GO:0034599 cellular response to oxidative stress 生物过程

GO:0035435 phosphate ion transmembrane transport 生物过程

GO:0051503 adenine nucleotide transport 生物过程

GO:0070588 calcium ion transmembrane transport 生物过程

GO:0071277 cellular response to calcium ion 生物过程

GO:0080121 AMP transport 生物过程

GO:1990544 mitochondrial ATP transmembrane transport 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G07320

ath:AT5G51050

ath:AT5G61810

mmu:229731

xtr:496462

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.280

排名 1 · TkA08G139600 · TK1151

质体0.248

排名 2 · TkA08G139600 · TK1151

线粒体0.191

排名 3 · TkA08G139600 · TK1151

细胞核0.139

排名 4 · TkA08G139600 · TK1151

细胞膜0.112

排名 5 · TkA08G139600 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF09275Pertus-S4-tox7-37 aa

PF14658EF-hand_923-59 aa

PF10591SPARC_Ca_bdg38-105 aa

PF22592FCaBP_EF-hand39-79 aa

PF23564EF-hand_FSTL140-66 aa

PF13499EF-hand_745-108 aa

PF13833EF-hand_845-64 aa

PF13405EF-hand_647-73 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA08G139600	`PF09275`	Pertus-S4-tox	7	37	0.31	12.0
TkA08G139600	`PF14658`	EF-hand_9	23	59	0.0062	17.7
TkA08G139600	`PF10591`	SPARC_Ca_bdg	38	105	0.00023	22.2
TkA08G139600	`PF22592`	FCaBP_EF-hand	39	79	0.092	13.8
TkA08G139600	`PF23564`	EF-hand_FSTL1	40	66	0.0034	18.5
TkA08G139600	`PF13499`	EF-hand_7	45	108	1.2e-21	77.5
TkA08G139600	`PF13833`	EF-hand_8	45	64	1.7e-09	38.0
TkA08G139600	`PF13405`	EF-hand_6	47	73	1.6e-19	68.4
TkA08G139600	`PF25825`	SAPC2_N	47	69	0.098	13.3
TkA08G139600	`PF00036`	EF-hand_1	48	66	4.3e-20	70.4
TkA08G139600	`PF13202`	EF-hand_5	48	57	3.6e-10	39.5
TkA08G139600	`PF12763`	EH	48	67	0.001	19.7
TkA08G139600	`PF24548`	EF_EFCAB10_C	48	73	0.018	15.4
TkA08G139600	`PF14788`	EF-hand_10	49	70	8.8e-05	23.2
TkA08G139600	`PF12763`	EH	50	105	0.001	19.7
TkA08G139600	`PF30624`	EF_SSP120	50	104	0.0032	18.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9FI43`	拟南芥	sp\|Q9FI43\|MAPC2_ARATH Calcium-dependent mitochondrial ATP-magnesium/phosphate carrier protein 2	80.000%	Swiss-Prot	高置信
`Q9LY28`	拟南芥	sp\|Q9LY28\|MAPC3_ARATH Calcium-dependent mitochondrial ATP-magnesium/phosphate carrier protein 3	73.000%	Swiss-Prot	高置信
`Q9FLS8`	拟南芥	sp\|Q9FLS8\|MAPC1_ARATH Calcium-dependent mitochondrial ATP-magnesium/phosphate carrier protein 1	70.200%	Swiss-Prot	高置信

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