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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G285160
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 71591355-71594010 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1365 bp · TkA07G285160|TK1151|cDNA

ATGTCAGATGTTGATGATGATAGAGGTGCCGGTGCTGCTACTCCTCCAGTCAGAATCAAGGAAATCGCAACCACATCGGTGGCTTGCCCGATGTTAACCCAGCCAAATTACACTGTATGGGCTCTTCGCATGAAGGCGATACCCGAAGCGCTAGTGATGCAAATCGGGGATGTCAGTTCCGCCAAGGCCCTCTGGGAAGCAATAAAAGCCCGTCACGTCGGCGCAGATCGCGTGAAAGAAGCCCGATTGCAAACCCTAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

1365 bp · TkA07G285160|TK1151|CDS

ATGTCAGATGTTGATGATGATAGAGGTGCCGGTGCTGCTACTCCTCCAGTCAGAATCAAGGAAATCGCAACCACATCGGTGGCTTGCCCGATGTTAACCCAGCCAAATTACACTGTATGGGCTCTTCGCATGAAGGCGATACCCGAAGCGCTAGTGATGCAAATCGGGGATGTCAGTTCCGCCAAGGCCCTCTGGGAAGCAATAAAAGCCCGTCACGTCGGCGCAGATCGCGTGAAAGAAGCCCGATTGCAAACCCTAAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

454 aa · TkA07G285160|TK1151|PROTEIN

MSDVDDDRGAGAATPPVRIKEIATTSVACPMLTQPNYTVWALRMKAIPEALVMQIGDVSSAKALWEAIKARHVGADRVKEARLQTLTSEFDRLKMQESDTIDAFSGKLSGISSQSASLGESIEESKMVKKLLKSVPRKFIHIVAFLEQVLDLKTVGYEDVVGRLKAYEERVREADDGGESQARVMFVKNGGGAGSRNRGRNNRGEGFYHESRSAGGSGSNPAQNFKQPNFNDQPNSNKKCNCDCCEKNRRNRKNDRSKIV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G285160
TK1151 IDTkA07G285160
OH-1004 IDLXL04_034782
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)62.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 62.335 / OH-1004 27.580
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G285160
位置Chr07:71591355-71594010 (-)
描述Protein of unknown function
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g65790 参与细胞扩张和分化的调节。 暂无已核实直接文献
At1g65800 参与细胞扩张和分化的调节。 暂无已核实直接文献
At1g11330 G型凝集素S-受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g11330。 暂无已核实直接文献
At4g03230 G 型凝集素 S-受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At4g03230。 暂无已核实直接文献
At4g00970 富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶41。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_034782 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）暂无功能描述
KEGG 基因交叉引用暂无功能描述
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.558
排名 1 · TkA07G285160 · TK1151
细胞核0.304
排名 2 · TkA07G285160 · TK1151
细胞膜0.246
排名 3 · TkA07G285160 · TK1151
内质网0.063
排名 4 · TkA07G285160 · TK1151
线粒体0.031
排名 5 · TkA07G285160 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13961DUF421932-46 aa
PF14223Retrotran_gag_245-174 aa
PF13961DUF421962-68 aa
PF00098zf-CCHC260-276 aa
PF13696zf-CCHC_2260-276 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr295-405 aa
PF00069Pkinase300-344 aa
PF13961DUF4219353-358 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G285160PF13961DUF421932460.0514.1
TkA07G285160PF14223Retrotran_gag_2451743.6e-1453.6
TkA07G285160PF13961DUF421962680.0514.1
TkA07G285160PF00098zf-CCHC2602761.2e-0629.1
TkA07G285160PF13696zf-CCHC_22602760.002318.4
TkA07G285160PF07714PK_Tyr_Ser-Thr2954059.5e-0832.4
TkA07G285160PF00069Pkinase3003440.0006719.9
TkA07G285160PF13961DUF42193533580.0514.1
TkA07G285160PF11883DUF34034104541.6e-0835.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q39086拟南芥sp|Q39086|SD17_ARATH Receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-747.500%Swiss-Prot低置信
Q9S972拟南芥sp|Q9S972|SD16_ARATH Receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-646.800%Swiss-Prot低置信
Q9SXB8拟南芥sp|Q9SXB8|Y1133_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g1133046.100%Swiss-Prot低置信
Q9ZR08拟南芥sp|Q9ZR08|Y4230_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g0323045.500%Swiss-Prot低置信
O23081拟南芥sp|O23081|CRK41_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 4141.100%Swiss-Prot低置信

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