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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G078960
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 20594861-20601698 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

5049 bp · TkA07G078960|TK1151|cDNA

TTTTCTATGATATAGTAGGAAACGGGTTTCCACTTCATCGTATGCTAAACCAGAAGAAAAACATCAACATATAATAAAAATTAAACCCCCAAAAAAACCTTGTTGGGTGTTCTCCAGCTATTCTTTCCAAATCCATCGACCACTTCTGTTCAATGGATCTGCCATTCCTGATTCAATCAATTTAAGATCTTAAATCAGGTGGTGGGTTCAATTCAATCAGTCAACTTGAACTATTGGAGGAGTTGAAAGATTCAAAGGGT...

CDS

下载 CDS FASTA

4878 bp · TkA07G078960|TK1151|CDS

ATGAAGATACCTTGTTGCACGGTTTGTCAGACAAGGTACAACGAAGAAGATAGGTGTCCGTTGTTACTCGAGTGCGGCCATGGATTCTGTAAAGAGTGTCTCTCTCGTATGTTTTCATCAGCGTCATCAGACACTACTCTTTCCTGTCCACGATGTCGCCAAGTCTCCGTTGTCGGTAACTCCGTCCACGCGCTACGGAAGAACTACGCTATCTTGGGGCTAATCTCTTCTGCTTCCAATAGCGATTTCACCGACGAAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1625 aa · TkA07G078960|TK1151|PROTEIN

MKIPCCTVCQTRYNEEDRCPLLLECGHGFCKECLSRMFSSASSDTTLSCPRCRQVSVVGNSVHALRKNYAILGLISSASNSDFTDEDEDDEDDGLVVVVDRDRRSCGSNASSSNGLIELGSHQDLRMVRRIGEEPGRKGSGVEMWSAVLSGKSGRCRHRVAVKKLVVIGEDTDLVWVQNQLDDLRLKSMWCRNVCKFHGATKVDDCLALIMDKCNGSVETEMQRNEGRLTLEQILRYGADIARGVAELHAAGVVCMNLKP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G078960
TK1151 IDTkA07G078960
OH-1004 IDLXL04_027616
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 98.545
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G078960
位置Chr07:20594861-20601698 (+)
描述Similar to KEG: E3 ubiquitin-protein ligase KEG
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g13530 介导 E2 依赖性蛋白质泛素化。
Powdery mildew resistance conferred by loss of the ENHANCED DISEASE RESISTANCE1 protein kinase is suppressed by a missense mutation in KEEP ON GOING, a regulator of abscisic acid signaling.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.127605
At3g23000 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。
CIPK7 is involved in cold response by interacting with CBL1 in Arabidopsis thaliana.2011 · DOI: 10.1016/j.plantsci.2011.03.011
At5g18700 必需蛋白，在有丝分裂过程中无论是体细胞还是合胞体，细胞板扩展时调节纺锤体微管组织。 暂无已核实直接文献
At4g08500 MEKK1、MKK1/MKK2 和 MPK4 在信号通路中发挥作用，调节响应生物和非生物胁迫的基因表达，并通过负向调节先天免疫在病原体防御中发挥重要作用。
MAP kinase signalling cascade in Arabidopsis innate immunity.2002 · DOI: 10.1038/415977a
The MKK2 pathway mediates cold and salt stress signaling in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1016/j.molcel.2004.06.023
Phosphorylation of Arabidopsis thaliana MEKK1 via Ca(2+) signaling as a part of the cold stress response.2013 · DOI: 10.1007/s10265-013-0576-0

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027616 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009704 de-etiolation 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009788 negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010564 regulation of cell cycle process 生物过程
GO:0016197 endosomal transport 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0032940 secretion by cell 生物过程
GO:0045036 protein targeting to chloroplast 生物过程
GO:0045324 late endosome to vacuole transport 生物过程
GO:0048589 developmental growth 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G32250
ath:AT5G13530
mmu:244859
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.497
排名 1 · TkA07G078960 · TK1151
细胞核0.401
排名 2 · TkA07G078960 · TK1151
细胞膜0.199
排名 3 · TkA07G078960 · TK1151
内质网0.056
排名 4 · TkA07G078960 · TK1151
高尔基体0.045
排名 5 · TkA07G078960 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13639zf-RING_25-53 aa
PF13920zf-C3HC4_35-54 aa
PF12678zf-rbx15-53 aa
PF13445zf-RING_UBOX6-50 aa
PF00097zf-C3HC46-52 aa
PF14634zf-RING_56-54 aa
PF13923zf-C3HC4_26-52 aa
PF14570zf-RING_46-54 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G078960PF13639zf-RING_25531.7e-0628.9
TkA07G078960PF13920zf-C3HC4_35540.001618.9
TkA07G078960PF12678zf-rbx15530.03215.2
TkA07G078960PF13445zf-RING_UBOX6501.4e-0628.9
TkA07G078960PF00097zf-C3HC46529.3e-0626.1
TkA07G078960PF14634zf-RING_56541.3e-0525.7
TkA07G078960PF13923zf-C3HC4_26520.1312.8
TkA07G078960PF14570zf-RING_46540.1912.2
TkA07G078960PF24921RING_XB3-XBAT316541.110.0
TkA07G078960PF23412zf_RING_Vps86521.89.2
TkA07G078960PF17123zf-RING_116342.08.9
TkA07G078960PF14447Prok-RING_46542.19.0
TkA07G078960PF15227zf-C3HC4_420520.00517.6
TkA07G078960PF25080zf_RING-like24524.38.1
TkA07G078960PF09788Tmemb_55A29780.007816.1
TkA07G078960PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1434141e-2384.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FY48拟南芥sp|Q9FY48|KEG_ARATH E3 ubiquitin-protein ligase KEG71.500%Swiss-Prot高置信
Q9XIW0拟南芥sp|Q9XIW0|CIPK7_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 727.400%Swiss-Prot低置信
F4JY37拟南芥sp|F4JY37|RUK_ARATH Serine/threonine-protein kinase RUNKEL26.300%Swiss-Prot低置信
Q39008拟南芥sp|Q39008|M3K1_ARATH Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 124.800%Swiss-Prot低置信

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