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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G034940
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 9317990-9321126 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2297 bp · TkA07G034940|TK1151|cDNA

GACATAGTTAACTTTCATTTATAACAACCAATATTTTTCAAAGATTCTGTGAAAGTGGAAATGAAATCCATAGCATCGTTGCTGTTTTTTCTCCAGATAGTCATCAATGGTGTTCTTCTCAGGACAGCTCAATCTGCAGAATATGGCATCTACAAGTGCAGAAACACTGGCAATTTCACAAGCACCACATACCTAAAAGCCCTCGAAACCGCACTCGATTCGCTTCCCGGAAACGTCACAAACAACCGCGAATTCGTAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

2013 bp · TkA07G034940|TK1151|CDS

ATGAAATCCATAGCATCGTTGCTGTTTTTTCTCCAGATAGTCATCAATGGTGTTCTTCTCAGGACAGCTCAATCTGCAGAATATGGCATCTACAAGTGCAGAAACACTGGCAATTTCACAAGCACCACATACCTAAAAGCCCTCGAAACCGCACTCGATTCGCTTCCCGGAAACGTCACAAACAACCGCGAATTCGTAAATTCGACTGCCGGCGAAAACACAGGTACTCAGGTAAATGCCGTCGCGTTGTGCCGCGGCTA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

670 aa · TkA07G034940|TK1151|PROTEIN

MKSIASLLFFLQIVINGVLLRTAQSAEYGIYKCRNTGNFTSTTYLKALETALDSLPGNVTNNREFVNSTAGENTGTQVNAVALCRGYIGWEACRTCVKNSIPLLRRECPNQKEAAAWYSDCMVRYSDRKILGVLDSWTSDNESTTARVANFDEFDTAFRNLTTRLQAEAAGGNSFLKLAVGDVTYGTDSLMIYAMMQCTPDLSKEQCSKCLNSTIVGIHDCCSGKVAGRVFFPNCFLRYANDKFYNDAISTPSPSPSGKN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G034940
TK1151 IDTkA07G034940
OH-1004 IDLXL04_027139
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G034940
位置Chr07:9317990-9321126 (-)
描述Similar to CRK10: Cysteine-rich receptor-like protein kinase 10
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g23180 富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶 10。 暂无已核实直接文献
At4g23280 推测的富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶20。 暂无已核实直接文献
At4g23270 富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶19。 暂无已核实直接文献
At4g11530 富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶 34。 暂无已核实直接文献
At4g23140 富半胱氨酸受体样蛋白激酶 6。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027139 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0012501 programmed cell death 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G05200
ath:AT4G23180
ath:AT4G23190
ath:AT4G23270
ath:AT4G23280
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.895
排名 1 · TkA07G034940 · TK1151
内质网0.071
排名 2 · TkA07G034940 · TK1151
细胞质0.068
排名 3 · TkA07G034940 · TK1151
细胞核0.037
排名 4 · TkA07G034940 · TK1151
溶酶体／液泡0.022
排名 5 · TkA07G034940 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01657Stress-antifung32-127 aa
PF01657Stress-antifung149-241 aa
PF14610Psg1258-297 aa
PF103237TM_GPCR_Srv261-304 aa
PF27898C3orf18_N267-300 aa
PF06667PspB269-313 aa
PF00069Pkinase351-618 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr352-619 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G034940PF01657Stress-antifung321274.8e-34117.7
TkA07G034940PF01657Stress-antifung1492414.8e-34117.7
TkA07G034940PF14610Psg12582970.07713.5
TkA07G034940PF103237TM_GPCR_Srv2613040.07713.1
TkA07G034940PF27898C3orf18_N2673000.08313.6
TkA07G034940PF06667PspB2693130.2412.2
TkA07G034940PF00069Pkinase3516188.4e-47160.5
TkA07G034940PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3526192.3e-48165.5
TkA07G034940PF03109ABC13553819.8e-0625.6
TkA07G034940PF03109ABC14154999.8e-0625.6
TkA07G034940PF12330Haspin_kinase4454980.0214.7
TkA07G034940PF01636APH4644960.1612.4
TkA07G034940PF17667Pkinase_fungal4695370.02114.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8GYA4拟南芥sp|Q8GYA4|CRK10_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 1046.100%Swiss-Prot中等置信
O65479拟南芥sp|O65479|CRK20_ARATH Putative cysteine-rich receptor-like protein kinase 2044.700%Swiss-Prot中等置信
Q8GWJ7拟南芥sp|Q8GWJ7|CRK19_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 1944.200%Swiss-Prot中等置信
Q9LDQ3拟南芥sp|Q9LDQ3|CRK34_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 3446.200%Swiss-Prot中等置信
Q9C5S9拟南芥sp|Q9C5S9|CRK6_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 648.200%Swiss-Prot中等置信

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