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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G125550
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 32511444-32512517 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

999 bp · TkA07G125550|TK1151|cDNA

ATGGGGAAGACGACCAAATGGATCAAGAATTTGCTGGCCGGAAAGAAAGACAGAACCAACAACCAGCCACCAATCGCCACACAAGATCGTAACCCACTAACCCCCATCTCCACCCATCCCACAACTCCCAAAGAGAAAAGCAGATGGAGCTTCCGGCGATCATCCGCCACCTCCACCACCCCTCCCAACTTCACCACCATTGCATCGACTACACCCACCTCTTTCCAACCTGAGAAGTTCGAACAAAAGAGCCAGGCTCC...

CDS

下载 CDS FASTA

999 bp · TkA07G125550|TK1151|CDS

ATGGGGAAGACGACCAAATGGATCAAGAATTTGCTGGCCGGAAAGAAAGACAGAACCAACAACCAGCCACCAATCGCCACACAAGATCGTAACCCACTAACCCCCATCTCCACCCATCCCACAACTCCCAAAGAGAAAAGCAGATGGAGCTTCCGGCGATCATCCGCCACCTCCACCACCCCTCCCAACTTCACCACCATTGCATCGACTACACCCACCTCTTTCCAACCTGAGAAGTTCGAACAAAAGAGCCAGGCTCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

332 aa · TkA07G125550|TK1151|PROTEIN

MGKTTKWIKNLLAGKKDRTNNQPPIATQDRNPLTPISTHPTTPKEKSRWSFRRSSATSTTPPNFTTIASTTPTSFQPEKFEQKSQAPAMATPQEEEATMTRIQSVFRSYLARKALSALRGLVKLQALVRGHLVRKQAAETLRSMHALVMVQARARAQRRIKELMEENIKIVEMDMCHARPFVALEPSENGQLYYSKPDHSRPHSTYSISDYIETINDFEVCPSYMANTQSSRAKARSQSAPKQRSTDQTLAHRRQSTSSI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G125550
TK1151 IDTkA07G125550
OH-1004 IDLXL04_028152
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)90.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G125550
位置Chr07:32511444-32512517 (-)
描述Similar to IQD20: Protein IQ-DOMAIN 20
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g14750 可能参与与钙调蛋白或类钙调蛋白的协同作用（通过相似性推测）。 暂无已核实直接文献
At4g23060 可能参与与钙调蛋白或类钙调蛋白的协同作用（通过相似性推测）。 暂无已核实直接文献
At1g01110 可能参与与钙调蛋白或类钙调蛋白的协同作用（通过相似性推测）。 暂无已核实直接文献
At4g29150 可能参与与钙调蛋白或类钙调蛋白的协同作用（通过相似性推测）。 暂无已核实直接文献
At3g49260 可能参与与钙调蛋白或类钙调蛋白的协同作用（通过相似性推测）。
Calcium channels activated by hydrogen peroxide mediate abscisic acid signalling in guard cells.2000 · DOI: 10.1038/35021067
A defined range of guard cell calcium oscillation parameters encodes stomatal movements.2001 · DOI: 10.1038/35082575
CO(2) signaling in guard cells: calcium sensitivity response modulation, a Ca(2+)-independent phase, and CO(2) insensitivity of the gca2 mutant.2006 · DOI: 10.1073/pnas.0602225103
Combinatorial interactions of multiple cis-elements regulating the induction of the Arabidopsis XERO2 dehydrin gene by abscisic acid and cold.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03399.x
Calcium elevation-dependent and attenuated resting calcium-dependent abscisic acid induction of stomatal closure and abscisic acid-induced enhancement of calcium sensitivities of S-type anion and inward-rectifying K channels in Arabidopsis guard cells.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.03872.x

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028152 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0010091 trichome branching 生物过程
GO:0051592 response to calcium ion 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005635 nuclear envelope 细胞组分
GO:0005730 nucleolus 细胞组分
GO:0005856 cytoskeleton 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016604 nuclear body 细胞组分
GO:0005516 calmodulin binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G51960
ath:AT3G16490
ath:AT4G14750
ath:AT5G07240
ath:AT5G62070
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.421
排名 1 · TkA07G125550 · TK1151
细胞核0.366
排名 2 · TkA07G125550 · TK1151
细胞膜0.365
排名 3 · TkA07G125550 · TK1151
内质网0.044
排名 4 · TkA07G125550 · TK1151
质体0.030
排名 5 · TkA07G125550 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13178DUF400556-72 aa
PF00612IQ99-114 aa
PF00612IQ122-136 aa
PF00612IQ148-157 aa
PF13178DUF4005202-271 aa
PF00612IQ271-278 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G125550PF13178DUF400556722.1e-1248.2
TkA07G125550PF00612IQ991142.7e-0627.4
TkA07G125550PF00612IQ1221362.7e-0627.4
TkA07G125550PF00612IQ1481572.7e-0627.4
TkA07G125550PF13178DUF40052022712.1e-1248.2
TkA07G125550PF00612IQ2712782.7e-0627.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
A0A1P8B590拟南芥sp|A0A1P8B590|IQD19_ARATH Protein IQ-DOMAIN 1939.400%Swiss-Prot中等置信
Q2NNE0拟南芥sp|Q2NNE0|IQD22_ARATH Protein IQ-DOMAIN 2260.300%Swiss-Prot低置信
Q9MAM4拟南芥sp|Q9MAM4|IQD18_ARATH Protein IQ-DOMAIN 1870.700%Swiss-Prot低置信
F4JMV6拟南芥sp|F4JMV6|IQD25_ARATH Protein IQ-DOMAIN 2566.700%Swiss-Prot低置信
Q9ASW3拟南芥sp|Q9ASW3|IQD21_ARATH Protein IQ-DOMAIN 2154.900%Swiss-Prot低置信

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