TkA07G079200 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G079200

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 20703727-20712547 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

5730 bp · TkA07G079200|TK1151|cDNA

CTTGTTGGAAAAATTGGCTACTTTCCCCCCCACCAGGTGACCCATCGCCATCACTTTCCTCAATCAGCCCCACCCATTCCTCTTTCTTAATCCAGATTTGGTGCTATAATCAAGCCCTAGTTTAGCTAATCTGCAGCAAACAAACAATCTTATCTCCCAAATGTTGCCTCAACTGTAATCACCAGATCGGCACTGACATCCTAGTACACACAGACGATTGCTTGCAATTAGTTCACTCGCTGTCCCTTTCTGCTTAAGTA...

CDS

下载 CDS FASTA

4968 bp · TkA07G079200|TK1151|CDS

ATGGAAGACGGAGAGGGATCTTCCGAGACGAAGACAAAGACACAGTCTTCAGCTGAGAATGTCAAACCAACAAGAACTGTTATAAAACCAACTGTCTCGTCTTCTTTGAAGGTCTCTGGTTCTACTACTGCAACTACACGAAAAAGGATAGAGCCTAAAAGTGTTTCCAATTCTGCCCCTGCCATTAGAAGGAACAGCACTGGGAGTGTACCTGAAAAACAGCAGCAACTTCCAGTTAAGAAACAGATCGGCAGTAGTGG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

1655 aa · TkA07G079200|TK1151|PROTEIN

MEDGEGSSETKTKTQSSAENVKPTRTVIKPTVSSSLKVSGSTTATTRKRIEPKSVSNSAPAIRRNSTGSVPEKQQQLPVKKQIGSSGGGGGLTVGRKTSSSTTEPMRRSLPEVRKSSLPSSPVVRASKGQSSPSLSSSSRNLSTSIDSTASSTTRKSTSKLSSLARSSAVSSGSKSGSLSSSREKMSTASSQRKAATPEFRVSRLIMLPQVETKANDDVRLDLRGHRIHSLNAGLKLSPSLEFVYLRDNLLSSLEGIEIL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G079200`
TK1151 ID	TkA07G079200
OH-1004 ID	LXL04_027622
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	96.700
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G079200

位置 Chr07:20703727-20712547 (+)

描述 Similar to AIR9: 187-kDa microtubule-associated protein AIR9

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g34680`	可能参与细胞板成熟和有丝分裂后横隔正确插入的微管相关蛋白。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027622 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0007059 chromosome segregation 生物过程

GO:0009733 response to auxin 生物过程

GO:0010102 lateral root morphogenesis 生物过程

GO:0023052 signaling 生物过程

GO:0045842 positive regulation of mitotic metaphase/anaphase transition 生物过程

GO:0051301 cell division 生物过程

GO:1901970 positive regulation of mitotic sister chromatid separation 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005694 chromosome 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G34680

lmo:lmo0263

mmu:66385

spo:2543597

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.703

排名 1 · TkA07G079200 · TK1151

细胞核0.273

排名 2 · TkA07G079200 · TK1151

细胞膜0.120

排名 3 · TkA07G079200 · TK1151

线粒体0.060

排名 4 · TkA07G079200 · TK1151

内质网0.052

排名 5 · TkA07G079200 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14580LRR_9214-319 aa

PF13855LRR_8220-273 aa

PF12799LRR_4239-273 aa

PF00560LRR_1240-253 aa

PF23952LRR_EndoS246-338 aa

PF23211LRR_LRWD1258-322 aa

PF13855LRR_8262-319 aa

PF00560LRR_1263-281 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G079200	`PF14580`	LRR_9	214	319	1.2e-07	32.2
TkA07G079200	`PF13855`	LRR_8	220	273	8.8e-10	38.9
TkA07G079200	`PF12799`	LRR_4	239	273	1.8e-20	73.2
TkA07G079200	`PF00560`	LRR_1	240	253	0.0024	18.3
TkA07G079200	`PF23952`	LRR_EndoS	246	338	0.11	13.5
TkA07G079200	`PF23211`	LRR_LRWD1	258	322	0.0039	17.6
TkA07G079200	`PF13855`	LRR_8	262	319	8.8e-10	38.9
TkA07G079200	`PF00560`	LRR_1	263	281	0.0024	18.3
TkA07G079200	`PF13516`	LRR_6	264	278	0.0068	17.1
TkA07G079200	`PF13516`	LRR_6	284	298	0.0068	17.1
TkA07G079200	`PF12799`	LRR_4	285	323	1.8e-20	73.2
TkA07G079200	`PF00560`	LRR_1	286	299	0.0024	18.3
TkA07G079200	`PF13516`	LRR_6	307	319	0.0068	17.1
TkA07G079200	`PF00560`	LRR_1	308	321	0.0024	18.3
TkA07G079200	`PF13855`	LRR_8	327	362	8.8e-10	38.9
TkA07G079200	`PF12799`	LRR_4	328	362	1.8e-20	73.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`F4IIU4`	拟南芥	sp\|F4IIU4\|AIR9_ARATH 187-kDa microtubule-associated protein AIR9	63.700%	Swiss-Prot	高置信

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