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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G029270
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 7836172-7838918 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2260 bp · TkA07G029270|TK1151|cDNA

TTAAAACTTAAAACGTTAGGGGCCAATTGTGCAGTAATGCAAAATTTATAAGTACGGGGAAGTGTGGGGGGAAAAGAACCAAGACCGCCGTCGTCGATAACCTAACGAGCAAAAACCCTTTGCCGCCTGCTCTTCACCTTCTCCGACACAGTAATCATGGGGGACGTAGTACAATACAAGCTCGAACGCATGGTCCCTGAGCTCGACGACCTTGAGCGCCGTGGATTGTTTACTCGCCGTGAGATTGCCGAAATCGTCAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1950 bp · TkA07G029270|TK1151|CDS

ATGGGGGACGTAGTACAATACAAGCTCGAACGCATGGTCCCTGAGCTCGACGACCTTGAGCGCCGTGGATTGTTTACTCGCCGTGAGATTGCCGAAATCGTCAAACAACGCCGGAAGTTCGAATTCAGACTCGTACGTCCAAGTCCTTTGAAACCGGATTACTTAGCGTACATCGACTACGAGAAATCTGTGGATGCACTCCGTCTCCTCCGTAAGAAAGCTATGTTGCGTAAGCTCAGTAAGGAGAGTGAAGACGGAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

649 aa · TkA07G029270|TK1151|PROTEIN

MGDVVQYKLERMVPELDDLERRGLFTRREIAEIVKQRRKFEFRLVRPSPLKPDYLAYIDYEKSVDALRLLRKKAMLRKLSKESEDGEGTVRKPKMKQSVSDFSMISRIVDIYRQATNRFKGDIQLWFQYLEFCRQRRNGHMKKVLAQVIRFHPKVPGVWIYAASWEFDHNLNSTAARALMQSGLRSCPTSESLWVEYLRMELTYLNKLSARRSALGEDVAPLVKPHQNPEDKQWRDENKELFMPIEEETKDYQELDLQNE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G029270
TK1151 IDTkA07G029270
OH-1004 IDLXL04_027062
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.076 / OH-1004 43.241
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G029270
位置Chr07:7836172-7838918 (-)
描述Similar to UTP6: U3 small nucleolar RNA-associated protein 6 homolog
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027062 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000447 endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) 生物过程
GO:0000462 maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) 生物过程
GO:0000472 endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) 生物过程
GO:0000480 endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) 生物过程
GO:0030490 maturation of SSU-rRNA 生物过程
GO:0042274 ribosomal small subunit biogenesis 生物过程
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005694 chromosome 细胞组分
GO:0005730 nucleolus 细胞组分
GO:0030686 90S preribosome 细胞组分
GO:0032040 small-subunit processome 细胞组分
GO:0034388 Pwp2p-containing subcomplex of 90S preribosome 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
hsa:55813
mmu:216987
sce:YDR449C
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.856
排名 1 · TkA07G029270 · TK1151
细胞质0.188
排名 2 · TkA07G029270 · TK1151
线粒体0.046
排名 3 · TkA07G029270 · TK1151
细胞膜0.022
排名 4 · TkA07G029270 · TK1151
高尔基体0.012
排名 5 · TkA07G029270 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08640U3_assoc_69-84 aa
PF23240HAT_PRP39_N104-139 aa
PF05843Suf104-198 aa
PF23233HAT_Syf1_CNRKL1_N105-139 aa
PF23241HAT_PRP39_C107-201 aa
PF13428TPR_14108-131 aa
PF24892UTP6_C114-179 aa
PF13428TPR_14125-163 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G029270PF08640U3_assoc_69844e-2588.2
TkA07G029270PF23240HAT_PRP39_N1041391.3e-1971.6
TkA07G029270PF05843Suf1041987.1e-0728.9
TkA07G029270PF23233HAT_Syf1_CNRKL1_N1051394.3e-1350.1
TkA07G029270PF23241HAT_PRP39_C1072014.6e-0730.7
TkA07G029270PF13428TPR_141081311.3e-1144.7
TkA07G029270PF24892UTP6_C1141793.7e-2899.9
TkA07G029270PF13428TPR_141251631.3e-1144.7
TkA07G029270PF29376PRP6_TPR1342159.8e-0831.8
TkA07G029270PF23240HAT_PRP39_N1412071.3e-1971.6
TkA07G029270PF13428TPR_141571991.3e-1144.7
TkA07G029270PF23233HAT_Syf1_CNRKL1_N1592104.3e-1350.1
TkA07G029270PF08640U3_assoc_61902244e-2588.2
TkA07G029270PF24892UTP6_C1912053.7e-2899.9
TkA07G029270PF24892UTP6_C2592823.7e-2899.9
TkA07G029270PF23241HAT_PRP39_C2723064.6e-0730.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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