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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G068280
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 17919535-17921542 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

780 bp · TkA07G068280|TK1151|cDNA

ATGGATTTTCAGGCCAGCGTAAGCCAAAATACAATTCCATCTGAGATTCCTTCTAGTGATCATGTCCCAATTGGAGTAAGTTCACATTCTCAAGAGTCATTACCTACACAAGAATCTGATGAAAATAGAAGATTACAAGCAAAGATAGCAAGAGCAAATAGGAAAATAGCATTGCAAATGAGTGCTGTTAGGAACACTAATCAATCAACAACATCATCTAGCAGAACTTCAAGAAAAACAAGTAAGAAAAGATCTTTAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

780 bp · TkA07G068280|TK1151|CDS

ATGGATTTTCAGGCCAGCGTAAGCCAAAATACAATTCCATCTGAGATTCCTTCTAGTGATCATGTCCCAATTGGAGTAAGTTCACATTCTCAAGAGTCATTACCTACACAAGAATCTGATGAAAATAGAAGATTACAAGCAAAGATAGCAAGAGCAAATAGGAAAATAGCATTGCAAATGAGTGCTGTTAGGAACACTAATCAATCAACAACATCATCTAGCAGAACTTCAAGAAAAACAAGTAAGAAAAGATCTTTAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

259 aa · TkA07G068280|TK1151|PROTEIN

MDFQASVSQNTIPSEIPSSDHVPIGVSSHSQESLPTQESDENRRLQAKIARANRKIALQMSAVRNTNQSTTSSSRTSRKTSKKRSLERNKDEDHNIFYTPDNMKLKVVVQKLLTSSDVGDQGRILLPKKEVEENLPGLATKEGVLIVMKEVFSYTEWRMKFRYWANHKGNIYLFDQCDDFIQKNLLEAGDQLNLYQDEQKNLYFTIKKKEIHTKEACDNYISERTEEEDYSLRILMEELKHKDEEEPITLTSLYNTCGS

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G068280
TK1151 IDTkA07G068280
OH-1004 IDLXL04_027502
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G068280
位置Chr07:17919535-17921542 (-)
描述Similar to LEC2: B3 domain-containing transcription factor LEC2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g28300 在胚胎发育中起核心作用的转录调控因子。
LEAFY COTYLEDON2 encodes a B3 domain transcription factor that induces embryo development.2001 · DOI: 10.1073/pnas.201413498
Arabidopsis LEAFY COTYLEDON2 induces maturation traits and auxin activity: Implications for somatic embryogenesis.2008 · DOI: 10.1073/pnas.0712364105
At3g24650 参与种子发育过程中脱落酸调节的基因表达。
A pivotal role of the basic leucine zipper transcription factor bZIP53 in the regulation of Arabidopsis seed maturation gene expression based on heterodimerization and protein complex formation.2009 · DOI: 10.1105/tpc.108.062968
ABI3 controls embryo degreening through Mendel's I locus.2013 · DOI: 10.1073/pnas.1308114110

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os08g0101000 参与铁缺乏响应和耐受性的转录调控因子。
The transcription factor IDEF1 regulates the response to and tolerance of iron deficiency in plants.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0707010104
Os04g0676600 可能的转录调控因子，特异性结合大麦铁缺乏可诱导基因IDS2启动子中IDE1元件的DNA序列5'-CATGC-3'。 暂无已核实直接文献
UniProt: Q7XKC4 推测含B3结构域蛋白Os04g0676650。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027502 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009657 plastid organization 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0010262 somatic embryogenesis 生物过程
GO:0010344 seed oilbody biogenesis 生物过程
GO:0010431 seed maturation 生物过程
GO:0010601 positive regulation of auxin biosynthetic process 生物过程
GO:0031930 mitochondria-nucleus signaling pathway 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G28300
ath:AT3G24650
dosa:Os01g0911700
dosa:Os08g0101000
zma:542523
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.942
排名 1 · TkA07G068280 · TK1151
细胞质0.147
排名 2 · TkA07G068280 · TK1151
细胞膜0.028
排名 3 · TkA07G068280 · TK1151
内质网0.015
排名 4 · TkA07G068280 · TK1151
线粒体0.013
排名 5 · TkA07G068280 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02362B326-49 aa
PF00937CoV_nucleocap36-124 aa
PF31239At5g26805_C55-82 aa
PF31239At5g26805_C109-205 aa
PF02362B3110-209 aa
PF31239At5g26805_C208-243 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G068280PF02362B326498.7e-1142.4
TkA07G068280PF00937CoV_nucleocap361240.1112.3
TkA07G068280PF31239At5g26805_C55820.004518.2
TkA07G068280PF31239At5g26805_C1092050.004518.2
TkA07G068280PF02362B31102098.7e-1142.4
TkA07G068280PF31239At5g26805_C2082430.004518.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q1PFR7拟南芥sp|Q1PFR7|LEC2_ARATH B3 domain-containing transcription factor LEC246.300%Swiss-Prot低置信
Q01593拟南芥sp|Q01593|ABI3_ARATH B3 domain-containing transcription factor ABI340.900%Swiss-Prot低置信
Q6Z1Z3水稻sp|Q6Z1Z3|IDEF1_ORYSJ B3 domain-containing protein IDEF135.500%Swiss-Prot低置信
Q7XKC5水稻sp|Q7XKC5|IDEFH_ORYSJ B3 domain-containing protein Os04g067660037.800%Swiss-Prot低置信
Q7XKC4水稻sp|Q7XKC4|Y4765_ORYSJ Putative B3 domain-containing protein Os04g067665034.000%Swiss-Prot低置信

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