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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G033200
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 8445136-8449462 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1075 bp · TkA08G033200|TK1151|cDNA

CTTTTTCAGTCGGCTTTGATTGCTTTAGCTGCCCATGCTTCTGACCCCACTGAAGCCGAACGACTCAAGTTTCTTGCATCTCCAGCTGGCAAGGATGAATACTCTCAATGGATAGTTTCAAGTCAAAGAAGTCTTCTAGAAGTAATGGAAGCTTTCCCTTCAGCCAAACCGCCACTTGGCGTCTTCTTTGCTGCTGTTGCCCCTCGCTTACAGCCTCGTTACTACTCCATTTCCTCCTCGCCAAAGTTTGCACCTACAAG...

CDS

下载 CDS FASTA

2109 bp · TkA08G033200|TK1151|CDS

ATGCAATCTGAATCCGTGGAAACATCGCTGTTTGATTTGTTGACCGCAGCTCTCAAGGGGAAACTTATAGGCAGTGTTAACGGATCGGATAGCGGAGACTCAACGATGCCGCTGGCTTTGGCGACGATTTTGGAAAATCGTGAGCTCTTGGTGATACTGACAACGTCAGTTGCTGTTTTGGTAGGATGTTTTGTTGTTCTGGTGTGGAAAAGATCTGGGAAGAAGTCGGTTAAGGAATTGGAGCCACCGAAGATCGTTGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

702 aa · TkA08G033200|TK1151|PROTEIN

MQSESVETSLFDLLTAALKGKLIGSVNGSDSGDSTMPLALATILENRELLVILTTSVAVLVGCFVVLVWKRSGKKSVKELEPPKIVVPKRQLEEEVDDGKKKVTIFFGTQTGTAEGFAKALFEEAKVRYEKASFKVIDLDDYAADDDEYEQKLKKESFAFFFLATYGDGEPTDNAARFYKWFTEGEEKAQFNKLHYGVFGLGNRQYEHFNKIAKVVDDGLADQGAKRLVPVGLGDDDQSIEDDFSAWKELVWPELDQLLR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G033200
TK1151 IDTkA08G033200
OH-1004 IDLXL04_018020
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)95.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G033200
位置Chr08:8445136-8449462 (-)
描述Similar to CPR: NADPH--cytochrome P450 reductase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g30210 该酶对微体中从NADP到细胞色素P450的电子转移必不可少。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0653400 该酶在微体中将电子从 NADP 转移到细胞色素 P450 所必需（通过相似性推测）。
Rice P450 reductases differentially affect P450-mediated metabolism in bacterial expression systems.2013 · DOI: 10.1007/s00449-012-0787-0
Os08g0243500 该酶在微体中将电子从 NADP 转移到细胞色素 P450 所必需（通过相似性推测）。
Rice P450 reductases differentially affect P450-mediated metabolism in bacterial expression systems.2013 · DOI: 10.1007/s00449-012-0787-0
Os09g0558900 该酶在微体中将电子从 NADP 转移到细胞色素 P450 所必需（通过相似性推测）。
Rice P450 reductases differentially affect P450-mediated metabolism in bacterial expression systems.2013 · DOI: 10.1007/s00449-012-0787-0
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018020 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009698 phenylpropanoid metabolic process 生物过程
GO:0051762 sesquiterpene biosynthetic process 生物过程
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0003958 NADPH-hemoprotein reductase activity 分子功能
GO:0010181 FMN binding 分子功能
GO:0016491 oxidoreductase activity 分子功能
GO:0050660 flavin adenine dinucleotide binding 分子功能
GO:0050661 NADP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G30210
dosa:Os09g0558900
osa:4347838
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.371
排名 1 · TkA08G033200 · TK1151
细胞质0.316
排名 2 · TkA08G033200 · TK1151
线粒体0.181
排名 3 · TkA08G033200 · TK1151
细胞核0.144
排名 4 · TkA08G033200 · TK1151
高尔基体0.133
排名 5 · TkA08G033200 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00175NAD_binding_197-152 aa
PF02550AcetylCoA_hydro100-156 aa
PF00258Flavodoxin_1105-247 aa
PF00175NAD_binding_1257-318 aa
PF00667FAD_binding_1303-524 aa
PF00175NAD_binding_1556-666 aa
PF02550AcetylCoA_hydro635-688 aa
PF00258Flavodoxin_1654-670 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G033200PF00175NAD_binding_1971521.5e-1764.9
TkA08G033200PF02550AcetylCoA_hydro1001560.05813.7
TkA08G033200PF00258Flavodoxin_11052472.9e-31109.2
TkA08G033200PF00175NAD_binding_12573181.5e-1764.9
TkA08G033200PF00667FAD_binding_13035243.2e-70236.9
TkA08G033200PF00175NAD_binding_15566661.5e-1764.9
TkA08G033200PF02550AcetylCoA_hydro6356880.05813.7
TkA08G033200PF00258Flavodoxin_16546702.9e-31109.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SUM3拟南芥sp|Q9SUM3|NCPR2_ARATH NADPH--cytochrome P450 reductase 272.300%Swiss-Prot高置信
Q7X7K8水稻sp|Q7X7K8|NCPR1_ORYSJ NADPH--cytochrome P450 reductase 179.500%Swiss-Prot高置信
Q0J705水稻sp|Q0J705|NCPR2_ORYSJ NADPH--cytochrome P450 reductase 279.900%Swiss-Prot高置信
Q653S9水稻sp|Q653S9|NCPR3_ORYSJ NADPH--cytochrome P450 reductase 379.200%Swiss-Prot高置信

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