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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G420990
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 106381464-106384002 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1262 bp · TkA07G420990|TK1151|cDNA

AAATCCTACGCGGCAATTTAAACTAGTATTTGTGACAGATGCTTCCTGTAGGCAGGTGCCGGCCACGCTCCTCCGTAGACCTTAACCCTCTATAACAACTATTCTATTGCTCGCCACACGCCTCCCTTTCTCCTCGACGGCGCGTCACCGTCTACCTCTCAATTTATCTTCAAGGTATGATCGTCGTGTGCTGTAGTTCGTAGATCGGTGGAGGCACACGATTTGTTTATGTGTTTGTGAGTTTAGTTTGATATTCTGCG...

CDS

下载 CDS FASTA

600 bp · TkA07G420990|TK1151|CDS

ATGGGAGCAGAAAGATCATCTACTTGCTTGCACACCACCAAGAAGAATCCAGGTAAAGTTCCCAAAAGAATTCACAAGGCTGAAAGGGAGAAAATGAAACGTGAACATTTAAATGAACTCTTCCTTGAATTAGCTGGTGCACTTGAACTCTCAGAGCAAAACAGTGGGAAGGCGTCTATATTGGGTGAAACTACTCGTGCTGTGAAGGACATGATTGATCAAATCAAATCCCTCAAAAAGGAAAATGCAACTTTACTCTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

199 aa · TkA07G420990|TK1151|PROTEIN

MGAERSSTCLHTTKKNPGKVPKRIHKAEREKMKREHLNELFLELAGALELSEQNSGKASILGETTRAVKDMIDQIKSLKKENATLLSESQYVMVERNELEDETCGLQKQITELKNIIKERTVNVNVNVSAQTNLDLNAPAVESHEPQYINPVFVIPACHPPSVAIDNNTPMTNVSKPYPRYPTPSDSWPLQLLEKPSRV

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G420990
TK1151 IDTkA07G420990
OH-1004 IDLXL04_030645
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G420990
位置Chr07:106381464-106384002 (+)
描述Similar to BHLH47: Transcription factor bHLH47
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g47640 转录因子 bHLH47。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0628500 在盐胁迫耐受中起正调控作用的转录因子。
OsJAZ9 acts as a transcriptional regulator in jasmonate signaling and modulates salt stress tolerance in rice.2015 · DOI: 10.1016/j.plantsci.2014.12.010
Os03g0379300 转录因子，作为缺铁反应的负调节因子。
Identification of a novel iron regulated basic helix-loop-helix protein involved in Fe homeostasis in Oryza sativa.2010 · DOI: 10.1186/1471-2229-10-166
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030645 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006879 intracellular iron ion homeostasis 生物过程
GO:0010039 response to iron ion 生物过程
GO:0010106 cellular response to iron ion starvation 生物过程
GO:0060586 multicellular organismal-level iron ion homeostasis 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
GO:0046983 protein dimerization activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G19860
ath:AT3G47640
ath:AT4G36060
dosa:Os03g0379300
dosa:Os07g0628500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.957
排名 1 · TkA07G420990 · TK1151
细胞质0.148
排名 2 · TkA07G420990 · TK1151
细胞膜0.023
排名 3 · TkA07G420990 · TK1151
内质网0.013
排名 4 · TkA07G420990 · TK1151
质体0.008
排名 5 · TkA07G420990 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF17675APG6_N11-47 aa
PF11661DUF298613-34 aa
PF00010HLH22-70 aa
PF14817HAUS522-142 aa
PF13851GAS23-123 aa
PF28690SPACA6_N23-83 aa
PF23177bHLH_IRO325-107 aa
PF14662KASH_CCD27-125 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G420990PF17675APG6_N11471.410.1
TkA07G420990PF11661DUF298613340.03415.3
TkA07G420990PF00010HLH22700.0002721.4
TkA07G420990PF14817HAUS5221420.04613.2
TkA07G420990PF13851GAS231230.00816.3
TkA07G420990PF28690SPACA6_N23830.9710.8
TkA07G420990PF23177bHLH_IRO3251078.7e-1865.2
TkA07G420990PF14662KASH_CCD271250.0003221.4
TkA07G420990PF27821CEP162_helical_328300.2912.1
TkA07G420990PF06156YabA28391.710.0
TkA07G420990PF06005ZapB28444.18.7
TkA07G420990PF10473CENP-F_leu_zip291160.4311.4
TkA07G420990PF29997SPC25_N581250.05814.4
TkA07G420990PF27821CEP162_helical_3581170.2912.1
TkA07G420990PF17675APG6_N591151.410.1
TkA07G420990PF12325TMF_TATA_bd621190.02115.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SN74拟南芥sp|Q9SN74|BH047_ARATH Transcription factor bHLH4771.600%Swiss-Prot低置信
Q69V10水稻sp|Q69V10|BH062_ORYSJ Transcription factor BHLH06238.400%Swiss-Prot中等置信
Q10KL8水稻sp|Q10KL8|IRO3_ORYSJ Protein IRON-RELATED TRANSCRIPTION FACTOR 355.700%Swiss-Prot低置信

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