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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G342890
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 85605900-85607327 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1074 bp · TkA07G342890|TK1151|cDNA

TCGTTTTCCAGAAGCTTCCTTACTTTTCTACAGCCTTCCACCGCCCTCTTCGTCATTACAAAAACCCTGTTATGCTCCATGACGCCTCCACACAAGCAAACTGAGTTGTTGAATCCGCAACCAAACTATCAAATCTTCACTGCCAGCTCCACCATTGTTCCGTTAACGAACGACCACACCAGAAATGGCTGCCTACCTAGCTCTCAAGAGAGGAACGACTGCAGCTACTCTCTTTAATAAACTCCTTACGCCGATTCGCT...

CDS

下载 CDS FASTA

645 bp · TkA07G342890|TK1151|CDS

ATGGCTGCCTACCTAGCTCTCAAGAGAGGAACGACTGCAGCTACTCTCTTTAATAAACTCCTTACGCCGATTCGCTCTGCCTCTGCTACTCCCTGCGTACGACGGTGCTTCAACACTAATGCTTCTCAGGTGTCCGCTTATGATGATTTCAATCGATCCGTCGATGCGGATCGTCGTCCGGATTCCTCTGTTTCTCGCCGCCGTGACGGTGATTTCTTCTCAGATCTGTTCAATCCAATTTCTCCAACAAGGAGCTTGAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

214 aa · TkA07G342890|TK1151|PROTEIN

MAAYLALKRGTTAATLFNKLLTPIRSASATPCVRRCFNTNASQVSAYDDFNRSVDADRRPDSSVSRRRDGDFFSDLFNPISPTRSLSQILNMMDQFTDNPFMSTALGGGFGARRGWDAKEDDNTLYLRFDMPGLDKENIKISVEQNTLIIKAEADKESEDDEEPPRRYSSRIDLPTDVYKLDEIKAEMKNGVLKVMVPKVKTEERKDVFQVQVE

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G342890
TK1151 IDTkA07G342890
OH-1004 IDLXL04_029744
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G342890
位置Chr07:85605900-85607327 (-)
描述Similar to HSP23.6: 23.6 kDa heat shock protein, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g25200 23.6 kDa 线粒体热休克蛋白。 暂无已核实直接文献
At5g51440 23.5 kDa 热休克蛋白，线粒体。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0758000 24.1 kDa 热休克蛋白，线粒体。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029744 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006950 response to stress 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G25200
ath:AT5G51440
gmx:547852
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.896
排名 1 · TkA07G342890 · TK1151
细胞质0.114
排名 2 · TkA07G342890 · TK1151
细胞核0.084
排名 3 · TkA07G342890 · TK1151
质体0.079
排名 4 · TkA07G342890 · TK1151
细胞膜0.030
排名 5 · TkA07G342890 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF19361DUF593773-106 aa
PF04969CS74-89 aa
PF00011HSP20117-213 aa
PF04969CS120-156 aa
PF27746Small_heat_shock_put121-199 aa
PF17886ArsA_HSP20123-196 aa
PF29697GerT_C123-196 aa
PF18046FKBP26_C127-151 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G342890PF19361DUF5937731060.2811.0
TkA07G342890PF04969CS74890.02316.4
TkA07G342890PF00011HSP201172139.5e-1968.1
TkA07G342890PF04969CS1201560.02316.4
TkA07G342890PF27746Small_heat_shock_put1211996.4e-1142.7
TkA07G342890PF17886ArsA_HSP201231969.7e-0832.2
TkA07G342890PF29697GerT_C1231960.004917.5
TkA07G342890PF18046FKBP26_C1271510.0116.7
TkA07G342890PF10988DUF28071371590.4211.1
TkA07G342890PF10988DUF28071702130.4211.1
TkA07G342890PF04969CS1752010.02316.4
TkA07G342890PF18046FKBP26_C1772000.0116.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q96331拟南芥sp|Q96331|HS23M_ARATH 23.6 kDa heat shock protein, mitochondrial52.900%Swiss-Prot高置信
Q9FGM9拟南芥sp|Q9FGM9|HS235_ARATH 23.5 kDa heat shock protein, mitochondrial48.700%Swiss-Prot中等置信
Q6Z7V2水稻sp|Q6Z7V2|HS24M_ORYSJ 24.1 kDa heat shock protein, mitochondrial48.100%Swiss-Prot中等置信

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