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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G397510
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 99874165-99876658 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1097 bp · TkA07G397510|TK1151|cDNA

CCAACTACACACATTATCAAGGGAAATCAATCATTTCATGAATAATTAATGGGGAGAGTAAAACTTCAGATCAAGAAAATAGAAAATACTACAAATAGGCAGGTGACTTTCTCAAAAAGAAGAAATGGATTGATCAAGAAAGCTTATGAACTATCTGTTCTATGTGATGTGGATGTTGCTCTCATCATGTTTTCCCCCTCAGGAAGAGCTAGCATTTTTTCTGGAAGTAGAAGTATCGAAGAAATTATGGGACGATATAT...

CDS

下载 CDS FASTA

900 bp · TkA07G397510|TK1151|CDS

ATGGGGAGAGTAAAACTTCAGATCAAGAAAATAGAAAATACTACAAATAGGCAGGTGACTTTCTCAAAAAGAAGAAATGGATTGATCAAGAAAGCTTATGAACTATCTGTTCTATGTGATGTGGATGTTGCTCTCATCATGTTTTCCCCCTCAGGAAGAGCTAGCATTTTTTCTGGAAGTAGAAGTATCGAAGAAATTATGGGACGATATATAAATCTTCCAGAGCATGAAAGAGGAAGGTTGCAGAACCAAGAGCAACT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

299 aa · TkA07G397510|TK1151|PROTEIN

MGRVKLQIKKIENTTNRQVTFSKRRNGLIKKAYELSVLCDVDVALIMFSPSGRASIFSGSRSIEEIMGRYINLPEHERGRLQNQEQLERALGRLKKESQDHQNHNQARNSSANADSQVQEIQQEIVRCKSQLMEMEKRLRIFEGDPSEITALCEAEYREQVLQESLKRVRHRKRALAEKYNSRDAESNTQASSINVSNMVTTNPSNIFDWLPPKDPQVQIMNFMNFNGIPPHRQNENVNRANVIDHDNNVNVQRSEFGQI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G397510
TK1151 IDTkA07G397510
OH-1004 IDLXL04_030322
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G397510
位置Chr07:99874165-99876658 (+)
描述Similar to AGL66: Agamous-like MADS-box protein AGL66
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g22130 可能的转录因子，与 MADS-box 蛋白 AGL30 和 AGL65 形成异二聚体，参与花粉发育后期花粉成熟和花粉管生长的调节。
MIKC* MADS domain heterodimers are required for pollen maturation and tube growth in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.135806
At1g77980 可能的转录因子，与 MADS-box 蛋白 AGL30 形成异二聚体，参与花粉发育后期花粉成熟和花粉管生长的调节。
MIKC* MADS domain heterodimers are required for pollen maturation and tube growth in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.135806
At1g18750 可能的转录因子，与 MADS-box 蛋白 AGL104 形成异源二聚体，参与花粉发育晚期的成熟调控及花粉管生长。
MIKC* MADS domain heterodimers are required for pollen maturation and tube growth in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.135806
At2g03060 可能的转录因子，与 MADS-box 蛋白 AGL66 和 AGL104 形成异二聚体，参与花粉发育后期花粉成熟和花粉管生长的调节。
MIKC* MADS domain heterodimers are required for pollen maturation and tube growth in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.135806

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030322 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0010152 pollen maturation 生物过程
GO:0045944 positive regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0048608 reproductive structure development 生物过程
GO:0080092 regulation of pollen tube growth 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000977 RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding 分子功能
GO:0000978 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G18750
ath:AT1G22130
ath:AT1G77980
ath:AT2G03060
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.973
排名 1 · TkA07G397510 · TK1151
细胞质0.098
排名 2 · TkA07G397510 · TK1151
细胞膜0.020
排名 3 · TkA07G397510 · TK1151
内质网0.013
排名 4 · TkA07G397510 · TK1151
质体0.010
排名 5 · TkA07G397510 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00319SRF-TF10-54 aa
PF03961FapA14-135 aa
PF23204KIF21A_2nd59-87 aa
PF23203KIF21A63-152 aa
PF10386DUF244170-162 aa
PF07851TMEM120A-B81-139 aa
PF01486K-box83-105 aa
PF02601Exonuc_VII_L83-198 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G397510PF00319SRF-TF10547.6e-2690.0
TkA07G397510PF03961FapA141350.5210.6
TkA07G397510PF23204KIF21A_2nd59871.99.5
TkA07G397510PF23203KIF21A631520.2411.9
TkA07G397510PF10386DUF2441701620.212.4
TkA07G397510PF07851TMEM120A-B811394.17.3
TkA07G397510PF01486K-box831050.000421.2
TkA07G397510PF02601Exonuc_VII_L831980.3910.9
TkA07G397510PF01496V_ATPase_I831900.998.0
TkA07G397510PF09177STX6_10_61_N841680.06214.6
TkA07G397510PF23204KIF21A_2nd851371.99.5
TkA07G397510PF15456Uds1911391.49.8
TkA07G397510PF07544Med91051820.1113.3
TkA07G397510PF10203Pet191_N1061400.1612.9
TkA07G397510PF01486K-box1141780.000421.2
TkA07G397510PF03961FapA1142000.5210.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LM46拟南芥sp|Q9LM46|AG104_ARATH Agamous-like MADS-box protein AGL10450.300%Swiss-Prot中等置信
Q1PFC2拟南芥sp|Q1PFC2|AGL66_ARATH Agamous-like MADS-box protein AGL6646.600%Swiss-Prot中等置信
Q7X9I0拟南芥sp|Q7X9I0|AGL65_ARATH Agamous-like MADS-box protein AGL6543.700%Swiss-Prot低置信
Q1PFA4拟南芥sp|Q1PFA4|AGL30_ARATH Agamous-like MADS-box protein AGL3057.000%Swiss-Prot低置信

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