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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA07G026940
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 7267515-7272188 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

2480 bp · TkA07G026940|TK1151|cDNA

CTTTGCATTACTTACCGATAGGAACCCAAAGCTCTTTCATTGTATTAACAATGGGAGTTTCTTGGCAATTTGGATTTGTTATTCTATTTTTGCTTTGTAACATTTGTGTCGCAGAAGAACGTAATATATACATGGTGATGGTAGAAGGCGATCCACCCGTTGCGTTTTTTCAAGATAGCAAAGTGTCTCGTCAGTCTGGCGAAAAAATTGACTTTGATAGTGAAGTATTAAAGGCTCACGCAAAACACCTGGAAGACTCT...

2430 bp · TkA07G026940|TK1151|CDS

ATGGGAGTTTCTTGGCAATTTGGATTTGTTATTCTATTTTTGCTTTGTAACATTTGTGTCGCAGAAGAACGTAATATATACATGGTGATGGTAGAAGGCGATCCACCCGTTGCGTTTTTTCAAGATAGCAAAGTGTCTCGTCAGTCTGGCGAAAAAATTGACTTTGATAGTGAAGTATTAAAGGCTCACGCAAAACACCTGGAAGACTCTCATGATCATCTTCTCCAATCCACATTAGACGAAGGAGCTTACACCAAGCT...

810 aa · TkA07G026940|TK1151|PROTEIN

MGVSWQFGFVILFLLCNICVAEERNIYMVMVEGDPPVAFFQDSKVSRQSGEKIDFDSEVLKAHAKHLEDSHDHLLQSTLDEGAYTKLYSYKHLVNGFSVHTTPSQAKKLKKAPGVKLIEKDTGVKKMTTHTPNFLGLPQGVWTTEGGDSNAGEGVLIGFVDSGINPFHPSFAYDPIDGRNPNNQRKFPEVCDVGPHFPKSSCNGKIVSARFFAAGVQASGKFNATTDILSPFDSDGHGSHTASTAAGNYGVPVVVQGSYY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G026940
TK1151 IDTkA07G026940
OH-1004 IDLXL04_027035
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 98.901
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G026940
位置Chr07:7267515-7272188 (+)
描述Similar to SBT2.4: Subtilisin-like protease SBT2.4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g62340 胚胎和幼年植物表皮表面形成所需的丝氨酸蛋白酶。
At2g19170 类丝氨酸蛋白酶 SBT2.5。 暂无已核实直接文献
At4g30020 类枯草杆菌蛋白酶 SBT2.6。 暂无已核实直接文献
At5g44530 类胰蛋白酶样蛋白酶 SBT2.3。 暂无已核实直接文献
At4g20430 类羧肽酶样蛋白酶SBT2.2。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_027035 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006508 proteolysis 生物过程
GO:0090558 plant epidermis development 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004252 serine-type endopeptidase activity 分子功能
GO:0008236 serine-type peptidase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G62340
ath:AT2G19170
ath:AT4G20430
ath:AT4G30020
ath:AT5G44530
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞外0.613
排名 1 · TkA07G026940 · TK1151
溶酶体/液泡0.157
排名 2 · TkA07G026940 · TK1151
细胞质0.085
排名 3 · TkA07G026940 · TK1151
内质网0.068
排名 4 · TkA07G026940 · TK1151
细胞膜0.051
排名 5 · TkA07G026940 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05922Inhibitor_I960-125 aa
PF21864MORF_dom80-126 aa
PF00082Peptidase_S8152-640 aa
PF17766fn3_6720-810 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G026940PF05922Inhibitor_I9601252e-1351.6
TkA07G026940PF21864MORF_dom801260.05614.0
TkA07G026940PF00082Peptidase_S81526405.5e-44151.3
TkA07G026940PF17766fn3_67208105.6e-1762.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4HYR6拟南芥sp|F4HYR6|SBT24_ARATH Subtilisin-like protease SBT2.455.800%Swiss-Prot高置信
O64481拟南芥sp|O64481|SBT25_ARATH Subtilisin-like protease SBT2.545.700%Swiss-Prot中等置信
Q9SZV5拟南芥sp|Q9SZV5|SBT26_ARATH Subtilisin-like protease SBT2.645.500%Swiss-Prot中等置信
Q9FI12拟南芥sp|Q9FI12|SBT23_ARATH Subtilisin-like protease SBT2.343.200%Swiss-Prot中等置信
Q9SUN6拟南芥sp|Q9SUN6|SBT22_ARATH Subtilisin-like protease SBT2.243.700%Swiss-Prot中等置信

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