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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G074340
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 19476883-19481716 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2812 bp · TkA07G074340|TK1151|cDNA

AAAACACATTAAAAATTCTAAACCTTATAAATCCAAATAATTCGAAATTTAAATCCATTAACAACATCATCCATATTCTAAAATATAAATCCTACGATCCAAACACATCCCAATTTTGAGCGGGATGTTGAGAATCCGAAGAACCCTAACCTAAGTCAGTGAATAGAATAGCTGCTGCATCTCCTTCTCGCTTCTCCACTCCCGGCGGATCGCCGATAAGTCTCCTTAGTCCCTACCGCACAGCATCACCTTGGGGCATT...

CDS

下载 CDS FASTA

2034 bp · TkA07G074340|TK1151|CDS

ATGGAAAACACTTTCTCTGCTTTTGGTTCATCTACATCCTCTACTCCAACATTCGGAGCATCATCATCATCATCATCATCAACCCCTTCATTTGCATTTACATTTGCATCTTCTTCAACTTCTACACCAGCTTCCTCTGCTCCAACAACCACTTTTGGTTTTGGATCTTCCTCTGTTGCTGCAACCGGCTCTATGTTTGGTGCATCTTCATTTGGTGGATCTGGATTGTTTGGATCAAGCTCTAGTACCACCACCACCAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

677 aa · TkA07G074340|TK1151|PROTEIN

MENTFSAFGSSTSSTPTFGASSSSSSSTPSFAFTFASSSTSTPASSAPTTTFGFGSSSVAATGSMFGASSFGGSGLFGSSSSTTTTTTAATTAATTSLFGSTSAFGTSNIFGASSTAASSSTTTTAVSSPFSSGLFGSASSTPNFSSTSFGASPNLFGSSSSSSAAPSFSNLTGTPSSSSISISSSVTTPPASSSAPGFSPTTFGTNNLFGGSATPASASSSTTTTSNIFGSSSSTLFGASPSITSSSSPAPSFSSFGVP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G074340
TK1151 IDTkA07G074340
OH-1004 IDLXL04_027582
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)78.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G074340
位置Chr07:19476883-19481716 (-)
描述Similar to NUP62: Nuclear pore complex protein NUP62
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g45000 核孔复合体蛋白NUP62。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027582 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000054 ribosomal subunit export from nucleus 生物过程
GO:0006405 RNA export from nucleus 生物过程
GO:0006606 protein import into nucleus 生物过程
GO:0006913 nucleocytoplasmic transport 生物过程
GO:0007080 mitotic metaphase chromosome alignment 生物过程
GO:0007098 centrosome cycle 生物过程
GO:0007100 mitotic centrosome separation 生物过程
GO:0007166 cell surface receptor signaling pathway 生物过程
GO:0007283 spermatogenesis 生物过程
GO:0008285 negative regulation of cell population proliferation 生物过程
GO:0009966 regulation of signal transduction 生物过程
GO:0010930 negative regulation of auxin mediated signaling pathway 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G45000
hsa:23636
mmu:18226
rno:65274
spo:2542668
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.858
排名 1 · TkA07G074340 · TK1151
细胞质0.248
排名 2 · TkA07G074340 · TK1151
细胞膜0.021
排名 3 · TkA07G074340 · TK1151
内质网0.021
排名 4 · TkA07G074340 · TK1151
高尔基体0.015
排名 5 · TkA07G074340 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08069Ribosomal_S13_N435-466 aa
PF03961FapA474-570 aa
PF05064Nsp1_C476-573 aa
PF07889DUF1664508-565 aa
PF04136COG3_N524-607 aa
PF01920Prefoldin_2529-617 aa
PF04108ATG17_like533-661 aa
PF19962EAD9538-561 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G074340PF08069Ribosomal_S13_N4354660.08313.7
TkA07G074340PF03961FapA4745700.07313.4
TkA07G074340PF05064Nsp1_C4765738e-2174.7
TkA07G074340PF07889DUF16645085650.3811.5
TkA07G074340PF04136COG3_N5246071.29.8
TkA07G074340PF01920Prefoldin_25296170.6810.6
TkA07G074340PF04108ATG17_like5336610.04414.0
TkA07G074340PF19962EAD95385611.29.7
TkA07G074340PF07889DUF16645766600.3811.5
TkA07G074340PF19962EAD95846101.29.7
TkA07G074340PF03961FapA5896600.07313.4
TkA07G074340PF21623HK_sensor_dom_bact5916200.03613.9
TkA07G074340PF05064Nsp1_C5986138e-2174.7
TkA07G074340PF19962EAD96296421.29.7
TkA07G074340PF04136COG3_N6326611.29.8
TkA07G074340PF08069Ribosomal_S13_N6436730.08313.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8L7F7拟南芥sp|Q8L7F7|NUP62_ARATH Nuclear pore complex protein NUP6276.100%Swiss-Prot低置信

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