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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G286540
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 71922472-71925937 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2160 bp · TkA07G286540|TK1151|cDNA

AATACACGGCTGTACTTGCTCTTACAGACTTACACCCAAGGTGTTCGCATAAATATTAAGAACCACGGGAATCTCCTTTTCCATGAAACCTTTCTTCCATTATTCTACAGAATACTGCATTCCTCAACACCAATGGCGACCTTCTCCAAAACCCAATTAAATTACCCCCATTCTTCAACAAAAACTTCAAATTTTGAAATGTCAGAGAACCAATCCTTGTCCCACGACTGGTATTTTGAAGAGACAGGAGTATACAACAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1848 bp · TkA07G286540|TK1151|CDS

AATACACGGCTGTACTTGCTCTTACAGACTTACACCCAAGGTGTTCGCATAAATATTAAGAACCACGGGAATCTCCTTTTCCATGAAACCTTTCTTCCATTATTCTACAGAATACTGCATTCCTCAACACCAATGGCGACCTTCTCCAAAACCCAATTAAATTACCCCCATTCTTCAACAAAAACTTCAAATTTTGAAATGTCAGAGAACCAATCCTTGTCCCACGACTGGTATTTTGAAGAGACAGGAGTATACAACAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

615 aa · TkA07G286540|TK1151|PROTEIN

NTRLYLLLQTYTQGVRINIKNHGNLLFHETFLPLFYRILHSSTPMATFSKTQLNYPHSSTKTSNFEMSENQSLSHDWYFEETGVYNSRHPRIDIPSDPFLDVVSCVFSHKHNGKTALIDAASGVSISYAELQPLVKSMASGLHHQMGVSKGDVVLILLPNSIYYPIILLGVLYLGAVVSTMNPFSSFSEIKKQTLGCHVTLAFTFPNKADELSSLGIESILVPENTKFDSNQFRFTPFYKLISSDHELVPRRTVTLDDTA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G286540
TK1151 IDTkA07G286540
OH-1004 IDLXL04_029219
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.512 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G286540
位置Chr07:71922472-71925937 (+)
描述Similar to 4CLL6: 4-coumarate--CoA ligase-like 6
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g19010 通过启动其前体的 β-氧化链缩短，参与茉莉酸的生物合成。
The Origin and Biosynthesis of the Benzenoid Moiety of Ubiquinone (Coenzyme Q) in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1105/tpc.114.125807

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os08g0143300 羧酸-CoA连接酶，可能以4-香豆酸为底物。 暂无已核实直接文献
Os10g0578950 羧酸-CoA连接酶，可能以4-香豆酸为底物。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029219 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006744 ubiquinone biosynthetic process 生物过程
GO:0009698 phenylpropanoid metabolic process 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0042617 paclitaxel biosynthetic process 生物过程
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0016207 4-coumarate-CoA ligase activity 分子功能
GO:0016405 CoA-ligase activity 分子功能
GO:0018859 4-hydroxybenzoate-CoA ligase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ag:AKA59704
ath:AT4G19010
dosa:Os08g0143300
osa:9269113
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

过氧化物酶体0.492
排名 1 · TkA07G286540 · TK1151
细胞质0.168
排名 2 · TkA07G286540 · TK1151
线粒体0.130
排名 3 · TkA07G286540 · TK1151
质体0.112
排名 4 · TkA07G286540 · TK1151
内质网0.096
排名 5 · TkA07G286540 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00501AMP-binding109-475 aa
PF27289YomX_N469-517 aa
PF13193AMP-binding_C527-601 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G286540PF00501AMP-binding1094752.2e-85287.5
TkA07G286540PF27289YomX_N4695170.1912.4
TkA07G286540PF13193AMP-binding_C5276017.3e-1969.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q84P24拟南芥sp|Q84P24|4CLL6_ARATH 4-coumarate--CoA ligase-like 660.500%Swiss-Prot高置信
Q6YYZ2水稻sp|Q6YYZ2|4CLL3_ORYSJ 4-coumarate--CoA ligase-like 352.300%Swiss-Prot高置信
Q336M7水稻sp|Q336M7|4CLL2_ORYSJ 4-coumarate--CoA ligase-like 253.100%Swiss-Prot高置信

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