TkA07G372820 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G372820

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 93527488-93529574 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1979 bp · TkA07G372820|TK1151|cDNA

TCAACAAATTTTTTAATTTCAAAATGAGGTGGATTGATTGTACGTACTGCTGGAGCACCATTATAAATAGATAGGTTGATATCATTGCTAAGCAAACACCACAAAGAGAAAAACCCATTGAGTCATTGACATGGACATCTTCACTTTCTTCCCTTCATGGCTTTTTTCATCGGTATCAATTCTAATCTTTTCTTTAATCTTCGTATACGCTTTACGAAGGAAGAAACCATCATCCAAGGCTGCCCCAAACCTCCCCCCCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1494 bp · TkA07G372820|TK1151|CDS

ATGGACATCTTCACTTTCTTCCCTTCATGGCTTTTTTCATCGGTATCAATTCTAATCTTTTCTTTAATCTTCGTATACGCTTTACGAAGGAAGAAACCATCATCCAAGGCTGCCCCAAACCTCCCCCCCAGCCCTCCGACGCTTCCGATAATAGGAAACCTGCATCAAGTGATTGGTAAAAACTTCCATCAAATCCTTTGGAAAGTCTCCCGTCAATACGGCCCTATTATGACTGTCCATTTAGGTGCCACACCATACGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

497 aa · TkA07G372820|TK1151|PROTEIN

MDIFTFFPSWLFSSVSILIFSLIFVYALRRKKPSSKAAPNLPPSPPTLPIIGNLHQVIGKNFHQILWKVSRQYGPIMTVHLGATPYVIISSSEFANQALKTHDQILCNRPRSKGFQRLTFDYMDVAFSPHAEQWKEMRKVLVNEFLGSKRSKLFKKVVDAEVKGMLDSFSSEHLNTTVNMDERLFHLVTDIVSKVAVGKSYREVTFRGKKLKEMLDDLVISLCGSVSDIYPGRIGLILDEILGFNRRLEKTFSTFDAFLQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G372820`
TK1151 ID	TkA07G372820
OH-1004 ID	LXL04_030046
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)	99.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 92.958 / OH-1004 84.771 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G372820

位置 Chr07:93527488-93529574 (-)

描述 Similar to CYP71CA1: Parthenolide synthase

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g26300`	细胞色素 P450 71B34。	暂无已核实直接文献
`At3g26330`	细胞色素 P450 71B37。	暂无已核实直接文献
`At1g13080`	细胞色素P450 71B2。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030046 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0016114 terpenoid biosynthetic process 生物过程

GO:0051762 sesquiterpene biosynthetic process 生物过程

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0005506 iron ion binding 分子功能

GO:0016491 oxidoreductase activity 分子功能

GO:0016705 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen 分子功能

GO:0016709 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, NAD(P)H as one donor, and incorporation of one atom of oxygen 分子功能

GO:0020037 heme binding 分子功能

GO:0102626 parthenolide synthase activity 分子功能

GO:0106244 eupatolide synthase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G26300

ath:AT3G26320

ath:AT3G26330

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.926

排名 1 · TkA07G372820 · TK1151

细胞膜0.044

排名 2 · TkA07G372820 · TK1151

细胞质0.039

排名 3 · TkA07G372820 · TK1151

质体0.028

排名 4 · TkA07G372820 · TK1151

高尔基体0.022

排名 5 · TkA07G372820 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00067p45042-478 aa

PF12943DUF3839119-228 aa

PF16872putAbiC276-302 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G372820	`PF00067`	p450	42	478	2e-89	301.2
TkA07G372820	`PF12943`	DUF3839	119	228	0.041	14.1
TkA07G372820	`PF16872`	putAbiC	276	302	0.031	15.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9LIP6`	拟南芥	sp\|Q9LIP6\|C71BV_ARATH Cytochrome P450 71B34	40.200%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9LIP3`	拟南芥	sp\|Q9LIP3\|C71BY_ARATH Cytochrome P450 71B37	39.900%	Swiss-Prot	中等置信
`O65788`	拟南芥	sp\|O65788\|C71B2_ARATH Cytochrome P450 71B2	38.800%	Swiss-Prot	中等置信

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