TkA07G397200 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G397200

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 99767735-99769816 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1485 bp · TkA07G397200|TK1151|cDNA

CGGGTTTCTAACGCATATGCTTTGCACCTTTTTTGGCAAGACTAAGAAGATACAGCCTACAGGGGATACAAATAGGGGTGGGGAGGGGTCTAATGGCGTGAAGAGGAGAAAGCCAATGACGTTTGGGAAAGCGAGATAAAAAGAGATCCAAGATCATCATGTTGAAGAAGAGCCACCTTTCGATTTGGATCTGAGCTGGGCGATTGAAAACCCGATCTGGGGTTGTCTATTCGCGACGTCAGATGGAGGAAACGAAATTG...

CDS

下载 CDS FASTA

1023 bp · TkA07G397200|TK1151|CDS

ATGGAGGAAACGAAATTGTGCTCATGGACGGTGTTTCGATCCGTTTTCGCTATCTTTCAGTGGTGGAGCTTCAATGTCGCCGTCATCATCATGAACAAATGGATCTTTCAGAAACTCGATTTCAAGTTCCCTTTGACGGTATCATGTGTACACTTCATATGCTCATCGATTGGGGCATACGTGGTCATCGTAGTCCTCAAGGTAAAACCACTAATCTCAGTCGAACCCGAAGATCGCTGGAGAAGGATCTTCCCAATGTC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

340 aa · TkA07G397200|TK1151|PROTEIN

MEETKLCSWTVFRSVFAIFQWWSFNVAVIIMNKWIFQKLDFKFPLTVSCVHFICSSIGAYVVIVVLKVKPLISVEPEDRWRRIFPMSFVFCINIVLGNVSLRYIPVSFMQTIKSFTPATTVILQWMVWRKYFDWRIWASLVPIVGGILLTSVTELSFNAFGFCAALFGCLATSTKTILAESLLHGYKFDSINTVYYMAPFATMILAVPALLLEGPGVVEWIRTAPNLSSSFIIIFGSGVTAFCLNFSIFYVIHSTTAVTF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G397200`
TK1151 ID	TkA07G397200
OH-1004 ID	LXL04_036232
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	35.400
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 85.294 / OH-1004 91.536 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G397200

位置 Chr07:99767735-99769816 (-)

描述 Similar to UUAT1: UDP-URONIC ACID TRANSPORTER 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g21870`	GDP-甘露糖转运蛋白，可能参与 GDP-甘露糖从细胞质输入高尔基体腔。	Arabidopsis thaliana expresses multiple Golgi-localised nucleotide-sugar transporters related to GONST1.2004 · DOI: 10.1007/s00438-004-1071-z
`At1g77610`	特异性转运 UDP-半乳糖的核苷酸糖转运蛋白。	Molecular cloning of two Arabidopsis UDP-galactose transporters by complementation of a deficient Chinese hamster ovary cell line.2005 · DOI: 10.1093/glycob/cwh159
`At5g05820`	可能的糖磷酸/磷酸转运蛋白At5g05820。	暂无已核实直接文献
`At5g04160`	UDP-葡萄糖醛酸转运蛋白，调节种子粘液的多糖组成。	UUAT1 Is a Golgi-Localized UDP-Uronic Acid Transporter That Modulates the Polysaccharide Composition of Arabidopsis Seed Mucilage.2017 · DOI: 10.1105/tpc.16.00465
`At3g11320`	可能的糖磷酸/磷酸转运蛋白 At3g11320。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036232 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0015780 nucleotide-sugar transmembrane transport 生物过程

GO:0055085 transmembrane transport 生物过程

GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分

GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分

GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0015297 antiporter activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G12500

ath:AT3G10290

ath:AT3G11320

ath:AT5G04160

ath:AT5G05820

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

高尔基体0.615

排名 1 · TkA07G397200 · TK1151

内质网0.155

排名 2 · TkA07G397200 · TK1151

细胞质0.149

排名 3 · TkA07G397200 · TK1151

细胞膜0.078

排名 4 · TkA07G397200 · TK1151

溶酶体／液泡0.066

排名 5 · TkA07G397200 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08449UAA15-303 aa

PF03151TPT17-301 aa

PF00892EamA44-151 aa

PF00892EamA160-300 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G397200	`PF08449`	UAA	15	303	1.2e-10	41.8
TkA07G397200	`PF03151`	TPT	17	301	3.1e-50	171.9
TkA07G397200	`PF00892`	EamA	44	151	4.6e-17	63.3
TkA07G397200	`PF00892`	EamA	160	300	4.6e-17	63.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SFE9`	拟南芥	sp\|Q9SFE9\|GONS5_ARATH GDP-mannose transporter GONST5	80.600%	Swiss-Prot	高置信
`Q9C521`	拟南芥	sp\|Q9C521\|UGAL1_ARATH UDP-galactose transporter 1	82.500%	Swiss-Prot	高置信
`Q6DBP3`	拟南芥	sp\|Q6DBP3\|PT505_ARATH Probable sugar phosphate/phosphate translocator At5g05820	33.800%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9FYE5`	拟南芥	sp\|Q9FYE5\|UUAT1_ARATH UDP-URONIC ACID TRANSPORTER 1	33.300%	Swiss-Prot	中等置信
`Q5XF09`	拟南芥	sp\|Q5XF09\|PT311_ARATH Probable sugar phosphate/phosphate translocator At3g11320	32.800%	Swiss-Prot	中等置信

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