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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G283020
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 70863046-70865762 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1510 bp · TkA07G283020|TK1151|cDNA

CTTTTGTTTACTATCCGCCGTATATTTCTTCTTCTCCGATGGATTCTCAGAACCCTGAACATGAACACAAACACACTGTTGACATATCAGCAGCCGTACCACCTGAAGAAAACCGCCAAACTACAAACAAAGTCTGTGGTGGAGCACCATGCGGATTCTCAGATTCCAACACAACTTCCATGGAAGCAAAAGAACGTTCAGCTTCCATGTGGAAGCTCTGGTGTGGTGTCATCTTATGCGTTATCTTCATGAGTGTAGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1236 bp · TkA07G283020|TK1151|CDS

ATGTTTTCGCCAAAAGATTCAAACACGATGGATTCTCAGAACCCTGAACATGAACACAAACACACTGTTGACATATCAGCAGCCGTACCACCTGAAGAAAACCGCCAAACTACAAACAAAGTCTGTGGTGGAGCACCATGCGGATTCTCAGATTCCAACACAACTTCCATGGAAGCAAAAGAACGTTCAGCTTCCATGTGGAAGCTCTGGTGTGGTGTCATCTTATGCGTTATCTTCATGAGTGTAGAAGTAGTAGGTGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

411 aa · TkA07G283020|TK1151|PROTEIN

MFSPKDSNTMDSQNPEHEHKHTVDISAAVPPEENRQTTNKVCGGAPCGFSDSNTTSMEAKERSASMWKLWCGVILCVIFMSVEVVGGIKANSLAILTDAAHLLSDVAAFAISIFSVWASGWEATPRQSYGFFRIEILGTLVSIQIIWLLTGILVYEAIERLLYGTVEVQGSLMFGISAFGLVVNIIMIFVLGHEHGHGHSHGHGHGHDHGVSVTTHDHGVSVTTHDHHHGHDDDHHHHGSGHGHGHDQNQPLLKTYSSQE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G283020
TK1151 IDTkA07G283020
OH-1004 IDLXL04_029154
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)92.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.810 / OH-1004 97.704
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G283020
位置Chr07:70863046-70865762 (-)
描述Similar to MTP1: Metal tolerance protein 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g46800 介导根部锌积累并赋予锌抗性。
Zinc transporter of Arabidopsis thaliana AtMTP1 is localized to vacuolar membranes and implicated in zinc homeostasis.2004 · DOI: 10.1093/pcp/pci015
A mutant strain Arabidopsis thaliana that lacks vacuolar membrane zinc transporter MTP1 revealed the latent tolerance to excessive zinc.2009 · DOI: 10.1093/pcp/pcp067
A mutation in the Arabidopsis thaliana cell wall biosynthesis gene pectin methylesterase 3 as well as its aberrant expression cause hypersensitivity specifically to Zn.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12279
At3g58810 参与将细胞质中多余的锌隔离到液泡中以维持锌稳态。
The Arabidopsis metal tolerance protein AtMTP3 maintains metal homeostasis by mediating Zn exclusion from the shoot under Fe deficiency and Zn oversupply.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02746.x
At3g61940 参与将细胞质中过量的锌隔离到液泡中以维持锌稳态。 暂无已核实直接文献
At2g29410 参与将细胞质中过量的锌隔离到液泡中以维持锌稳态。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0128400 参与将细胞质中过量的锌隔离到液泡中以维持锌稳态。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029154 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006829 zinc ion transport 生物过程
GO:0006882 intracellular zinc ion homeostasis 生物过程
GO:0010038 response to metal ion 生物过程
GO:0010043 response to zinc ion 生物过程
GO:0010312 detoxification of zinc ion 生物过程
GO:0030001 metal ion transport 生物过程
GO:0071577 zinc ion transmembrane transport 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005774 vacuolar membrane 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G29410
ath:AT2G46800
ath:AT3G58810
ath:AT3G61940
dosa:Os05g0128400
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.346
排名 1 · TkA07G283020 · TK1151
细胞质0.293
排名 2 · TkA07G283020 · TK1151
细胞膜0.248
排名 3 · TkA07G283020 · TK1151
高尔基体0.228
排名 4 · TkA07G283020 · TK1151
内质网0.146
排名 5 · TkA07G283020 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02535Zip13-37 aa
PF16479DUF505648-106 aa
PF01545Cation_efflux70-332 aa
PF16479DUF5056107-151 aa
PF16479DUF5056139-170 aa
PF02535Zip166-286 aa
PF16479DUF5056309-334 aa
PF16916ZT_dimer336-410 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G283020PF02535Zip13378.3e-0626.0
TkA07G283020PF16479DUF5056481062.29.6
TkA07G283020PF01545Cation_efflux703321.3e-43149.8
TkA07G283020PF16479DUF50561071512.29.6
TkA07G283020PF16479DUF50561391702.29.6
TkA07G283020PF02535Zip1662868.3e-0626.0
TkA07G283020PF16479DUF50563093342.29.6
TkA07G283020PF16916ZT_dimer3364102.2e-1247.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZT63拟南芥sp|Q9ZT63|MTP1_ARATH Metal tolerance protein 170.800%Swiss-Prot高置信
Q9LXS1拟南芥sp|Q9LXS1|MTPA2_ARATH Metal tolerance protein A264.900%Swiss-Prot高置信
Q9M271拟南芥sp|Q9M271|MTPA1_ARATH Metal tolerance protein A164.100%Swiss-Prot高置信
Q6DBM8拟南芥sp|Q6DBM8|MTPB_ARATH Metal tolerance protein B46.300%Swiss-Prot中等置信
Q688R1水稻sp|Q688R1|MTP1_ORYSJ Metal tolerance protein 172.900%Swiss-Prot高置信

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