TkA07G026710 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G026710

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 7198038-7201563 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2186 bp · TkA07G026710|TK1151|cDNA

TTTTGGTCCATCAATGGGATGATGAAGCCCACACTAAAGATCTTCAAGTCTAGAAATGGCAATTACTCACTTGCTTTCTTGCATGCCAATATGCCATGCCATTGTTGTTCTTGAGCTGCAAGTCTGCAACAAGTAACTTCGTATGATTAATGATTTACCCCCTCAAAACCTCTGATCACTCACGGAATCGAGGAAAATCGCCACGTTTTCATGGCGTCAGTTCGTCGCCTTGCTCGGACAATTCAGACTTGCCGTACGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1722 bp · TkA07G026710|TK1151|CDS

ATGGCGTCAGTTCGTCGCCTTGCTCGGACAATTCAGACTTGCCGTACGATCGCATTTCGTAAAACCCTAACCCCGTCGTTTCAACCTCCGCGCCACTTCTCCCACCGTACTTTCAAGCAGGACAGCTACTCCCACCATGGTAGATCTTCGAGGTCAAAAAATGCTTTTGGATTTGATTATCATCCTGCAATTCTAGCTGGGATATTCGGATTTAGCGTAACAAACATAGCCTATGCGGATGCACCTGAGTCTAAACCACC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

573 aa · TkA07G026710|TK1151|PROTEIN

MASVRRLARTIQTCRTIAFRKTLTPSFQPPRHFSHRTFKQDSYSHHGRSSRSKNAFGFDYHPAILAGIFGFSVTNIAYADAPESKPPLPPEPPSSHINMEAIAKKERTRLEELLKTKGMPYGSYPRFTVAVKGKKITIKFQIPPTCEISLLISNIVANLGVKVEERATGSDMNLRAWDSGVAWQLTLTRPNPNPNDGDLCILMFRSLISSDKPEMEFIKEGGFTNEELDALVSVLKLAGVGPTRGMDRRGDSSTRNPSTM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G026710`
TK1151 ID	TkA07G026710
OH-1004 ID	LXL04_027031
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.300
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA07G026710`
位置	Chr07:7198038-7201563 (+)
描述	Similar to MJ1156: Cell division cycle protein 48 homolog MJ1156 (Methanocaldococcus jannaschii (strain ATCC 43067 / DSM 2661 / JAL-1 / JCM 10045 / NBRC 100440)
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_027031` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0010498 proteasomal protein catabolic process 生物过程 GO:0043335 protein unfolding 生物过程 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0022623 proteasome-activating nucleotidase complex 细胞组分 GO:0005524 ATP binding 分子功能 GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用	mja:MJ_1156 mka:MK0878 mmp:MMP1647 mmz:MmarC7_0920 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.925

排名 1 · TkA07G026710 · TK1151

细胞质0.086

排名 2 · TkA07G026710 · TK1151

细胞核0.069

排名 3 · TkA07G026710 · TK1151

细胞膜0.033

排名 4 · TkA07G026710 · TK1151

质体0.033

排名 5 · TkA07G026710 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13401AAA_22134-173 aa

PF05673DUF815319-447 aa

PF06414Zeta_toxin323-358 aa

PF13191AAA_16331-440 aa

PF13086AAA_11333-359 aa

PF20720nSTAND3334-361 aa

PF00158Sigma54_activat334-410 aa

PF12775AAA_7334-359 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G026710	`PF13401`	AAA_22	134	173	0.0011	20.0
TkA07G026710	`PF05673`	DUF815	319	447	0.00035	20.5
TkA07G026710	`PF06414`	Zeta_toxin	323	358	0.11	12.6
TkA07G026710	`PF13191`	AAA_16	331	440	0.00053	21.3
TkA07G026710	`PF13086`	AAA_11	333	359	0.049	14.1
TkA07G026710	`PF20720`	nSTAND3	334	361	0.019	15.4
TkA07G026710	`PF00158`	Sigma54_activat	334	410	0.093	13.1
TkA07G026710	`PF12775`	AAA_7	334	359	0.28	11.4
TkA07G026710	`PF06745`	ATPase	335	441	0.19	11.8
TkA07G026710	`PF13401`	AAA_22	336	369	0.0011	20.0
TkA07G026710	`PF13173`	AAA_14	336	409	0.0019	18.9
TkA07G026710	`PF14532`	Sigma54_activ_2	336	409	0.091	13.8
TkA07G026710	`PF05729`	NACHT	336	359	0.12	12.9
TkA07G026710	`PF06068`	TIP49	336	368	0.14	12.0
TkA07G026710	`PF05496`	RuvB_N	337	460	3e-05	24.5
TkA07G026710	`PF00004`	AAA	338	466	3.8e-37	128.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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