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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G379360
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 95068725-95071636 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1439 bp · TkA07G379360|TK1151|cDNA

CCCTTTCCCACTAGTCTATCTTTATTGTTAGTTTAGTGGATTAAATTATGTGTCTATAAAAACCCGAAAAATTTCCATTTCTAATGTTCTTCAAGATTTTGCCTTCTCCATTTGCTCAAGATTTTGCATGCACACACATATGACACCAACATCGACTCACATTTCCACTACAACAAGAATGGGGACATATGATCCACTTCACCATATTCATATGCCGGACAACATATTCGAAGATCATATGAGCACGAAGACGAACCGTG...

CDS

下载 CDS FASTA

1095 bp · TkA07G379360|TK1151|CDS

ATGCACACACATATGACACCAACATCGACTCACATTTCCACTACAACAAGAATGGGGACATATGATCCACTTCACCATATTCATATGCCGGACAACATATTCGAAGATCATATGAGCACGAAGACGAACCGTGACGTAATCACGCAATCCGAATCAAGGCTAACTAACAATATCTTGTACACTTCTCAAGAATCATTAGAATCTTCTCGGGATTCGGATAAGAATATCTCAGATAAGTTTCAAAGACGACTAGCACAAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

364 aa · TkA07G379360|TK1151|PROTEIN

MHTHMTPTSTHISTTTRMGTYDPLHHIHMPDNIFEDHMSTKTNRDVITQSESRLTNNILYTSQESLESSRDSDKNISDKFQRRLAQNREAARKSRLKRKAYVQELESGRLKLAKLEHEIERTRQQGAYVDSPNTDYGQLSGIAKFVAKYDIWVAEQQKKESELMTILQTDVSDDELRVVIDGVVDHYQYLFRMKADAAKVDAFSLLYGSWWPPIERLFQWLGGFRPSEVLYILMPWFDPLTDTQIVNLSKLRHTCRQAED...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G379360
TK1151 IDTkA07G379360
OH-1004 IDLXL04_031192
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)57.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 95.879 / OH-1004 98.077
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G379360
位置Chr07:95068725-95071636 (+)
描述Similar to TGA1: Transcription factor TGA1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g22070 转录激活因子，能够特异性结合DNA序列5'-TGACG-3'。
Salicylic acid and NPR1 induce the recruitment of trans-activating TGA factors to a defense gene promoter in Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1105/tpc.012211
At1g77920 特异性结合 DNA 序列 5'-TGACG-3' 的转录激活剂。 暂无已核实直接文献
At5g10030 特异性结合 DNA 序列 5'-TGACG-3' 的转录激活剂。 暂无已核实直接文献
At5g65210 特异性结合 DNA 序列 5'-TGACG-3' 的转录激活剂。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0637000 参与防御反应的转录调控因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031192 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009862 systemic acquired resistance, salicylic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
GO:0005516 calmodulin binding 分子功能
GO:0043565 sequence-specific DNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G22070
ath:AT1G77920
ath:AT5G10030
ath:AT5G65210
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.607
排名 1 · TkA07G379360 · TK1151
细胞质0.384
排名 2 · TkA07G379360 · TK1151
细胞膜0.058
排名 3 · TkA07G379360 · TK1151
线粒体0.043
排名 4 · TkA07G379360 · TK1151
内质网0.036
排名 5 · TkA07G379360 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16064DUF480664-90 aa
PF00170bZIP_178-112 aa
PF07716bZIP_279-115 aa
PF03131bZIP_Maf79-136 aa
PF16064DUF4806112-124 aa
PF14144DOG1161-234 aa
PF03131bZIP_Maf249-256 aa
PF07716bZIP_2259-271 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G379360PF16064DUF480664900.3511.9
TkA07G379360PF00170bZIP_1781122e-0731.7
TkA07G379360PF07716bZIP_2791159.7e-0523.1
TkA07G379360PF03131bZIP_Maf791360.02815.7
TkA07G379360PF16064DUF48061121240.3511.9
TkA07G379360PF14144DOG11612347.3e-2381.3
TkA07G379360PF03131bZIP_Maf2492560.02815.7
TkA07G379360PF07716bZIP_22592719.7e-0523.1
TkA07G379360PF16064DUF48062612740.3511.9
TkA07G379360PF16064DUF48062923270.3511.9
TkA07G379360PF00170bZIP_13143302e-0731.7
TkA07G379360PF03131bZIP_Maf3143290.02815.7
TkA07G379360PF07716bZIP_23213309.7e-0523.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q39234拟南芥sp|Q39234|TGA3_ARATH Transcription factor TGA350.400%Swiss-Prot高置信
Q93ZE2拟南芥sp|Q93ZE2|TGA7_ARATH Transcription factor TGA749.900%Swiss-Prot中等置信
Q39162拟南芥sp|Q39162|TGA4_ARATH Transcription factor TGA448.900%Swiss-Prot中等置信
Q39237拟南芥sp|Q39237|TGA1_ARATH Transcription factor TGA148.100%Swiss-Prot中等置信
A0A0P0WFC8水稻sp|A0A0P0WFC8|TGAL6_ORYSJ Transcription factor TGAL646.100%Swiss-Prot中等置信

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