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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G026960
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 7277972-7282864 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2605 bp · TkA07G026960|TK1151|cDNA

AAAAATAATAATTTTGAGTTTCTTCGCCGACACCTTCACTCTGTGTTCTTCCTACCTCAGTCCCTTTCTCTCTCTTCATTACTCTGTAAACCAAGCTTCGAATCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTAAATGGCAAAACCCACTTCATTTTCTTCATCACAACCCTTCTGTTACTGCATGTCTTCCTCTAGGTCAAACTCTATTTGATGATCACTGCTTGAAAACATCCGAAAATGGTGACAAATCGGTGCGATCAGTTTCTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

2157 bp · TkA07G026960|TK1151|CDS

ATGGTGACAAATCGGTGCGATCAGTTTCTTCTACTGAAGTTCGTAGCGGTGATCTTCGTTTCCTTGAGTTTTGTTCTCGGCACTACTGATCCCAGCGACGTTCAAGCCTTACAAGTTTTGTACACATCTTTGAACAATGCTGCACAGCTAACAAATTGGAAAGGCAATACTGGTGGTGGTGGTGGTGACCCATGTGGTGAGTCATGGAAAGGGGTCACCTGTGAGGGTAGTTCTGTAATTTCCATTCAACTGCCTGGTTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

718 aa · TkA07G026960|TK1151|PROTEIN

MVTNRCDQFLLLKFVAVIFVSLSFVLGTTDPSDVQALQVLYTSLNNAAQLTNWKGNTGGGGGDPCGESWKGVTCEGSSVISIQLPGLGLDGTLGYMLSGFTSLKTLDVSGNNIHDALPYQLPPNLTTLNLANNNLTGNLPYSIAMMFNLNYMNLSRNVLTQNIGDIFNNLTSLATLDLSNNNLTGDLPISLTSLSNISTFHVQNNQLTGSLNALSGLPLTDVNIANNHFNGWIPRELLSVPSFIYAGNSFDNGPAPPPPP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G026960
TK1151 IDTkA07G026960
OH-1004 IDLXL04_027036
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G026960
位置Chr07:7277972-7282864 (-)
描述Similar to SRF8: Protein STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 8
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g22130 STRUBBELIG-受体家族 8 蛋白。 暂无已核实直接文献
At3g14350 蛋白质 STRUBBELIG-受体家族 7。 暂无已核实直接文献
At1g53730 蛋白 STRUBBELIG-受体家族 6。 暂无已核实直接文献
At1g78980 STRUBBELIG-受体家族 5 蛋白。 暂无已核实直接文献
At2g20850 对于表皮图案不是必需的，并且与 STRUBBELIG 无关。
The role of the SCRAMBLED receptor-like kinase in patterning the Arabidopsis root epidermis.2007 · DOI: 10.1016/j.ydbio.2006.09.009
Molecular characterisation of the STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY of genes encoding putative leucine-rich repeat receptor-like kinases in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1186/1471-2229-7-16

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027036 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G53730
ath:AT1G78980
ath:AT2G20850
ath:AT3G14350
ath:AT4G22130
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.873
排名 1 · TkA07G026960 · TK1151
细胞质0.073
排名 2 · TkA07G026960 · TK1151
内质网0.071
排名 3 · TkA07G026960 · TK1151
细胞核0.055
排名 4 · TkA07G026960 · TK1151
溶酶体／液泡0.023
排名 5 · TkA07G026960 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_231-74 aa
PF12799LRR_435-46 aa
PF25184YxzE54-66 aa
PF23952LRR_EndoS82-111 aa
PF13855LRR_896-113 aa
PF25013LRR_Zer-196-186 aa
PF12799LRR_497-113 aa
PF13516LRR_6101-115 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G026960PF08263LRRNT_231743.3e-0937.6
TkA07G026960PF12799LRR_435463.4e-0627.8
TkA07G026960PF25184YxzE54660.06515.0
TkA07G026960PF23952LRR_EndoS821111.310.0
TkA07G026960PF13855LRR_8961131.9e-1041.0
TkA07G026960PF25013LRR_Zer-1961863.6e-0524.7
TkA07G026960PF12799LRR_4971133.4e-0627.8
TkA07G026960PF13516LRR_61011150.1912.6
TkA07G026960PF13855LRR_81021591.9e-1041.0
TkA07G026960PF00560LRR_11021198.3e-1037.6
TkA07G026960PF13855LRR_81231831.9e-1041.0
TkA07G026960PF12799LRR_41231393.4e-0627.8
TkA07G026960PF13516LRR_61231370.1912.6
TkA07G026960PF00560LRR_11241448.3e-1037.6
TkA07G026960PF23598LRR_141252216.2e-0522.6
TkA07G026960PF23952LRR_EndoS1401811.310.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q6R2J8拟南芥sp|Q6R2J8|SRF8_ARATH Protein STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 865.100%Swiss-Prot高置信
Q9LUL4拟南芥sp|Q9LUL4|SRF7_ARATH Protein STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 750.200%Swiss-Prot高置信
Q9C8M9拟南芥sp|Q9C8M9|SRF6_ARATH Protein STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 650.300%Swiss-Prot高置信
Q6R2K1拟南芥sp|Q6R2K1|SRF5_ARATH Protein STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 544.100%Swiss-Prot中等置信
Q06BH3拟南芥sp|Q06BH3|SRF1_ARATH Protein STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 141.500%Swiss-Prot中等置信

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