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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G037580
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 9569225-9571977 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1536 bp · TkA08G037580|TK1151|cDNA

TTATAATTAAGAAAATAAATTGTTGATGACTAAAAATATACAATATATTATTTATTTATTTTGTTGGATTTTGTCCAAAATAGAAAGTCGGTCGCCGTTTTTAATAATGTTTTGAAGGAAGGAAGTTATTAGTTAAAAGGCGATATTGCCTAAACAAATGGTCCGATCCACCCCATCAGGTTTTCGGTGTTTATTCGGGCACGACAGCAGCACATCACTTCTGCAGTTCTGCTTCGCTCTCGCCTCTCGTCTCCACGTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

873 bp · TkA08G037580|TK1151|CDS

ATGTCCTTCAGACTGGTTGCCAGGAGATTATTGAGGACCAAACTCTTACCCATTTTCACTCCTGCATCTACACTGCATTCACATGCCACTAGCTTTGGATTTAAAGAAGTAAATGAAGACGAAAAAAGCCAACTTGTTGGTAATGTCTTCACTAAAGTTGCATCAAATTATGACATCATGAATGATTTGATGAGTGGTGGACTCCATAGGCTATGGAAAGAAAGACTTGTTTCAAAATTGAGCCCGTTTCCTGGAATGAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

290 aa · TkA08G037580|TK1151|PROTEIN

MSFRLVARRLLRTKLLPIFTPASTLHSHATSFGFKEVNEDEKSQLVGNVFTKVASNYDIMNDLMSGGLHRLWKERLVSKLSPFPGMKHLDVAGGTGDVAFRILETINSVNRRAIADTLEDDLQQETQIYVCDINPNMLDVGKKRAQQRGLGEQGSLIWVEGDAEKLNFEDNSMDGYTIAFGIRNVTHIEKVLAEAYRVLKKGGRFLCLELSHVEAPVFKQLYDYYSFSVIPVLGELVAGDRDSYQYLVESVRRFPPQEVF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G037580
TK1151 IDTkA08G037580
OH-1004 IDLXL04_017945
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G037580
位置Chr08:9569225-9571977 (-)
描述Similar to COQ5: 2-methoxy-6-polyprenyl-1,4-benzoquinol methylase, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g57300 甲基转移酶，参与将2-多异戊烯基-6-甲氧基-1,4-苯醌醇（DDMQH2）转化为2-多异戊烯基-3-甲基-6-甲氧基-1,4-苯醌醇（DMQH2）。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0976600 甲基转移酶，参与将2-多异戊烯基-6-甲氧基-1,4-苯醌醇（DDMQH2）转化为2-多异戊烯基-3-甲基-6-甲氧基-1,4-苯醌醇（DMQH2）。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017945 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006744 ubiquinone biosynthetic process 生物过程
GO:0032259 methylation 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分
GO:0005759 mitochondrial matrix 细胞组分
GO:0031314 extrinsic component of mitochondrial inner membrane 细胞组分
GO:0032991 protein-containing complex 细胞组分
GO:0008425 2-methoxy-6-polyprenyl-1,4-benzoquinol methyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G57300
bta:533208
dosa:Os01g0976600
gga:416975
hsa:84274
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.951
排名 1 · TkA08G037580 · TK1151
细胞质0.075
排名 2 · TkA08G037580 · TK1151
细胞核0.058
排名 3 · TkA08G037580 · TK1151
细胞膜0.034
排名 4 · TkA08G037580 · TK1151
质体0.016
排名 5 · TkA08G037580 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF20922Anamorsin_N23-56 aa
PF05148Methyltransf_824-43 aa
PF01209Ubie_methyltran41-289 aa
PF13847Methyltransf_3184-220 aa
PF08241Methyltransf_1189-102 aa
PF13649Methyltransf_2589-106 aa
PF08242Methyltransf_1289-205 aa
PF01170UPF0020114-174 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G037580PF20922Anamorsin_N23560.1412.6
TkA08G037580PF05148Methyltransf_824430.01815.6
TkA08G037580PF01209Ubie_methyltran412898.4e-85284.5
TkA08G037580PF13847Methyltransf_31842201.1e-1042.2
TkA08G037580PF08241Methyltransf_11891026.3e-1762.7
TkA08G037580PF13649Methyltransf_25891062.7e-1557.6
TkA08G037580PF08242Methyltransf_12892058.1e-0936.8
TkA08G037580PF01170UPF00201141740.07113.5
TkA08G037580PF13649Methyltransf_251212032.7e-1557.6
TkA08G037580PF08241Methyltransf_111262076.3e-1762.7
TkA08G037580PF20922Anamorsin_N1511690.1412.6
TkA08G037580PF05148Methyltransf_81622100.01815.6
TkA08G037580PF20922Anamorsin_N1842090.1412.6
TkA08G037580PF05148Methyltransf_82472730.01815.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LVC8拟南芥sp|Q9LVC8|COQ5_ARATH 2-methoxy-6-polyprenyl-1,4-benzoquinol methylase, mitochondrial76.800%Swiss-Prot高置信
Q5JNC0水稻sp|Q5JNC0|COQ5_ORYSJ 2-methoxy-6-polyprenyl-1,4-benzoquinol methylase, mitochondrial71.100%Swiss-Prot高置信

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