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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G075350
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 19358213-19359940 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1602 bp · TkA08G075350|TK1151|cDNA

ATTCTAGAAGCACATCTCCCATTTGACTATTTTGGTTACCCATCAACACTGTTAAGCAAAGAAAAAGTAAAAACCCTTCTCCAAGTATTTCACCATCCCATATATAAATCAAACGCCAAAATAATCCATCAAACCAAGGGAGAATCTACATACAGGAGAATAAAGCTTCAGACAGCAACAGCCATGGACGACGATAATATCCCATTGTTGGACCTCGAAAAATTGAAGGTTATATCGCCGTTAGGTCGCGGAGCTAAAGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1383 bp · TkA08G075350|TK1151|CDS

ATTCTAGAAGCACATCTCCCATTTGACTATTTTGGTTACCCATCAACACTGTTAAGCAAAGAAAAAGTAAAAACCCTTCTCCAAGTATTTCACCATCCCATATATAAATCAAACGCCAAAATAATCCATCAAACCAAGGGAGAATCTACATACAGGAGAATAAAGCTTCAGACAGCAACAGCCATGGACGACGATAATATCCCATTGTTGGACCTCGAAAAATTGAAGGTTATATCGCCGTTAGGTCGCGGAGCTAAAGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

460 aa · TkA08G075350|TK1151|PROTEIN

ILEAHLPFDYFGYPSTLLSKEKVKTLLQVFHHPIYKSNAKIIHQTKGESTYRRIKLQTATAMDDDNIPLLDLEKLKVISPLGRGAKGVVFLVQNEASDGELLALKVISRASIKMKVKDKDSDGSEYKRICFEKEVLRRCQHPLLPKLRGVLSTESIVGYAIDYCPGRDLNYLRKQQTEKMFSDDLIRFYAAELVLALEYLHGLGIVYRDLKPENIMIQENGHLMLIDFDLSTKLPPKPHSRSPSPKTTSTPKPDALTKKK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G075350
TK1151 IDTkA08G075350
OH-1004 IDLXL04_036731
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)72.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 83.261 / OH-1004 96.962
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G075350
位置Chr08:19358213-19359940 (-)
描述Similar to OXI1: Serine/threonine-protein kinase OXI1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g25250 参与氧化爆发介导的信号传导。
OXI1 kinase is necessary for oxidative burst-mediated signalling in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1038/nature02353
The Arabidopsis protein kinase Pto-interacting 1-4 is a common target of the oxidative signal-inducible 1 and mitogen-activated protein kinases.2011 · DOI: 10.1111/j.1742-4658.2011.08033.x
At1g51170 通过抑制方向异常的生长，调控胚珠珠被在平面内的发育。 暂无已核实直接文献
At3g20830 调控胚珠珠被在平面内的发育。 暂无已核实直接文献
At5g58140 在光诱导运动的信号传导通路中，作为蓝光光受体的蛋白激酶。
Arabidopsis NPL1: a phototropin homolog controlling the chloroplast high-light avoidance response.2001 · DOI: 10.1126/science.291.5511.2138
Arabidopsis nph1 and npl1: blue light receptors that mediate both phototropism and chloroplast relocation.2001 · DOI: 10.1073/pnas.101137598
Phot1 and phot2 mediate blue light-induced transient increases in cytosolic Ca2+ differently in Arabidopsis leaves.2003 · DOI: 10.1073/pnas.1336802100
A transgene encoding a blue-light receptor, phot1, restores blue-light responses in the Arabidopsis phot1 phot2 double mutant.2004 · DOI: 10.1093/jxb/erh044
Functional analysis of each blue light receptor, cry1, cry2, phot1, and phot2, by using combinatorial multiple mutants in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1073/pnas.0305984101
RPT2 is a signal transducer involved in phototropic response and stomatal opening by association with phototropin 1 in Arabidopsis thaliana.2004 · DOI: 10.1105/tpc.019901
Biochemical characterization of plasma membrane H+-ATPase activation in guard cell protoplasts of Arabidopsis thaliana in response to blue light.2005 · DOI: 10.1093/pcp/pci104
An ATP-Binding Cassette Transporter, ABCB19, Regulates Leaf Position and Morphology during Phototropin1-Mediated Blue Light Responses.2020 · DOI: 10.1104/pp.20.00223

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0304200 蛋白激酶，在光向性反应的信号转导通路中作为蓝光光受体。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036731 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0036290 protein trans-autophosphorylation 生物过程
GO:0042542 response to hydrogen peroxide 生物过程
GO:0051782 negative regulation of cell division 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:0080060 integument development 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G51170
ath:AT3G20830
ath:AT3G25250
dosa:Os06g0291600
osa:4340792
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.525
排名 1 · TkA08G075350 · TK1151
细胞核0.507
排名 2 · TkA08G075350 · TK1151
线粒体0.058
排名 3 · TkA08G075350 · TK1151
细胞膜0.055
排名 4 · TkA08G075350 · TK1151
内质网0.033
排名 5 · TkA08G075350 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF10707YrbL-PhoP_reg29-56 aa
PF06293Kdo62-76 aa
PF13095FTA273-116 aa
PF14531Kinase-like75-111 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr76-238 aa
PF00069Pkinase77-239 aa
PF10707YrbL-PhoP_reg79-221 aa
PF18362THB120-132 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G075350PF10707YrbL-PhoP_reg29560.00218.5
TkA08G075350PF06293Kdo62760.03514.3
TkA08G075350PF13095FTA2731160.04314.2
TkA08G075350PF14531Kinase-like751110.0002321.3
TkA08G075350PF07714PK_Tyr_Ser-Thr762384.4e-2485.9
TkA08G075350PF00069Pkinase772392.8e-55188.3
TkA08G075350PF10707YrbL-PhoP_reg792210.00218.5
TkA08G075350PF18362THB1201320.2311.8
TkA08G075350PF03109ABC11602370.003917.1
TkA08G075350PF06293Kdo1822320.03514.3
TkA08G075350PF13095FTA21912220.04314.2
TkA08G075350PF14531Kinase-like1932290.0002321.3
TkA08G075350PF17667Pkinase_fungal1962410.001518.1
TkA08G075350PF01636APH2012320.005217.3
TkA08G075350PF00454PI3_PI4_kinase2122320.1612.6
TkA08G075350PF00069Pkinase2983962.8e-55188.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LSF1拟南芥sp|Q9LSF1|OXI1_ARATH Serine/threonine-protein kinase OXI161.600%Swiss-Prot高置信
Q9SYB9拟南芥sp|Q9SYB9|UNC_ARATH Serine/threonine-protein kinase UCN44.700%Swiss-Prot中等置信
Q9LT38拟南芥sp|Q9LT38|UNCL_ARATH Serine/threonine-protein kinase UCNL44.200%Swiss-Prot中等置信
P93025拟南芥sp|P93025|PHOT2_ARATH Phototropin-240.300%Swiss-Prot中等置信
Q9ST27水稻sp|Q9ST27|PHOT2_ORYSJ Phototropin-239.100%Swiss-Prot中等置信

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