RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G036270
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 9248733-9255224 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3091 bp · TkA08G036270|TK1151|cDNA

GTAATTATATGTTTTTATTTCTCATTTCTCTTCATGCCTAAATTGATACCATTTCTTTAAAAATGTTTAATTTATATTCTTTTCTTTGTATGCATTTGATAGAGGTTTCTGTTAGATGCTTGTCGCGATACAACATTGATCATTTTAATGGTAGCTGCTGCTGCTTCTTTGGCACTTGGTATAAAATCAGAGGGGATAAAAGAAGGGTGGTATGATGGTGGAAGCATAGCTTTGGCTGTTATAATTGTGATTGTCGTTAC...

CDS

下载 CDS FASTA

3270 bp · TkA08G036270|TK1151|CDS

ATGAGTAGTGGTGGCTCACCCTACCGCCGACACCCGAAGGATTTGGAGTCCGGTGGTGGAAGCGGTGGAGGTTCTCAAGACTATGGGTCTGCTTGTGACCCTTTTGACATTGTTAGGACTAAAAGTGCATCAGTCGACAGTCTTAAAAGATGGAGGCAAGCGGCACTGGTGTTGAATGCTTCCCGTCGATTTCGCTACACCTTGGATTTGAAAAAGGAGGAAGAGAAGAAACAAATCATCGCAAAAATCAGAACTCATGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1089 aa · TkA08G036270|TK1151|PROTEIN

MSSGGSPYRRHPKDLESGGGSGGGSQDYGSACDPFDIVRTKSASVDSLKRWRQAALVLNASRRFRYTLDLKKEEEKKQIIAKIRTHAQVIRAAYLFQQHGEKTDGTPKVPPSPIPTGNYNVSPEQLASMTRDHDMSALQNFDGVKGLSEMLKTNPDKGIDDDESNILDRKNVFGSNTYPRKKGRSFWRFLLDACRDTTLIILMVAAAASLALGIKSEGIKEGWYDGGSIALAVIIVIVVTAISDYKQSLQFQNLNEEKQN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G036270
TK1151 IDTkA08G036270
OH-1004 IDLXL04_017966
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G036270
位置Chr08:9248733-9255224 (-)
描述Similar to ACA8: Calcium-transporting ATPase 8, plasma membrane-type
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g57110 这种依赖镁的酶催化ATP的水解，同时将钙从胞质转运出细胞。 暂无已核实直接文献
At3g21180 这种依赖镁的酶催化ATP水解，并伴随钙离子从胞质转运出细胞或进入细胞器。 暂无已核实直接文献
At4g29900 这种镁依赖性酶催化ATP的水解，同时将钙从胞质转运到内质网。 暂无已核实直接文献
At3g63380 这种依赖镁的酶催化ATP水解，并伴随钙离子从胞质转运出细胞或进入细胞器。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0605500 这种依赖镁的酶催化 ATP 水解，并伴随钙从细胞质外运入内质网或细胞器（通过相似性）。 暂无已核实直接文献
Os12g0136900 这种依赖镁的酶催化ATP水解，同时将钙从胞质转运出细胞、进入内质网或进入细胞器。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017966 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009567 double fertilization forming a zygote and endosperm 生物过程
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0051480 regulation of cytosolic calcium ion concentration 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0005388 P-type calcium transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G21180
ath:AT3G63380
ath:AT4G29900
ath:AT5G57110
dosa:Os04g0605500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.634
排名 1 · TkA08G036270 · TK1151
内质网0.147
排名 2 · TkA08G036270 · TK1151
溶酶体／液泡0.126
排名 3 · TkA08G036270 · TK1151
细胞质0.111
排名 4 · TkA08G036270 · TK1151
高尔基体0.088
排名 5 · TkA08G036270 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12515CaATP_NAI33-75 aa
PF00690Cation_ATPase_N143-209 aa
PF00689Cation_ATPase_C203-242 aa
PF00122E1-E2_ATPase262-358 aa
PF00689Cation_ATPase_C377-426 aa
PF00702Hydrolase482-808 aa
PF13246Cation_ATPase524-697 aa
PF08282Hydrolase_3700-730 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G036270PF12515CaATP_NAI33754.4e-1762.0
TkA08G036270PF00690Cation_ATPase_N1432093.9e-1349.5
TkA08G036270PF00689Cation_ATPase_C2032427.3e-43147.1
TkA08G036270PF00122E1-E2_ATPase2623587e-2071.5
TkA08G036270PF00689Cation_ATPase_C3774267.3e-43147.1
TkA08G036270PF00702Hydrolase4828081.9e-1455.2
TkA08G036270PF13246Cation_ATPase5246979.9e-36123.9
TkA08G036270PF08282Hydrolase_37007300.002218.5
TkA08G036270PF08282Hydrolase_37888400.002218.5
TkA08G036270PF00689Cation_ATPase_C87910557.3e-43147.1
TkA08G036270PF00702Hydrolase9419831.9e-1455.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LF79拟南芥sp|Q9LF79|ACA8_ARATH Calcium-transporting ATPase 8, plasma membrane-type72.400%Swiss-Prot高置信
Q9LU41拟南芥sp|Q9LU41|ACA9_ARATH Calcium-transporting ATPase 9, plasma membrane-type72.600%Swiss-Prot高置信
Q9SZR1拟南芥sp|Q9SZR1|ACA10_ARATH Calcium-transporting ATPase 10, plasma membrane-type72.200%Swiss-Prot高置信
Q9LY77拟南芥sp|Q9LY77|ACA12_ARATH Calcium-transporting ATPase 12, plasma membrane-type52.100%Swiss-Prot高置信
Q7X8B5水稻sp|Q7X8B5|ACA5_ORYSJ Calcium-transporting ATPase 5, plasma membrane-type72.500%Swiss-Prot高置信
Q2QY12水稻sp|Q2QY12|ACA9_ORYSJ Probable calcium-transporting ATPase 9, plasma membrane-type49.300%Swiss-Prot中等置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看