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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G077500
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 20157672-20166118 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

5796 bp · TkA07G077500|TK1151|cDNA

TGCAGGTTACCTTTTGAGCATCGTTGTAATTATTAACTTTTGTAATCAAAATCAAAATCTAAATCTAAATCTAAATCTAAATCTAAATCAAAGATGGAAACTTTACATCCGATTCCGTTTATGATGAGACAGTACCAGTGGCGTGTAGACCACAAGGGGAAAAAGACGCCCACTTTCGATCTTTTACTGGGTTAAAAAAGTCCCTTTGTCCTTTCTCTCCCGCTTCTCAGGTCCATAAATCATTCAACCTTCCATAATAT...

CDS

下载 CDS FASTA

4851 bp · TkA07G077500|TK1151|CDS

ATGGGGTTTAAGCCCTTAGTTTCATACTGTCGTCCGGTGGAAAATGGTGTATGGGCGACGGCGGTGGAAAACGAATTTGGGCCTTACACACCTTGTGCAACCGATTCTCTGGTTACTGGCATTTCCCATTTGGTTCTCCTGGGAATTTGCATATGCCGATTATGGGTGACAACGAAGAATCTCAAAGTGCAGAGGTTCAAATTGAGGTCCAAAATCTACAATTACTTCTTGGGATTATTGGCTCTCTTCTGTACTGCTGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1616 aa · TkA07G077500|TK1151|PROTEIN

MGFKPLVSYCRPVENGVWATAVENEFGPYTPCATDSLVTGISHLVLLGICICRLWVTTKNLKVQRFKLRSKIYNYFLGLLALFCTAEPLIRLIMGISVFNVDGETGLAPYEIVTLVIKALAWCSVLIVLGIETVIYVCEIRWFMRFGVIYALLGDAVLLNLVLSVSQYYSRDILYIYSSEVGIQVVFGICLIVYLPTLDPYPGYSPIRVDPLDDGEYEELPSREEICPERHTNIISSIFFSWMNPLMLLGYKRPLTEKDI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G077500
TK1151 IDTkA07G077500
OH-1004 IDLXL04_027600
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 99.692
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G077500
位置Chr07:20157672-20166118 (+)
描述Similar to ABCC2: ABC transporter C family member 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g34660 谷胱甘肽 S-结合物泵。
Enhanced multispecificity of arabidopsis vacuolar multidrug resistance-associated protein-type ATP-binding cassette transporter, AtMRP2.2001 · DOI: 10.1074/jbc.m009690200
AtMRP2, an Arabidopsis ATP binding cassette transporter able to transport glutathione S-conjugates and chlorophyll catabolites: functional comparisons with Atmrp1.1998 · DOI: 10.1105/tpc.10.2.267
At1g30400 谷胱甘肽 S-结合物泵。
AtMRP1 gene of Arabidopsis encodes a glutathione S-conjugate pump: isolation and functional definition of a plant ATP-binding cassette transporter gene.1997 · DOI: 10.1073/pnas.94.15.8243
At1g30410 谷胱甘肽 S-结合物泵。 暂无已核实直接文献
At1g30420 谷胱甘肽 S-结合物泵。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027600 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0015700 arsenite transport 生物过程
GO:0015721 bile acid and bile salt transport 生物过程
GO:0046685 response to arsenic-containing substance 生物过程
GO:0055085 transmembrane transport 生物过程
GO:0071716 leukotriene transport 生物过程
GO:1902418 (+)-abscisic acid D-glucopyranosyl ester transmembrane transport 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005774 vacuolar membrane 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G30400
ath:AT1G30410
ath:AT1G30420
ath:AT2G34660
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.448
排名 1 · TkA07G077500 · TK1151
溶酶体／液泡0.237
排名 2 · TkA07G077500 · TK1151
细胞质0.151
排名 3 · TkA07G077500 · TK1151
内质网0.145
排名 4 · TkA07G077500 · TK1151
高尔基体0.119
排名 5 · TkA07G077500 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00664ABC_membrane307-571 aa
PF13481AAA_25622-663 aa
PF00005ABC_tran633-768 aa
PF09818ABC_ATPase639-663 aa
PF13555AAA_29644-664 aa
PF13191AAA_16644-679 aa
PF03193RsgA_GTPase644-667 aa
PF13476AAA_23644-663 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G077500PF00664ABC_membrane3075711.1e-63216.2
TkA07G077500PF13481AAA_256226630.1512.3
TkA07G077500PF00005ABC_tran6337683.7e-44151.4
TkA07G077500PF09818ABC_ATPase6396630.1611.7
TkA07G077500PF13555AAA_296446640.0003321.1
TkA07G077500PF13191AAA_166446790.0003421.9
TkA07G077500PF03193RsgA_GTPase6446670.001419.2
TkA07G077500PF13476AAA_236446630.02216.2
TkA07G077500PF20703nSTAND16446630.03514.5
TkA07G077500PF01935DUF876456676.1e-0523.9
TkA07G077500PF13401AAA_226456760.008717.1
TkA07G077500PF19993DO-GTPase26456620.08913.2
TkA07G077500PF13304AAA_216456630.2711.8
TkA07G077500PF01926MMR_HSR16466739.4e-0729.7
TkA07G077500PF00350Dynamin_N6466678.5e-0523.4
TkA07G077500PF10412TrwB_AAD_bind6466780.002417.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q42093拟南芥sp|Q42093|AB2C_ARATH ABC transporter C family member 275.500%Swiss-Prot高置信
Q9C8G9拟南芥sp|Q9C8G9|AB1C_ARATH ABC transporter C family member 173.400%Swiss-Prot高置信
Q9C8H0拟南芥sp|Q9C8H0|AB12C_ARATH ABC transporter C family member 1269.300%Swiss-Prot高置信
Q9C8H1拟南芥sp|Q9C8H1|AB11C_ARATH ABC transporter C family member 1166.600%Swiss-Prot高置信

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