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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G029170
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 7804985-7807295 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2102 bp · TkA07G029170|TK1151|cDNA

AAGTTTCAAGAAATAAGTATTGGGTATTTGGAAAAGGTACGAATTGGGAAAGAAGTATCGGGTATTTGGGTTGATTTGGCTTTAAAGAAAAACAGGGGCTAACGCTAAGTGTTTATCAGTGATTTTGGTGGAGTTAAGGCTAACATTAACAGAAAAGCAATTGTTTGTTTATACAGTTTATCGTTTTGTTGTACTTGGAATAATAAAATTTGTGGAAATGTGATACAGACCACGATAATTGATCTGAATGACGACTCTCG...

CDS

下载 CDS FASTA

1338 bp · TkA07G029170|TK1151|CDS

ATGCCAAATAAGGTGAACATTGCTTGGAACACTCTAATTGCTGCTCATGCTCGATATGGTAATGTCAAAACCTGTGTCGATTTGTTCAATAAGATGATGATGACTGAATCATGTGATCAAGATCAATGGACATTTAGTGCCCTCATGAATGCTGCAACTGAATCTCAAGAATTTCACATTGGTTGCATGATTCATGGTCTTATCATCAAGAAAGGGTGGAACTCTGCTATTGAGTCAAACAACTCAATTCTTAGTTTCTA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

445 aa · TkA07G029170|TK1151|PROTEIN

MPNKVNIAWNTLIAAHARYGNVKTCVDLFNKMMMTESCDQDQWTFSALMNAATESQEFHIGCMIHGLIIKKGWNSAIESNNSILSFYAHLSSREDVVKIFESIKSPTQVSWNAIIDAQMKIGDTQKALIAFNNSPEKNIISWTSMIAGYVRNGDSEEGIRFFVDMITTTNLLPDDFSLGTVLHACSLMATLGHGKMIHSLAIRHGFNSYAYVGNGLVNMYAKCGDISASSKSFNEIIEKDLVSWNTMLIGYGLHGRGDKA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G029170
TK1151 IDTkA07G029170
OH-1004 IDLXL04_027056
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)96.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 94.382 / OH-1004 60.844
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G029170
位置Chr07:7804985-7807295 (-)
描述Similar to PCMP-E73: Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g36980, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g36980 含五肽重复蛋白At2g36980，线粒体。 暂无已核实直接文献
At3g25970 推定的含五重复肽重复的蛋白At3g25970。 暂无已核实直接文献
At1g17630 推定含五重复肽的蛋白质 At1g17630。 暂无已核实直接文献
At4g13650 含五重复肽基序蛋白 At4g13650。 暂无已核实直接文献
At5g27110 含五重复肽的蛋白质 At5g27110。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027056 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009451 RNA modification 生物过程
GO:0099402 plant organ development 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0003723 RNA binding 分子功能
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G22070
ath:AT2G36980
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.700
排名 1 · TkA07G029170 · TK1151
质体0.140
排名 2 · TkA07G029170 · TK1151
细胞核0.058
排名 3 · TkA07G029170 · TK1151
细胞质0.032
排名 4 · TkA07G029170 · TK1151
细胞膜0.006
排名 5 · TkA07G029170 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13041PPR_27-51 aa
PF01535PPR8-33 aa
PF13812PPR_38-51 aa
PF13428TPR_148-34 aa
PF10602RPN78-55 aa
PF12854PPR_19-32 aa
PF18768RNPP_C9-41 aa
PF17177PPR_long15-94 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G029170PF13041PPR_27512.3e-37127.6
TkA07G029170PF01535PPR8337.6e-38126.8
TkA07G029170PF13812PPR_38515.5e-1246.3
TkA07G029170PF13428TPR_148340.0005421.1
TkA07G029170PF10602RPN78550.1312.7
TkA07G029170PF12854PPR_19328.6e-2277.3
TkA07G029170PF18768RNPP_C9410.06113.5
TkA07G029170PF17177PPR_long15940.0003320.8
TkA07G029170PF23276TPR_24171330.001119.6
TkA07G029170PF29070MSC6_N221273.3e-1143.6
TkA07G029170PF12854PPR_141508.6e-2277.3
TkA07G029170PF01535PPR44537.6e-38126.8
TkA07G029170PF13041PPR_262782.3e-37127.6
TkA07G029170PF06694Plant_NMP1621150.0613.2
TkA07G029170PF18768RNPP_C781030.06113.5
TkA07G029170PF01535PPR811047.6e-38126.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SJK9拟南芥sp|Q9SJK9|PP189_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g36980, mitochondrial46.700%Swiss-Prot中等置信
Q9LU94拟南芥sp|Q9LU94|PP255_ARATH Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At3g2597032.900%Swiss-Prot中等置信
Q9LNP2拟南芥sp|Q9LNP2|PPR47_ARATH Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At1g1763030.700%Swiss-Prot中等置信
Q9SVP7拟南芥sp|Q9SVP7|PP307_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g1365030.200%Swiss-Prot中等置信
O04659拟南芥sp|O04659|PP398_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g2711030.000%Swiss-Prot中等置信

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