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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G252000
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 62848104-62854177 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2591 bp · TkA07G252000|TK1151|cDNA

ACAAAGATATCAAAACCACATAAATATCCAAAATTAGACCAGGATGTACCACCTGAAACCAAAATCAGATGATTTTGACAATTACGCTATCACAATTCACAAGGACTATTCTTGCAATTTAGTATGAACTCTTACATAAATCCGAATTTGTAACCCTTTAGTCGGTTGATTTATTGAACCGGTCCGCTTTGTTCCGGTTGGGCTAAATGCAAGTATTTGTATGCCTTTCGCCTCGCACTTGACACCCAGAAAATGGCGTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1908 bp · TkA07G252000|TK1151|CDS

ATGGCGTCTGTGTCTTCCTTATCCATGTGCTTCTTTTCTGCTCATGCCCAAGCTCGCTCCAACAAACCTCGTAAACAGCTTGTCCCCAAGAACCCTAATGCCAAAAAGTCCAACAGCATTACCACCCCACGTCCGCAGTCCCTTTTCTCCCTCTCCGGCGGCCAAGCTACAACCTACACTCGCCTGCCTCCCAAAGATGATGAATTCTCCGATTCCTTTGCAGAGATCAAGCTGTCCGATTTGGCAACACTGATGCATAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

635 aa · TkA07G252000|TK1151|PROTEIN

MASVSSLSMCFFSAHAQARSNKPRKQLVPKNPNAKKSNSITTPRPQSLFSLSGGQATTYTRLPPKDDEFSDSFAEIKLSDLATLMHMQKKPSSRSEDKIENDAELSDTEEDAGFDYGKFELFEVSSDEEIDGDEFEEDDLALENKGEDELGFEYKGEGEEEQEDEREKEKGVPAVMRCFDRAKIYVRSGDGGNGVVAFRREKFVPLGGPSGGDGGRGGNVYMEVDSSMNSLLPFRNSIHFRAGRGSHGQGSKMNGAKGDD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G252000
TK1151 IDTkA07G252000
OH-1004 IDLXL04_028935
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G252000
位置Chr07:62848104-62854177 (+)
描述Similar to OBGL: GTP-binding protein OBGC, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g18570 GTP 结合蛋白参与叶绿体中的膜生物发生和蛋白质合成。
Arabidopsis OBG-like GTPase (AtOBGL) is localized in chloroplasts and has an essential function in embryo development.2009 · DOI: 10.1093/mp/ssp073

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2YPR8 可能的GTP结合蛋白，可能参与叶绿体发育。 暂无已核实直接文献
Os07g0669200 可能的GTP结合蛋白，在叶绿体发育中起关键作用，并且在植物生长过程中叶片绿化所必需。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028935 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006364 rRNA processing 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009658 chloroplast organization 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0010027 thylakoid membrane organization 生物过程
GO:0042254 ribosome biogenesis 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0009706 chloroplast inner membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G18570
csc:Csac_1571
dosa:Os07g0669200
sth:STH432
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.894
排名 1 · TkA07G252000 · TK1151
线粒体0.095
排名 2 · TkA07G252000 · TK1151
细胞核0.056
排名 3 · TkA07G252000 · TK1151
细胞质0.040
排名 4 · TkA07G252000 · TK1151
细胞膜0.017
排名 5 · TkA07G252000 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01926MMR_HSR174-89 aa
PF19993DO-GTPase2100-128 aa
PF01018GTP1_OBG180-337 aa
PF00009GTP_EFTU339-362 aa
PF01926MMR_HSR1341-460 aa
PF02421FeoB_N341-500 aa
PF19993DO-GTPase2341-357 aa
PF03193RsgA_GTPase343-359 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G252000PF01926MMR_HSR174893.2e-2382.7
TkA07G252000PF19993DO-GTPase21001280.1212.7
TkA07G252000PF01018GTP1_OBG1803372.9e-54183.6
TkA07G252000PF00009GTP_EFTU3393620.01415.7
TkA07G252000PF01926MMR_HSR13414603.2e-2382.7
TkA07G252000PF02421FeoB_N3415002.3e-0937.7
TkA07G252000PF19993DO-GTPase23413570.1212.7
TkA07G252000PF03193RsgA_GTPase3433590.01615.8
TkA07G252000PF03029ATP_bind_13433650.3811.2
TkA07G252000PF10662PduV-EutP4445000.3211.5
TkA07G252000PF03193RsgA_GTPase4485000.01615.8
TkA07G252000PF03029ATP_bind_14504710.3811.2
TkA07G252000PF00009GTP_EFTU4525060.01415.7
TkA07G252000PF09269DUF19675426117.9e-2174.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8L7L0拟南芥sp|Q8L7L0|OBGC_ARATH GTP-binding protein OBGC, chloroplastic59.900%Swiss-Prot高置信
A2YPR8水稻sp|A2YPR8|OBGC1_ORYSI Probable GTP-binding protein OBGC1, chloroplastic70.600%Swiss-Prot高置信
Q0D3S3水稻sp|Q0D3S3|OBGC1_ORYSJ Probable GTP-binding protein OBGC1, chloroplastic70.600%Swiss-Prot高置信

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