TkA07G351210 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G351210

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 87745803-87750051 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

3134 bp · TkA07G351210|TK1151|cDNA

GGAACATTTTGGAGTAAACGGGCGGGAAAACATGGAACATCCAAAATTCTCAAAACCCTAACTCCTACATCATTTTCGCGCTTCACCTCTCCGCTCATTTCTGCAATTTCCTACAAATCGATCTCGAGAAAAAACATTCCAACGTTTCTCGATCTGATATCACGTTCGTCAATCCGCCACAAATATTAATCCTGAATTTGTAGAGACGCTGAATTGTAGATCTGAACAGTGTCAATGGAAAGTCGGATGGTGCTACACGC...

CDS

下载 CDS FASTA

2652 bp · TkA07G351210|TK1151|CDS

ATGGAAAGTCGGATGGTGCTACACGCGCCTGATGAAGTTATTACCGAGCTTACCGGTGCCGACACTGAGTTAGTGAGCAGATCATGGAACTTATTTGCTATACTGCTATCCTTAGGGCATCCAGTTCTTCCTATTGAACTGGCATCTCGATGCACTTCTTTTGAAGTGTCAACGGAATTTGTCGAATTCGTTTGTTCTATACCTAACTCTCCCCTCTCGCTGACGGATGATGGTTTGGTTACGATTTCTTCTGCTGTTTG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

883 aa · TkA07G351210|TK1151|PROTEIN

MESRMVLHAPDEVITELTGADTELVSRSWNLFAILLSLGHPVLPIELASRCTSFEVSTEFVEFVCSIPNSPLSLTDDGLVTISSAVCMRLQRFLLSSGRLFKISIPREIETRDCERKRACGDVELMYYRKRKRSRPNISDNADQTALAMPVRISDAFEKVYAHDDDHALRSLIITNDNIPVEGTINMSALINFDGGLLTTGLNDCKDEDENDSTTVLSTKELAIQNNFLNGFICFPSPIKTQSRKRKDCSQFQPSSHLTA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G351210`
TK1151 ID	TkA07G351210
OH-1004 ID	LXL04_029833
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	97.400
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA07G351210`
位置	Chr07:87745803-87750051 (+)
描述	Similar to CDC7: Cell division cycle 7-related protein kinase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_029833` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0000076 DNA replication checkpoint signaling 生物过程 GO:0000082 G1/S transition of mitotic cell cycle 生物过程 GO:0000727 double-strand break repair via break-induced replication 生物过程 GO:0006270 DNA replication initiation 生物过程 GO:0007165 signal transduction 生物过程 GO:0008284 positive regulation of cell population proliferation 生物过程 GO:0010571 positive regulation of nuclear cell cycle DNA replication 生物过程 GO:0010971 positive regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle 生物过程 GO:0031573 mitotic intra-S DNA damage checkpoint signaling 生物过程 GO:0033314 mitotic DNA replication checkpoint signaling 生物过程 GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程 GO:0044770 cell cycle phase transition 生物过程
KEGG 基因交叉引用	ddi:DDB_G0292152 dme:Dmel_CG5790 hsa:8317 spo:2541165 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.889

排名 1 · TkA07G351210 · TK1151

细胞质0.155

排名 2 · TkA07G351210 · TK1151

细胞膜0.036

排名 3 · TkA07G351210 · TK1151

线粒体0.024

排名 4 · TkA07G351210 · TK1151

内质网0.018

排名 5 · TkA07G351210 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase307-336 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr307-337 aa

PF03109ABC1434-474 aa

PF00069Pkinase440-582 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr441-582 aa

PF01636APH539-577 aa

PF06293Kdo539-576 aa

PF03109ABC1541-584 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G351210	`PF00069`	Pkinase	307	336	2.3e-46	159.0
TkA07G351210	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	307	337	2.7e-14	53.8
TkA07G351210	`PF03109`	ABC1	434	474	0.0007	19.5
TkA07G351210	`PF00069`	Pkinase	440	582	2.3e-46	159.0
TkA07G351210	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	441	582	2.7e-14	53.8
TkA07G351210	`PF01636`	APH	539	577	0.00077	20.0
TkA07G351210	`PF06293`	Kdo	539	576	0.027	14.6
TkA07G351210	`PF03109`	ABC1	541	584	0.0007	19.5
TkA07G351210	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	717	850	2.7e-14	53.8
TkA07G351210	`PF00069`	Pkinase	723	860	2.3e-46	159.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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