TkA07G136030 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G136030

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 35247762-35249305 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1191 bp · TkA07G136030|TK1151|cDNA

CGAGGGTCCAAGTTTTACTCTAGACTCATCAAATCCTAACATACTTTAACACACCACCCCCAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCAACCAGGTCGTGGTTGGTGATTCTCTTTCTTTCATTCGTTCTTTATTTTCTGTAAATTTGTATCGATTTCCTTTCAATTTCTTGGCTTCTTTCTTTTTTGTTTTGGTAAGAAGAGGAGGAATAATTCATTGAGAATGACAGCGCCAAACATGGCGGCGATCACTGCA...

CDS

下载 CDS FASTA

345 bp · TkA07G136030|TK1151|CDS

ATGACAGCGCCAAACATGGCGGCGATCACTGCATCCCTGGAAAGATCTCTTCAAAGCTTCTCTCTAAACAACCAAAGCAGCATCGGTGTCAGCGGCCGTGAAGGCTCCGGCTCCGGCATCGACAGGTCATCATCTTCCTCAGAGTCTCAGAATAATCGTTCAACAAACTCTTCCGACGCCACCTTGGAACTCAATTCAAATATAACACTTCCCTACCATTGGGAGCAATGCCTGGATTTAAAGACAGGGGAGGTGTATTA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

114 aa · TkA07G136030|TK1151|PROTEIN

MTAPNMAAITASLERSLQSFSLNNQSSIGVSGREGSGSGIDRSSSSSESQNNRSTNSSDATLELNSNITLPYHWEQCLDLKTGEVYYINWRTGMKSQEDPRTVDDGFSSYFYRR

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G136030`
TK1151 ID	TkA07G136030
OH-1004 ID	LXL04_028259
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 98.246 / OH-1004 51.376 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G136030

位置 Chr07:35247762-35249305 (+)

描述 Protein of unknown function

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g33510`	通过与 HD-ZIP IV 转录因子 HDG1 相互作用负向调控角质层发育。	CFL1, a WW domain protein, regulates cuticle development by modulating the function of HDG1, a class IV homeodomain transcription factor, in rice and Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1105/tpc.111.088625 CFLAP1 and CFLAP2 Are Two bHLH Transcription Factors Participating in Synergistic Regulation of AtCFL1-Mediated Cuticle Development in Arabidopsis.2016 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1005744
`At1g28070`	可能通过与 HD-ZIP IV 转录因子 HDG1 相互作用负向调控角质层发育。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`UniProt: B8AIM8`	可能通过与HD-ZIP IV转录因子HDG1相互作用，负向调控表皮发育。	暂无已核实直接文献
`Os02g0516400`	可能通过与HD-ZIP IV转录因子HDG1相互作用，负向调控表皮发育。	CFL1, a WW domain protein, regulates cuticle development by modulating the function of HDG1, a class IV homeodomain transcription factor, in rice and Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1105/tpc.111.088625

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028259 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0160062 cutin-based cuticle development 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0004386 helicase activity 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0016787 hydrolase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G28070

ath:AT2G33510

dosa:Os02g0516400

osa:4329477

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.522

排名 1 · TkA07G136030 · TK1151

细胞核0.513

排名 2 · TkA07G136030 · TK1151

细胞膜0.071

排名 3 · TkA07G136030 · TK1151

线粒体0.049

排名 4 · TkA07G136030 · TK1151

溶酶体／液泡0.044

排名 5 · TkA07G136030 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF30846CEP164_N69-100 aa

PF00397WW70-93 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G136030	`PF30846`	CEP164_N	69	100	0.0037	17.9
TkA07G136030	`PF00397`	WW	70	93	3.8e-05	24.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q5HZ54`	拟南芥	sp\|Q5HZ54\|CFL1_ARATH Protein CURLY FLAG LEAF 1	52.400%	Swiss-Prot	高置信
`Q9C7E6`	拟南芥	sp\|Q9C7E6\|CFL2_ARATH Protein CURLY FLAG LEAF 2	43.800%	Swiss-Prot	中等置信
`B8AIM8`	水稻	sp\|B8AIM8\|CFL1_ORYSI Protein CURLY FLAG LEAF 1	60.900%	Swiss-Prot	低置信
`Q0E0W7`	水稻	sp\|Q0E0W7\|CFL1_ORYSJ Protein CURLY FLAG LEAF 1	60.900%	Swiss-Prot	低置信

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